Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  41  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12030144--12030169
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13
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0
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1
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2.9
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9
35
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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12068673--12068709
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0
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78
0.87
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9
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62
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1.9
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1.94
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123
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360
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20
14
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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10
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66
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17
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17
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1.94
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18
17
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1.94
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123
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14
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59
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0
70
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12105855--12105897
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2.3
19
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0
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0
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3
21
30
1.69
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1.70
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100
0
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29
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3
54.7
3
68
12
52
53
3
9
33
1.49
12119295--12119332
16
2.4
16
86
8
51
63
0
7
28
1.23
12120040--12120102
26
2.5
25
89
5
92
42
23
3
30
1.70
12120332--12120378
12
3.6
13
82
8
51
0
6
6
87
0.68
12120336--12120378
7
6.4
7
89
5
54
0
4
6
88
0.63
12120874--12120911
17
2.2
17
90
9
60
34
2
18
44
1.64
12125227--12125448
62
3.6
62
80
0
255
22
24
25
27
2.00
12125183--12125449
124
2.1
125
82
2
322
22
24
25
27
2.00
12127090--12127155
32
2.1
32
100
0
132
45
12
9
33
1.73
12127486--12127518
13
2.5
13
95
0
57
18
30
30
21
1.97
12130227--12130295
34
2.0
34
100
0
138
42
11
26
20
1.86
12131644--12131685
17
2.4
18
88
11
70
33
4
21
40
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12133003--12133036
17
2.1
17
88
5
52
44
0
2
52
1.16
12140339--12140365
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
12142450--12142474
13
1.9
13
100
0
50
8
12
8
72
1.29
12142816--12142887
35
2.1
35
89
0
108
43
15
9
31
1.79
12145657--12145697
3
13.7
3
84
0
55
65
2
4
26
1.25
12145657--12145700
15
2.9
15
86
0
70
65
4
4
25
1.30
12145768--12145801
4
8.5
4
86
0
50
73
5
0
20
1.04
12148696--12148726
16
2.0
16
93
6
55
32
3
12
51
1.56
12150156--12150209
26
2.1
26
89
6
83
53
3
11
31
1.53
12153407--12153531
44
2.9
44
79
3
128
27
20
20
32
1.97
12153493--12153597
52
2.0
52
80
7
115
22
23
19
34
1.96
12153643--12153759
44
2.7
44
81
13
143
29
16
21
32
1.95
12163247--12163285
19
2.0
20
90
5
62
43
5
23
28
1.75
12170328--12170364
6
6.3
6
82
17
51
48
0
0
51
1.00
12170328--12170359
16
2.1
16
94
5
57
50
0
0
50
1.00
12174097--12174135
20
2.0
21
90
10
64
71
12
2
12
1.24
12175582--12175637
25
2.2
25
87
0
85
33
5
0
60
1.19
12181171--12181447
50
5.5
50
95
0
473
35
16
22
25
1.95
12181427--12181485
31
1.9
31
100
0
118
28
20
25
25
1.99
12181440--12181531
46
2.0
46
86
0
130
27
22
22
27
1.99
12181486--12181555
31
2.3
31
79
0
77
27
20
24
28
1.99
12184596--12184639
16
2.6
16
89
7
61
75
4
0
20
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12185761--12185950
64
3.0
64
88
0
299
30
17
14
37
1.90
12186155--12186193
19
2.0
20
90
5
62
43
5
23
28
1.75
12193230--12193266
6
6.3
6
82
17
51
48
0
0
51
1.00
12193230--12193261
16
2.1
16
94
5
57
50
0
0
50
1.00
12196963--12197001
20
2.0
21
90
10
64
71
12
2
12
1.24
12197449--12197484
19
1.9
18
88
5
54
8
11
8
72
1.29
12198432--12198495
25
2.5
25
84
2
83
35
4
1
57
1.29
12204018--12204294
50
5.5
50
95
0
473
35
16
22
26
1.95
12204274--12204332
31
1.9
31
100
0
118
28
20
25
25
1.99
12204287--12204378
46
2.0
46
86
0
130
27
22
22
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295