Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  98  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29053734--29053885
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29053734--29053880
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1.82
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2.6
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2.2
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40
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19
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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9
51
4
31
0
63
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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16
2.0
17
88
11
52
17
29
17
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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64
0
4
32
1.12
29248918--29248964
22
2.1
22
84
7
60
74
2
6
17
1.12
29249837--29250285
44
10.2
43
66
13
173
24
24
20
30
1.99
29249705--29250288
132
4.4
132
85
1
724
25
25
20
29
1.99
29254605--29254630
11
2.4
11
100
0
52
42
30
11
15
1.82
29258132--29258176
23
2.0
23
86
8
65
37
8
11
42
1.72
29262118--29262147
15
2.0
15
93
0
51
26
3
0
70
1.03
29262285--29262346
25
2.5
24
75
17
63
32
9
1
56
1.41
29269915--29269974
30
2.0
30
90
0
93
38
8
25
28
1.84
29270403--29270575
46
3.7
46
78
13
210
21
21
27
28
1.99
29270400--29270570
93
1.8
93
96
0
315
21
21
28
28
1.99
29273546--29273601
15
3.7
15
85
7
78
12
17
10
58
1.61
29275519--29275578
30
2.0
30
86
0
84
38
8
23
30
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29276004--29276176
46
3.7
46
76
13
192
21
20
27
30
1.98
29276001--29276171
93
1.8
93
93
0
297
21
20
28
29
1.98
29277490--29278206
178
4.0
178
89
1
1078
31
17
23
27
1.97
29278222--29278375
44
3.5
44
67
10
125
33
22
20
23
1.97
29278224--29278391
88
1.9
88
93
0
291
33
22
22
22
1.97
29278319--29278462
76
1.9
76
86
2
209
34
20
22
22
1.97
29278395--29278711
88
3.6
88
90
0
472
35
21
21
21
1.96
29278393--29278759
44
8.3
44
68
14
177
34
21
22
22
1.97
29278681--29278768
44
2.0
44
93
0
149
35
20
20
23
1.96
29279575--29279620
22
2.1
22
84
8
58
63
6
0
30
1.20
29279838--29279884
15
2.9
15
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14
67
65
0
6
27
1.16
29283916--29284520
85
7.1
84
89
1
809
19
21
21
37
1.95
29284031--29284508
42
11.3
42
63
18
170
19
21
21
38
1.94
29284318--29284521
41
4.8
44
66
21
139
17
19
24
38
1.92
29284915--29284980
33
2.0
33
100
0
132
36
12
12
39
1.80
29289170--29289210
5
8.4
5
82
15
50
43
14
21
19
1.87
29290965--29291018
23
2.5
23
82
8
60
61
5
0
33
1.19
29291219--29291271
21
2.6
21
81
3
63
67
0
7
24
1.16
29291248--29291330
14
5.8
14
71
18
55
66
3
6
24
1.31
29292366--29292412
19
2.5
20
86
6
62
40
10
23
25
1.87
29296211--29296423
3
71.0
3
68
17
61
60
4
6
28
1.41
29296438--29296466
6
4.8
6
100
0
58
82
0
0
17
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29296544--29296578
15
2.2
16
90
5
54
62
2
2
31
1.24
29300669--29300713
13
3.5
13
75
0
54
24
8
28
37
1.86
29306092--29306152
31
2.0
32
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6
90
57
1
0
40
1.08
29307977--29308004
14
2.0
14
100
0
56
57
21
7
14
1.61
29308485--29308616
58
2.3
58
83
0
165
37
3
10
47
1.56
29308594--29308670
20
3.8
20
72
13
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36
0
16
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1.48
29308632--29308689
20
2.6
23
73
18
68
41
0
10
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138
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20
13
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1.92
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18
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5
59
55
2
0
41
1.15
29316191--29316222
16
2.1
16
88
11
50
59
18
0
21
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295