Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  89  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26244116--26244341
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1
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0
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0
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0
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1.11
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1.30
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21
2.9
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100
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2
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10
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25
1
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0.92
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2
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2
2
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11
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46
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15
200
29
29
19
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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48
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0
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16
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0
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1.63
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18
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0
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44
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45
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2.1
22
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1.70
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19
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19
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21
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28
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28
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14
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12
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3
18
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19
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0.98
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14
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28
18
28
24
1.98
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34
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2.1
13
100
0
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14
25
14
44
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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2.1
24
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75
14
28
12
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1.79
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1.9
16
93
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58
0
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1.24
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25
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2.1
28
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75
27
29
18
24
1.98
26359419--26359576
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154
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25
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1.98
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50
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1.23
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10.0
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36
1.20
26404246--26404343
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3.1
36
72
16
97
59
0
3
37
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26404699--26404767
27
2.6
27
81
9
86
62
0
1
36
1.04
26404700--26404756
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6.5
8
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16
51
59
0
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1.08
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16
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32
0
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1.58
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0
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0
0
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50
32
32
24
12
1.91
26415555--26415582
2
14.0
2
100
0
56
50
50
0
0
1.00
26416409--26416441
15
2.2
15
94
0
57
27
15
15
42
1.86
26416544--26416587
15
2.8
16
79
6
54
31
15
15
36
1.90
26423458--26423714
78
3.3
77
82
7
261
26
27
21
24
1.99
26423538--26423714
39
4.5
39
90
1
264
25
27
21
25
1.99
26423526--26423731
39
5.2
39
89
0
250
25
27
21
25
2.00
26428564--26428602
17
2.1
20
86
13
57
25
5
5
64
1.35
26433135--26433469
39
8.5
39
93
2
530
28
29
23
18
1.98
26436982--26437028
22
2.1
22
92
0
76
59
10
4
25
1.49
26444391--26444428
12
3.2
12
85
3
51
15
47
18
18
1.83
26445420--26445506
26
3.5
25
74
13
72
43
4
0
51
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26445489--26445563
19
3.7
20
77
13
64
33
5
0
61
1.19
26445521--26445574
24
2.2
24
90
0
81
35
3
0
61
1.14
26445822--26445876
22
2.7
21
82
17
64
36
0
0
63
0.95
26445821--26445876
24
2.4
25
82
14
75
37
0
0
62
0.95
26445825--26445876
21
2.4
22
81
18
65
34
0
0
65
0.93
26445835--26445879
7
7.0
7
85
10
53
40
0
0
60
0.97
26445823--26445879
13
4.5
13
80
10
64
36
0
0
63
0.95
26449637--26449668
14
2.2
15
94
5
57
40
6
3
50
1.43
26457746--26458533
205
3.8
205
92
2
1262
31
17
20
30
1.95
26460132--26460195
26
2.5
25
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16
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45
3
0
51
1.17
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10
5.8
10
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21
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33
3
0
63
1.10
26460204--26460268
24
2.8
24
88
2
87
33
3
0
63
1.10
26460485--26460566
20
4.1
20
74
16
73
32
1
0
65
1.00
26460494--26460566
22
3.3
22
83
11
78
35
1
0
63
1.04
26460495--26460567
20
3.3
23
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14
84
36
1
0
61
1.05
26460515--26460574
7
9.1
7
78
14
56
40
0
0
60
0.97
26460531--26460599
21
3.5
20
76
9
61
43
1
0
55
1.08
26465828--26465868
21
2.0
21
100
0
82
21
4
24
48
1.69
26468760--26468809
15
3.1
16
77
11
57
48
6
0
46
1.27
26469331--26469374
20
2.2
20
84
8
54
59
4
4
31
1.38
26470007--26470065
29
2.0
30
90
3
93
23
6
13
55
1.62
26472076--26472253
75
2.4
75
80
3
189
25
21
23
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26473144--26473204
31
2.0
31
83
0
77
18
36
29
16
1.92
26475484--26475587
6
17.8
6
94
1
124
64
1
0
33
1.05
26478460--26478516
20
2.8
20
79
10
62
43
15
10
29
1.80
26478729--26478792
22
2.9
22
83
9
85
32
21
26
18
1.97
26478785--26478841
23
2.3
26
85
8
75
38
17
15
28
1.91
26479667--26479691
8
3.1
8
100
0
50
48
24
0
28
1.52
26483621--26483777
42
3.7
43
75
7
133
27
26
19
26
1.99
26483620--26483778
84
1.9
85
82
3
196
28
25
19
26
1.99
26493690--26493736
23
2.0
23
100
0
94
17
27
25
29
1.97
26494741--26494853
20
5.7
20
74
10
79
39
17
8
33
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295