Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  279  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88765307--88765347
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0
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0
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2.0
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0
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2.1
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2.0
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1.9
17
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2
29
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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2
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2.0
20
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2.0
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119
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1.93
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2
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15
1.14
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5
1
31
1.25
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2.0
14
100
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14
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2.2
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0
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2.2
18
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0
0
40
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
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0
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0
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0
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1.15
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1
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1.17
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1.71
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0
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0
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6
6.3
6
90
3
58
67
0
2
29
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88969167--88969198
10
3.2
10
95
0
55
46
9
12
31
1.73
88969194--88969277
26
3.2
26
93
0
141
33
5
23
36
1.79
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0
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0
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1.70
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2.1
27
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1
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27
1.25
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22
2.7
23
80
19
64
64
1
6
27
1.26
88978629--88978675
5
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5
81
9
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38
0
19
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1.51
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11.2
44
92
0
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26
15
32
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0
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16
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0
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32
0
16
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1.44
89008997--89009030
17
1.9
17
88
5
50
70
8
5
14
1.31
89015445--89015537
18
5.2
18
88
0
141
32
16
23
27
1.96
89025591--89025738
72
2.1
72
97
0
278
44
15
13
26
1.83
89028456--89028535
29
2.7
28
76
19
74
55
1
5
38
1.30
89028581--89028641
19
3.0
20
73
20
56
60
1
8
29
1.35
89028858--89028928
9
7.6
9
73
17
56
25
1
4
69
1.15
89028848--89028929
29
2.9
28
76
12
78
25
2
3
68
1.18
89028849--89028955
28
3.8
28
75
10
92
28
1
4
65
1.23
89032288--89032333
24
1.9
24
86
0
65
21
28
15
34
1.94
89032430--89032568
49
2.8
51
80
9
144
19
25
21
33
1.97
89032430--89032583
25
6.2
24
73
12
105
20
26
20
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89032536--89032592
24
2.3
25
77
14
64
24
28
19
28
1.98
89032578--89032633
25
2.2
25
93
0
94
19
23
19
37
1.94
89041836--89042022
76
2.4
77
82
3
216
36
19
14
29
1.91
89041836--89042022
38
4.9
38
79
2
194
36
19
14
29
1.91
89051921--89051969
20
2.6
19
78
9
57
71
6
2
20
1.18
89054738--89054784
14
3.4
14
74
11
51
31
0
0
68
0.90
89055587--89055622
15
2.4
15
90
0
54
50
0
16
33
1.46
89056083--89056112
4
7.8
4
92
7
53
50
0
23
26
1.50
89058366--89058403
14
2.5
16
87
8
53
55
5
0
39
1.23
89061429--89061489
16
3.8
17
72
20
51
54
3
0
42
1.17
89061899--89061993
49
1.9
49
91
0
154
41
14
20
24
1.89
89062141--89062379
94
2.6
91
82
7
290
40
16
10
33
1.82
89062465--89062520
21
2.6
22
81
13
64
67
1
7
23
1.24
89062564--89062608
21
2.1
21
84
8
56
60
4
8
26
1.46
89062777--89062815
19
2.0
20
90
5
62
41
2
5
51
1.38
89063691--89063732
17
2.3
19
88
8
61
50
4
4
40
1.45
89063779--89063826
19
2.5
20
83
10
73
43
10
8
37
1.69
89063876--89063916
6
6.7
6
88
5
64
19
0
0
80
0.71
89063867--89063914
25
2.0
25
87
4
71
27
0
0
72
0.84
89063876--89063919
19
2.3
19
92
0
70
20
0
0
79
0.73
89063876--89063919
13
3.5
13
81
6
63
20
0
0
79
0.73
89063916--89063945
14
2.1
14
93
0
51
33
13
10
43
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89066130--89066176
21
2.2
21
88
7
69
65
2
0
31
1.04
89066890--89066923
16
2.2
15
89
5
50
52
5
5
35
1.50
89067058--89067106
19
2.6
18
83
9
53
40
0
4
55
1.19
89067203--89067256
23
2.3
23
75
6
56
37
16
11
35
1.84
89070469--89070539
19
3.6
19
81
12
81
59
1
2
36
1.21
89070482--89070539
20
2.9
20
82
14
75
58
1
3
36
1.25
89070936--89070970
18
1.9
18
88
0
52
34
0
0
65
0.93
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90
2.6
95
77
14
259
34
18
10
37
1.85
89071104--89071271
94
1.8
90
81
13
200
35
18
12
33
1.88
89077775--89077816
21
2.0
22
86
9
61
59
4
9
26
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295