Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  286  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.4
24
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5
63
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Score
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1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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90974069--90974099
16
1.9
16
93
0
53
54
3
0
41
1.16
90978106--90978164
29
2.0
29
100
0
118
10
23
6
59
1.54
90978201--90978248
15
3.3
15
79
2
53
52
33
0
14
1.42
90978201--90978261
29
2.1
29
84
6
79
52
27
0
19
1.46
90983658--90983762
42
2.5
42
82
1
122
21
24
18
35
1.96
90985325--90985404
40
2.0
40
92
0
133
36
27
6
30
1.81
90990832--90990869
20
1.9
20
84
10
51
42
13
18
26
1.87
90993454--90993494
20
2.0
20
100
0
82
36
9
19
34
1.85
90993588--90993781
103
1.9
103
87
0
289
40
19
18
22
1.92
91002825--91002913
27
3.2
27
78
20
103
39
6
16
37
1.76
91003261--91003323
12
5.4
12
71
22
55
47
0
3
49
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91003261--91003323
22
2.7
23
77
20
69
47
0
3
49
1.17
91003387--91003437
26
2.0
26
88
3
77
50
7
1
39
1.42
91003514--91003602
44
2.0
46
84
8
121
39
23
4
32
1.75
91003584--91003638
16
3.4
16
87
5
76
32
25
5
36
1.79
91006228--91006304
39
2.0
39
84
5
102
38
5
7
48
1.55
91007082--91007143
27
2.3
27
83
11
81
75
0
11
12
1.04
91009895--91010095
106
1.9
106
96
0
375
30
19
20
29
1.97
91010996--91011044
23
2.1
23
88
7
73
65
12
6
16
1.45
91012595--91013436
44
19.3
44
82
6
844
29
26
16
28
1.96
91012595--91013402
175
4.6
174
93
3
1333
29
25
16
28
1.97
91034501--91034562
25
2.5
25
97
0
115
29
32
12
25
1.93
91036568--91036599
15
2.0
17
88
11
50
62
6
0
31
1.20
91039537--91039840
47
6.4
47
91
1
428
34
8
29
27
1.86
91043038--91043657
72
8.5
72
89
3
889
31
21
16
30
1.96
91043033--91043659
147
4.3
146
91
2
981
31
21
16
30
1.95
91051967--91052002
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
91053794--91053825
15
2.0
17
88
11
50
62
6
0
31
1.20
91069429--91069477
25
1.9
26
95
4
91
42
12
12
32
1.79
91072161--91072189
12
2.3
13
94
5
51
0
20
0
79
0.74
91077096--91077145
27
1.9
25
84
8
64
22
8
4
66
1.35
91084989--91085037
13
3.6
14
71
17
50
61
0
30
8
1.25
91084989--91085051
27
2.3
27
83
5
83
63
0
30
6
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91088543--91088576
14
2.4
14
85
14
52
73
14
11
0
1.10
91089588--91089663
39
2.0
38
84
7
100
23
23
26
26
2.00
91105068--91105095
14
2.0
14
100
0
56
71
0
0
28
0.86
91105830--91105908
14
5.6
14
75
0
77
32
11
24
31
1.90
91105816--91105908
28
3.3
27
74
5
69
32
11
23
32
1.91
91108254--91108304
20
2.6
19
85
11
68
31
9
3
54
1.51
91109029--91109210
96
1.9
96
94
0
319
34
13
15
36
1.87
91112703--91113118
140
3.0
140
77
7
445
31
21
7
38
1.81
91113938--91113976
19
2.1
19
95
0
69
33
20
23
23
1.97
91117441--91117484
22
2.0
22
82
8
54
43
0
4
52
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295