Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  73  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21131120--21131157
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19
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0
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0.90
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0
20
0.90
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0
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0
0
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1.17
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2.2
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2.1
28
90
3
89
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5
0
36
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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10
0
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149
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18
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31
1.93
21172688--21173034
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4.7
74
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402
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1.93
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2.1
62
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4.1
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2.1
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20
2.2
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100
0
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64
2.0
64
100
0
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21
1.84
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7
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22
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0
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0
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2.1
64
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2
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20
3.0
18
76
21
57
35
5
1
58
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21205013--21205107
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1
49
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22
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1.71
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80
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34
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17
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1.94
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10.1
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33
20
17
29
1.95
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5.9
159
79
11
511
33
19
17
28
1.95
21211163--21211532
75
5.0
73
90
3
537
32
19
16
31
1.94
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3.3
307
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904
34
19
17
28
1.95
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148
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148
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637
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19
17
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1.95
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276
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18
17
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1.94
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2.8
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85
4
298
28
17
19
34
1.95
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10.1
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17
20
33
1.96
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2.5
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28
17
20
32
1.96
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153
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11
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28
17
20
32
1.96
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232
2.6
232
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28
17
21
32
1.96
21212866--21213266
159
2.5
159
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25
18
21
34
1.96
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18
19
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1.95
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22
2.9
22
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0
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1.73
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36
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15.1
72
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1
1821
31
17
18
33
1.94
21228328--21229418
145
7.6
144
94
1
1821
31
17
18
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1.94
21229502--21229534
14
2.4
14
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59
12
9
9
69
1.36
21229333--21229524
86
2.2
87
77
11
214
24
18
16
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21229545--21229794
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4.7
54
89
6
377
30
15
18
35
1.92
21230036--21230073
15
2.4
16
82
13
51
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2
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21
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3.9
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117
31
21
3
43
1.69
21230429--21230478
10
5.2
10
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7
59
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0
30
0
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0
30
0
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15.0
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13
58
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0
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0
0.95
21230537--21230565
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100
0
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62
0
37
0
0.96
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63
0
36
0
0.95
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14
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0
18
0
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7
93
6
82
84
0
16
0
0.63
21230872--21230947
15
5.1
15
85
9
93
81
0
18
0
0.69
21231488--21231545
18
3.3
18
82
2
73
31
10
13
44
1.78
21231488--21231931
17
25.1
17
69
13
107
33
11
10
44
1.74
21231488--21231560
36
2.0
36
84
5
94
32
12
12
42
1.80
21231586--21231680
34
2.8
34
87
4
120
30
15
8
45
1.76
21231609--21231662
16
3.2
16
75
14
56
35
14
9
40
1.78
21231659--21231725
23
3.0
22
86
8
91
44
7
7
40
1.61
21231659--21231725
22
3.0
21
89
6
89
44
7
7
40
1.61
21231509--21231931
18
24.0
17
68
20
96
33
11
9
44
1.74
21239403--21239448
19
2.4
19
85
0
56
36
4
0
58
1.18
21250081--21250113
11
2.9
12
86
13
52
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21250276--21250304
12
2.5
12
94
5
51
68
0
0
31
0.89
21250328--21250370
22
2.0
22
86
9
61
60
11
11
16
1.59
21250335--21250375
11
3.7
11
80
0
55
58
9
14
17
1.62
21250336--21250383
22
2.1
22
84
3
60
60
6
18
14
1.55
21250682--21250720
20
2.0
20
94
0
69
17
12
17
51
1.76
21250684--21250727
20
2.2
20
87
0
61
18
11
15
54
1.70
21252180--21252251
22
3.4
22
64
21
62
43
8
6
41
1.62
21252169--21252253
42
2.0
42
100
0
170
45
9
7
37
1.64
21267266--21267304
19
2.1
19
85
9
53
58
7
5
28
1.47
21269658--21269711
25
2.1
26
83
10
67
66
3
3
25
1.25
21270495--21270531
20
1.9
19
89
10
58
48
0
2
48
1.15
21270647--21270734
39
2.3
38
84
7
115
40
2
3
53
1.30
21273008--21273036
15
2.0
15
93
6
51
37
13
0
48
1.43
21277419--21277470
18
2.7
18
79
8
50
73
7
19
0
1.07
21278853--21279120
46
5.8
46
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1
340
20
22
14
42
1.88
21281640--21281717
39
2.0
39
94
0
138
26
16
35
20
1.94
21282581--21282772
64
3.0
64
93
0
312
33
18
11
35
1.87
21282866--21283272
88
4.6
88
78
3
392
34
20
23
21
1.97
21282866--21283269
175
2.3
175
80
3
411
33
20
23
22
1.97
21283351--21283641
44
6.6
44
67
12
159
25
24
21
28
1.99
21283328--21283648
88
3.6
88
88
0
464
26
23
21
28
1.99
21287382--21287418
18
2.1
18
90
5
58
35
0
2
62
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21287428--21287652
112
2.0
112
100
0
450
40
9
7
42
1.65
21292200--21292245
21
2.1
23
84
8
60
21
17
17
43
1.88
21292570--21292637
9
7.6
9
89
0
91
45
23
5
25
1.75
21292569--21292637
18
3.8
18
84
0
102
46
23
5
24
1.74
21292655--21292697
6
6.8
6
84
10
59
16
0
4
79
0.90
21292660--21292696
20
1.9
20
94
5
67
18
0
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75
0.99
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23
2.2
24
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32
3
19
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1.69
21294979--21295010
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16
100
0
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2.3
21
100
0
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45
18
0
35
1.50
21320463--21320550
42
2.1
42
89
0
131
43
22
18
15
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          289   290   291   292   293   294   295