Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  4  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1016517--1016543
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14
100
0
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29
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1020101--1020198
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2.0
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100
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2.1
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0
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2.0
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5.2
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387
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20
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21
73
13
64
44
1
1
52
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1100474--1100507
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100
0
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44
0
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2.0
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0
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15
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3.1
40
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80
0
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22
19
25
1.97
1107173--1107729
276
2.0
276
93
0
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33
14
17
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1110506--1110540
14
2.6
14
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4
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2
14
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1.59
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5.6
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80
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20
23
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1.98
1111236--1111498
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3.1
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2
301
25
18
23
32
1.97
1111264--1111496
129
1.8
129
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3
308
25
18
23
32
1.97
1112201--1112341
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2.1
68
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169
21
12
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2.0
64
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0
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1.73
1129017--1129057
21
1.9
22
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5
66
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2
7
19
1.22
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2.4
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4
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2.0
21
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2.0
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17
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26
16
27
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3.9
132
94
1
851
29
26
16
27
1.96
1146971--1147122
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3.5
42
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0
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92
0.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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100
0
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0
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12
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13
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13
2.2
13
100
0
58
0
34
6
58
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2.5
23
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47
8
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16
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2
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19
2.2
19
90
0
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17
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0
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0
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14
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0
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2.7
11
100
0
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53
0
0
46
1.00
1252471--1252512
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2.5
17
80
7
50
21
2
2
73
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1261843--1261881
19
2.1
19
100
0
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35
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20
20
1.96
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3.0
72
92
0
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24
30
23
21
1.99
1266371--1266415
23
1.9
24
86
4
65
60
0
6
33
1.23
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180
4.0
177
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20
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0
0
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3
64
44
0
2
53
1.12
1296207--1296520
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170
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12
14
39
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2.1
19
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0
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0
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33
2.0
31
85
11
85
37
4
18
39
1.72
1320177--1320227
18
2.8
18
71
11
50
39
3
27
29
1.74
1321458--1321496
19
2.1
18
90
4
60
41
5
5
48
1.47
1327677--1327747
20
3.6
19
78
14
74
39
0
2
57
1.13
1327664--1327746
39
2.1
39
84
8
107
39
0
3
56
1.17
1327828--1327865
19
2.0
19
85
10
51
50
13
5
31
1.63
1329429--1329468
13
2.9
14
85
14
57
45
0
2
52
1.14
1330447--1330548
29
3.5
29
76
9
109
34
18
18
28
1.95
1332551--1332619
24
2.9
24
84
0
93
24
11
33
30
1.91
1341765--1341795
14
2.1
15
94
5
55
64
3
0
32
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1348683--1348712
3
10.0
3
92
0
51
70
0
30
0
0.88
1359562--1359621
30
2.0
30
93
0
102
31
8
11
48
1.69
1365380--1365430
12
4.0
13
74
20
54
56
7
0
35
1.28
1366084--1366132
22
2.2
22
85
7
64
57
2
2
38
1.22
1367060--1367100
21
2.0
21
95
0
73
24
4
12
58
1.53
1370955--1371107
60
2.6
59
79
10
161
42
9
14
33
1.78
1379413--1379480
16
4.3
15
80
12
66
67
0
0
32
0.91
1379399--1379460
33
1.9
31
90
6
97
69
0
0
30
0.89
1379404--1379477
15
4.8
15
82
11
96
68
0
0
31
0.89
1380613--1380637
11
2.3
11
100
0
50
64
0
0
36
0.94
1380599--1380632
17
2.1
16
88
5
50
58
2
0
38
1.13
1382128--1382157
3
10.0
3
100
0
60
33
0
0
66
0.92
1382169--1382224
27
2.1
27
96
0
103
35
41
5
17
1.73
1385989--1386029
16
2.5
17
80
15
50
36
4
7
51
1.51
1391716--1391763
24
1.9
25
83
8
62
39
2
12
45
1.54
1394224--1394264
21
2.0
21
85
0
55
31
2
2
63
1.20
1402761--1402811
21
2.4
21
87
12
70
29
0
0
70
0.87
1402777--1402811
7
5.0
7
100
0
70
28
0
0
71
0.86
1403242--1403288
23
2.0
23
87
8
67
48
6
12
31
1.66
1404066--1404126
32
1.9
32
82
0
77
47
40
3
8
1.49
1405180--1405224
21
2.2
21
84
11
58
31
6
0
62
1.21
1405253--1405313
3
20.0
3
93
3
104
32
1
1
63
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1405512--1405550
15
2.5
15
87
4
51
33
2
2
61
1.23
1409644--1409675
16
2.0
16
93
0
55
40
15
0
43
1.47
1411750--1411787
16
2.3
17
90
4
60
26
0
18
55
1.43
1411999--1412034
17
2.1
17
89
0
54
27
16
11
44
1.82
1415371--1415422
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
1417340--1417391
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
1419390--1419464
38
2.0
38
86
0
105
54
10
6
28
1.60
1419393--1419474
38
2.2
38
80
2
94
58
9
3
28
1.47
1420382--1420410
11
2.7
11
94
5
51
51
0
0
48
1.00
1422441--1422532
3
30.7
3
70
8
53
19
41
4
34
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295