Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  250  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80418440--80418515
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0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
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1.99
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2.0
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2
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.22
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1.9
30
82
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73
22
31
27
18
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80595810--80595847
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0
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0
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22
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2.5
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50
1.30
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1.54
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18
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1.97
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95
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29
29
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1.87
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2.4
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1
124
18
13
28
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1.88
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0
14
0
0.59
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6
12.3
6
81
16
75
16
2
0
81
0.81
80639175--80639245
16
4.4
15
80
18
81
16
2
0
80
0.83
80640165--80640395
118
2.0
118
89
0
354
23
17
29
29
1.97
80640499--80640538
21
1.9
21
84
0
53
77
0
0
22
0.77
80640529--80640573
20
2.3
20
92
3
74
86
0
13
0
0.57
80640521--80640576
23
2.4
23
85
11
87
85
0
10
3
0.71
80651501--80651539
13
3.2
13
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7
64
74
0
25
0
0.82
80651510--80651553
18
2.4
18
80
0
52
77
2
20
0
0.88
80656116--80656149
18
1.9
18
88
5
52
14
0
23
61
1.33
80663519--80663649
68
1.9
68
98
0
253
35
23
14
26
1.93
80671418--80671465
24
2.0
24
87
0
69
29
22
29
18
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80671431--80671477
24
2.0
24
82
0
58
25
21
36
17
1.94
80672110--80672152
21
2.0
21
83
16
54
37
4
11
46
1.61
80672620--80672767
40
3.7
40
85
0
170
22
14
26
35
1.93
80676302--80676351
23
2.2
23
81
0
55
58
0
4
38
1.17
80681519--80681565
25
1.9
24
91
4
76
68
6
0
25
1.13
80685863--80685895
13
2.5
13
100
0
66
42
33
6
18
1.75
80691935--80692036
36
2.8
36
71
11
109
28
16
18
36
1.93
80694850--80694977
39
3.3
39
89
0
202
31
21
26
21
1.98
80694849--80695003
78
2.0
76
83
5
195
30
21
26
20
1.98
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13
2.0
13
100
0
52
69
7
7
15
1.35
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11
3.0
11
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8
50
41
26
0
32
1.56
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51
2.7
51
80
0
173
40
5
13
40
1.68
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96
3.0
96
92
0
463
36
17
33
12
1.88
80703189--80703324
51
2.7
51
80
0
173
40
5
13
40
1.68
80702272--80703683
709
2.0
707
97
0
2689
27
17
22
31
1.97
80704351--80704406
27
2.1
27
100
0
112
37
7
14
41
1.73
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13
1.9
13
100
0
50
12
0
0
88
0.53
80711812--80711847
18
2.0
18
88
0
54
50
0
11
38
1.38
80712527--80712567
15
2.8
14
85
10
55
51
4
4
39
1.45
80728950--80728981
11
2.8
12
86
13
50
25
6
0
68
1.12
80731069--80731192
48
2.7
46
84
2
149
31
15
26
26
1.96
80731022--80731192
46
3.7
46
80
7
177
30
15
26
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80731254--80731371
49
2.4
49
82
2
139
28
19
27
23
1.98
80738655--80738807
48
3.2
48
79
3
166
29
16
28
24
1.97
80738652--80738822
94
1.8
94
85
0
243
29
17
28
23
1.97
80739938--80739995
6
10.6
5
82
17
71
18
0
3
77
0.91
80739938--80739995
11
5.3
11
87
6
82
18
0
3
77
0.91
80765795--80765943
24
6.2
24
95
2
246
28
21
20
29
1.98
80765992--80766048
11
5.5
11
72
16
59
35
19
10
35
1.86
80765992--80766058
20
3.3
20
91
0
107
34
20
10
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1.87
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25
5.4
24
90
3
176
28
22
19
29
1.98
80774072--80774128
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295