Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  55  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16298042--16298081
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16310080--16310372
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36
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182
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5.2
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0
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16379564--16379647
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100
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4
4
63
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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4
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10
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0
0
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19
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1.15
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1.9
18
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1.24
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124
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5
61
1.36
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30
3
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60
1.38
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1.9
18
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1.24
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4
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3.3
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0
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0
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0.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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19
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29
1.98
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1.9
24
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1.41
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70
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52
28
3
5
62
1.34
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14
3.9
14
82
12
65
28
3
5
61
1.37
16441381--16441437
25
2.3
25
81
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71
29
3
5
61
1.35
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27
0
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70
1.01
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2.3
80
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27
27
20
23
1.99
16443933--16444116
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4.6
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205
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27
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23
1.99
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1.9
19
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10
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29
8
5
56
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16486127--16486263
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1.9
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0
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28
18
24
29
1.98
16486193--16486354
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89
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27
17
21
33
1.96
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27
17
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1.96
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255
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16
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32
1.96
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15
21
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17
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20
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0
5
51
1.24
16503268--16503642
3
122.7
3
67
15
110
61
3
6
27
1.38
16503246--16503329
40
2.1
39
93
2
141
63
5
7
23
1.43
16503515--16503642
25
5.2
25
71
16
81
62
3
4
28
1.33
16512905--16513081
50
3.5
50
88
2
257
35
16
21
26
1.94
16513059--16513260
31
6.5
31
90
0
305
29
18
25
26
1.98
16513266--16513294
7
4.1
7
100
0
58
44
13
27
13
1.82
16513298--16513423
47
2.7
48
85
4
159
30
15
24
29
1.96
16521173--16521206
13
2.6
13
100
0
68
14
35
32
17
1.91
16523009--16523038
13
2.3
13
100
0
60
13
30
0
56
1.37
16530347--16530379
14
2.4
14
100
0
66
12
15
12
60
1.59
16530831--16530879
25
2.0
25
84
4
64
63
8
0
28
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16530869--16530965
18
5.2
17
70
18
61
70
4
1
24
1.12
16532776--16532810
14
2.4
15
90
4
54
68
2
0
28
1.04
16532806--16532907
30
3.4
31
83
5
122
29
22
3
44
1.71
16533276--16533335
3
18.0
3
86
13
66
66
0
33
0
0.92
16533276--16533335
25
2.5
23
82
15
77
66
0
33
0
0.92
16533276--16533336
7
9.0
7
84
15
67
67
0
32
0
0.91
16533276--16533336
22
2.8
24
85
11
78
67
0
32
0
0.91
16533379--16533421
18
2.3
18
84
4
50
30
51
16
2
1.57
16533602--16533679
23
3.3
23
84
13
97
82
0
17
0
0.68
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7
7.0
7
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6
77
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0
15
0
0.62
16533615--16533680
8
8.4
8
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10
84
81
0
18
0
0.68
16533602--16533680
26
2.7
30
77
20
96
81
0
18
0
0.70
16534229--16534269
21
2.0
21
86
9
59
51
17
4
26
1.65
16534265--16534425
17
9.4
17
78
9
141
30
12
9
47
1.74
16534286--16534424
35
4.1
35
80
6
155
30
12
10
47
1.74
16534405--16534517
35
3.1
36
73
17
106
38
10
10
40
1.75
16546705--16546747
20
2.2
20
100
0
86
55
9
11
23
1.64
16548340--16548409
32
2.2
32
84
5
88
18
1
20
60
1.45
16554954--16555002
21
2.4
20
90
6
80
22
8
6
63
1.44
16566517--16566542
13
2.0
13
100
0
52
15
30
38
15
1.88
16570359--16570468
51
2.2
51
91
0
175
32
24
10
31
1.90
16570447--16570485
7
5.6
7
87
0
51
17
30
10
41
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16570412--16570529
65
1.9
61
83
11
152
26
25
15
33
1.95
16573310--16573336
11
2.5
11
100
0
54
92
0
7
0
0.38
16574292--16574317
12
2.2
12
100
0
52
7
15
30
46
1.74
16574341--16574550
41
5.1
41
89
3
309
34
20
25
19
1.96
16575168--16575216
24
2.0
24
96
0
89
53
2
4
40
1.32
16575501--16575549
7
6.9
7
90
4
80
24
0
30
44
1.54
16575501--16575567
14
4.7
14
88
3
80
23
1
26
47
1.60
16575494--16575573
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2.2
36
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2
99
23
1
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1.60
16575493--16575567
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10.6
7
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2
69
24
1
26
48
1.59
16575548--16575608
28
2.1
29
82
14
74
16
1
40
40
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295