Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  92  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27097440--27097621
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96
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0
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0
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0
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1.79
27109257--27109522
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182
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1.99
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367
23
28
20
27
1.99
27109215--27109522
141
2.2
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354
23
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1.9
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0
89
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0
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1.23
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9
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62
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1.28
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9
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1
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1.33
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4
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1.28
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1.9
72
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152
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1.9
26
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30
6
2
62
1.31
27120403--27121407
309
3.3
302
89
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1494
26
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1.9
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30
4
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1.28
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2.5
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2.1
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4
4
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2.0
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2.0
17
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0
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0
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.5
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0
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1.00
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45
0
0
54
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2
3
46
1.34
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2.0
17
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52
45
0
0
54
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45
2.1
45
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16
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21
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2.0
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97
52
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24
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16
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1.45
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21
1
4
72
1.13
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2.2
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7
2
79
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90
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2.1
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100
0
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2.4
16
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8
53
53
0
20
25
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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13
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50
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49
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5
181
25
16
27
30
1.97
27176173--27176250
34
2.3
35
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8
99
26
14
16
42
1.86
27176185--27176254
34
2.1
34
89
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106
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12
15
44
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2.0
39
95
0
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30
2
6
60
1.35
27178194--27178234
21
2.0
21
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58
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2
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14
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51
0
0
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0
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1.76
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1.71
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0
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0
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14
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0
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0
0
77
0.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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2
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1.9
132
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5
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1.71
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0
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15
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3
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0
64
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35
0.94
27242129--27242191
29
2.2
29
94
0
108
0
61
0
38
0.96
27247463--27247543
26
3.1
25
74
15
74
56
1
2
39
1.20
27247514--27247548
17
2.0
18
88
5
54
60
2
0
37
1.12
27250207--27250245
17
2.3
17
86
8
53
43
0
0
56
0.99
27252235--27252261
13
2.1
13
100
0
54
29
7
14
48
1.71
27253805--27253834
13
2.3
13
94
0
51
13
33
33
20
1.91
27269528--27269798
40
6.8
40
87
0
335
21
29
17
32
1.96
27269601--27269788
20
9.4
20
64
6
85
19
30
19
30
1.96
27278724--27278869
27
5.4
27
87
0
193
28
10
17
43
1.83
27288767--27289005
50
4.8
50
84
3
295
30
17
28
23
1.97
27298426--27298469
21
2.0
22
91
4
72
43
22
4
29
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27298989--27299044
24
2.3
24
96
0
103
28
25
3
42
1.71
27302703--27302738
19
1.9
18
88
5
54
38
25
5
30
1.78
27306544--27306576
16
2.1
16
100
0
66
36
0
12
51
1.39
27313465--27313529
31
2.1
31
82
0
76
55
0
0
44
0.99
27315111--27315299
46
3.8
47
76
20
158
35
3
0
60
1.12
27315110--27315258
50
3.1
51
78
16
174
35
3
0
61
1.13
27315085--27315343
15
17.6
15
67
17
118
35
3
0
60
1.19
27322979--27323436
45
10.9
45
63
23
167
28
19
25
26
1.99
27323008--27323392
82
4.7
82
92
0
608
29
19
25
25
1.99
27324873--27325130
14
16.8
16
65
25
62
32
3
0
63
1.16
27324937--27325153
7
31.1
7
68
18
116
35
2
0
61
1.11
27324930--27325156
27
8.8
25
69
22
109
35
2
0
62
1.10
27324930--27325156
54
4.1
55
73
18
156
35
2
0
62
1.10
27324939--27325143
99
2.1
100
83
10
255
35
2
0
61
1.11
27324930--27325164
97
2.4
98
80
12
229
35
2
0
60
1.15
27325296--27325347
23
2.4
21
81
15
61
36
5
0
57
1.23
27325414--27325473
17
3.5
17
74
21
63
33
1
0
65
1.03
27325415--27325473
16
3.5
16
76
23
59
33
1
0
64
1.04
27326902--27326948
22
2.2
21
84
3
58
34
21
10
34
1.88
27326919--27326999
19
4.2
19
93
3
135
34
17
11
37
1.85
27331131--27331173
11
3.8
11
77
17
52
62
4
0
32
1.15
27331763--27331790
4
7.0
4
100
0
56
25
0
0
75
0.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27334160--27334212
23
2.4
22
76
20
56
69
1
18
9
1.25
27335566--27335593
4
7.0
4
100
0
56
25
0
0
75
0.81
27347713--27347794
27
3.0
27
96
0
146
14
30
18
36
1.91
27348139--27348202
31
2.1
31
96
0
119
21
7
25
45
1.78
27348878--27348928
25
2.0
25
81
7
59
54
7
17
19
1.67
27351633--27351660
7
4.0
7
100
0
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28
0
14
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27352110--27352136
13
2.1
13
100
0
54
14
7
11
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1.9
20
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5
13
0
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0.85
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19
2.5
19
75
25
55
41
8
16
33
1.78
27366209--27366259
17
2.8
19
88
11
88
39
11
13
35
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295