Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  29  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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20
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26
26
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42
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26
12
30
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8909760--8909797
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2.0
19
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0
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8948181--8948242
30
2.1
30
96
0
115
27
6
4
61
1.41
8948652--8948745
47
2.0
48
85
10
122
52
8
1
38
1.39
8951974--8952038
30
2.1
29
83
11
76
49
0
0
50
1.00
8952721--8952768
22
2.2
22
85
7
62
50
2
0
47
1.12
8952813--8952863
20
2.3
22
74
22
52
47
1
0
50
1.12
8952823--8952861
20
1.9
21
89
5
62
43
2
0
53
1.14
8952951--8952999
19
2.6
19
80
3
64
57
2
0
40
1.10
8956495--8956537
18
2.4
17
81
11
50
32
2
2
62
1.20
8956502--8956537
18
2.0
18
88
0
54
36
0
2
61
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8964783--8964835
16
3.2
16
94
5
97
24
0
37
37
1.56
8965071--8965105
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
8965170--8965210
15
2.8
15
82
10
50
53
2
0
43
1.13
8965054--8965346
120
2.4
121
93
1
509
50
5
2
42
1.37
8965287--8965569
91
3.0
93
84
7
317
48
3
3
44
1.35
8965387--8965447
28
2.2
28
85
5
81
50
3
0
45
1.17
8965394--8965537
47
3.1
46
65
23
113
49
4
2
44
1.33
8965362--8965569
91
2.3
90
90
4
326
46
4
3
45
1.39
8965387--8965529
44
3.2
43
68
16
119
48
3
2
46
1.31
8965412--8965550
47
3.0
47
68
17
137
49
4
2
43
1.34
8969166--8969300
56
2.3
58
86
5
175
24
4
16
54
1.60
8974514--8974569
29
1.9
29
89
7
87
33
44
1
19
1.61
8974537--8974611
37
2.0
37
97
0
141
29
53
0
17
1.44
8974553--8974625
18
4.0
18
71
16
69
27
56
0
16
1.41
8975009--8975045
19
2.0
18
94
5
65
32
0
0
67
0.91
8974903--8975034
60
2.2
61
81
13
157
26
4
5
63
1.35
8975017--8975047
14
2.2
14
94
0
53
32
0
0
67
0.91
8975250--8975289
21
1.9
21
84
0
53
25
12
5
57
1.55
8975502--8975745
126
1.9
126
94
1
427
29
17
14
38
1.90
8981883--8981930
12
3.6
13
83
8
53
72
2
25
0
0.95
8981883--8981944
14
4.0
16
79
10
58
74
1
22
1
1.00
8981901--8981944
16
2.8
16
83
10
54
77
0
20
2
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8983399--8983522
46
2.8
46
75
10
114
31
20
23
25
1.98
8983227--8983514
89
3.2
87
66
14
219
30
20
23
25
1.98
8983213--8983655
179
2.5
179
88
2
660
31
20
22
25
1.98
8983499--8983827
133
2.5
132
88
1
489
30
19
24
25
1.98
8983928--8984165
44
5.5
43
75
13
236
37
20
16
25
1.93
8983841--8984234
87
4.5
87
90
1
558
37
20
17
23
1.94
8983929--8984493
174
3.3
170
82
6
608
33
22
21
22
1.97
8984186--8984488
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3.6
85
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434
29
25
25
19
1.98
8984726--8984789
29
2.2
29
86
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94
31
51
1
15
1.53
8984755--8984829
37
2.0
37
100
0
150
29
54
0
16
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295