Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  56  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16575586--16575637
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1.8
147
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4
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16
23
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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211
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30
1.97
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2.7
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18
2.2
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1.94
16628373--16628487
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23
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149
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23
16
1.94
16634196--16634310
54
2.1
54
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169
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23
23
16
1.94
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9.4
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43
1.22
16641244--16641323
8
9.4
8
72
11
52
53
1
2
42
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
26
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1.97
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2.1
19
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15
25
1.89
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23
2.5
20
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18
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63
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32
1.12
16651206--16651264
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2.4
25
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32
1.10
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0
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26
14
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551
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15
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0
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0
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12.3
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123
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5
62
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16696855--16696914
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1
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1.31
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38
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0
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30
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14
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34
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18
3.3
18
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2
55
32
15
17
34
1.91
16732927--16732967
11
3.7
11
80
0
55
19
14
9
56
1.66
16733004--16733067
30
2.2
30
91
8
105
25
4
10
59
1.50
16733189--16733222
12
2.8
12
90
0
50
67
0
0
32
0.91
16733487--16733723
117
2.0
117
94
0
411
31
9
6
52
1.60
16736395--16736445
20
2.5
20
75
9
59
49
9
0
41
1.36
16740257--16740285
14
2.0
15
93
6
51
51
20
0
27
1.47
16741530--16741595
28
2.4
28
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5
98
50
15
10
24
1.75
16743382--16743452
24
2.8
26
71
14
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40
18
23
16
1.90
16744377--16744415
18
2.2
18
86
9
53
64
0
7
28
1.21
16749447--16749474
14
2.0
14
100
0
56
50
7
21
21
1.72
16757612--16757699
21
4.1
22
75
10
74
35
23
23
17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16757890--16757960
23
2.9
23
75
22
72
45
32
4
18
1.69
16757904--16757987
28
3.0
28
89
1
123
46
28
3
21
1.68
16762162--16762232
26
2.8
24
74
14
63
40
19
22
16
1.91
16774778--16774806
2
14.5
2
100
0
58
0
51
0
48
1.00
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30
2.2
30
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10
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4
4
33
1.39
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15
2.1
14
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5
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54
6
3
35
1.42
16779878--16779946
21
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20
71
16
70
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7
1
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9
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4
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36
1.44
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19
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0
3
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1.18
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3
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0
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3
0
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1.08
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19
3.1
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1
0
46
1.10
16799265--16799312
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2.5
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50
0
0
50
1.00
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1.9
21
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47
5
0
47
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1.9
31
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44
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11
32
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16
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0
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1.39
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2.0
19
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34
1.84
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19
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18
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12
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6
0
36
1.23
16814744--16814793
10
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9
73
17
50
60
0
2
38
1.09
16814727--16814793
28
2.5
28
83
11
79
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0
1
34
1.03
16818627--16818671
21
2.3
19
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11
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0
17
0
82
0.68
16818627--16818661
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2.2
16
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0
61
0
20
0
80
0.72
16818628--16818670
5
8.8
5
82
12
54
0
18
0
81
0.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16818629--16818670
16
2.9
14
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10
50
0
19
0
80
0.70
16821762--16821845
29
2.8
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21
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35
14
5
44
1.69
16826692--16826765
8
9.4
8
76
16
66
44
1
1
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1.17
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15
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1
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10
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10
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4
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1.23
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0
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22
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3.7
12
80
20
56
25
0
2
72
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295