Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  30  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8984771--8984843
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0
0
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2.0
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2.5
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9018431--9018487
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21
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12
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0
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54
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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71
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18
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40
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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2.0
21
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0
55
43
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0
53
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9147043--9147095
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2.0
27
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1.70
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23
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4
54
53
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4
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1.33
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21
4
4
69
1.26
9155702--9155765
29
2.2
29
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13
69
26
12
6
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1.61
9157784--9157823
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2.1
19
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0
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10
25
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22
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1.97
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3.1
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177
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28
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0
0
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0
0
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0.94
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3.9
7
100
0
54
0
55
0
44
0.99
9178345--9178389
17
2.5
19
86
10
60
53
2
0
44
1.13
9184020--9184053
16
2.1
17
88
5
52
35
26
0
38
1.57
9184933--9184991
30
2.0
30
90
6
93
61
10
0
28
1.29
9187450--9187494
24
1.9
24
95
4
83
46
6
6
40
1.56
9190078--9190137
30
2.0
30
84
12
79
26
3
11
58
1.49
9192340--9192383
21
2.1
21
91
8
72
68
4
0
27
1.09
9197059--9197262
54
3.8
54
82
0
210
30
21
18
29
1.96
9201350--9201420
36
2.0
36
83
5
90
32
5
1
60
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9211097--9211155
21
2.7
21
78
5
64
62
1
1
33
1.15
9211120--9211165
23
2.0
24
86
4
67
63
0
2
34
1.07
9211137--9211171
14
2.5
14
85
0
52
60
2
2
34
1.26
9211226--9211299
37
2.0
38
87
7
109
59
2
2
35
1.26
9211309--9211369
22
2.6
24
82
7
81
60
0
8
31
1.26
9211379--9211439
26
2.5
25
82
10
72
60
6
6
26
1.46
9211366--9211439
26
3.0
25
77
16
66
59
5
6
28
1.45
9211655--9211691
19
1.9
19
88
0
56
64
10
0
24
1.25
9211707--9211784
25
3.0
28
69
14
76
55
3
5
35
1.40
9211684--9211784
52
1.9
50
82
11
121
56
3
4
34
1.39
9212877--9212918
21
2.0
22
85
4
59
4
16
21
57
1.58
9213918--9213944
8
3.4
8
100
0
54
62
11
0
25
1.28
9216066--9216152
30
2.9
30
94
1
147
26
25
6
41
1.80
9216076--9216153
15
5.2
15
70
11
70
25
23
7
43
1.80
9220729--9220822
30
3.1
30
93
1
152
25
25
6
42
1.78
9220739--9220816
15
5.2
15
70
11
70
25
23
7
43
1.80
9222137--9222167
14
2.1
14
94
5
53
64
0
0
35
0.94
9230158--9230206
24
2.0
24
88
0
71
55
8
4
32
1.48
9231109--9231151
15
2.9
14
82
3
50
20
0
37
41
1.53
9231116--9231183
14
4.8
14
78
8
66
20
0
30
48
1.50
9231139--9231197
28
2.1
28
83
0
73
25
0
22
52
1.47
9231682--9231743
7
8.9
7
76
13
56
16
0
37
46
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9231787--9231917
7
18.6
7
72
14
67
12
1
40
45
1.51
9237453--9237521
21
3.3
21
89
0
111
24
18
55
1
1.51
9237816--9237993
43
4.1
42
85
4
230
26
17
21
33
1.96
9245200--9245231
4
8.0
4
92
0
55
46
25
3
25
1.67
9257025--9257063
20
2.0
20
84
0
51
33
12
0
53
1.39
9259551--9259580
14
2.1
14
100
0
60
36
20
0
43
1.52
9261334--9261377
22
2.0
22
100
0
88
13
13
18
54
1.71
9262978--9263057
38
2.1
38
95
0
142
33
7
17
41
1.78
9263990--9264068
29
2.6
31
81
16
87
51
1
2
44
1.23
9263979--9264068
11
7.7
12
68
24
50
52
1
2
44
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295