Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  33  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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1.45
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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135
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19
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Entropy
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254
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28
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20
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21
9
8
60
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
1.84
10100373--10100416
23
1.9
23
90
0
70
25
13
20
40
1.89
10103091--10103123
7
4.7
7
96
0
57
36
18
0
45
1.49
10103171--10103216
13
3.5
13
82
11
58
43
17
0
39
1.49
10103658--10103772
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
10103658--10103772
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
10103875--10103936
26
2.3
26
83
5
70
30
14
25
29
1.95
10105383--10105492
26
4.2
26
95
0
175
36
23
6
33
1.80
10105837--10105970
40
3.3
40
85
0
160
39
17
1
41
1.58
10107179--10107230
21
2.5
22
73
17
56
36
3
1
57
1.28
10109565--10109594
12
2.5
12
94
0
51
53
0
10
36
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10110438--10110472
5
6.8
5
87
6
52
74
0
0
25
0.82
10110424--10110472
21
2.4
21
86
3
64
67
2
0
30
1.02
10117724--10117775
17
2.8
18
82
11
61
25
7
0
67
1.17
10134358--10134427
34
2.1
34
100
0
140
32
8
8
50
1.64
10135661--10135801
63
2.3
63
86
1
194
34
35
5
24
1.79
10140875--10140964
47
1.9
47
84
4
119
30
26
7
35
1.85
10148627--10148678
26
2.0
26
88
0
77
44
1
3
50
1.31
10149761--10149792
16
2.0
16
100
0
64
37
18
0
43
1.51
10150634--10150740
10
11.4
9
69
20
60
64
1
1
31
1.15
10150630--10150741
19
5.9
18
74
13
75
64
1
1
32
1.14
10150648--10150740
10
9.5
10
73
10
68
62
2
2
33
1.19
10150665--10150740
29
2.5
32
81
12
90
61
1
1
35
1.12
10150926--10150980
20
2.8
19
74
17
51
23
9
1
65
1.31
10150925--10151058
19
6.9
19
69
17
71
29
8
2
60
1.38
10151064--10151125
30
2.0
30
84
3
79
40
0
0
59
0.97
10151103--10151141
16
2.4
16
86
0
51
35
2
0
61
1.10
10154658--10154739
40
2.0
40
100
0
164
37
31
12
18
1.87
10160454--10160511
8
7.1
8
90
2
89
25
0
3
70
1.03
10165137--10165221
42
2.0
42
100
0
170
45
9
7
37
1.64
10166984--10167009
7
3.7
7
100
0
52
69
0
0
30
0.89
10167079--10167129
19
2.7
20
75
9
52
66
0
0
33
0.92
10170405--10170555
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10175748--10175841
48
2.0
48
97
0
179
36
13
10
39
1.80
10177379--10177450
32
2.3
31
86
9
101
30
11
18
40
1.85
10177850--10178080
124
1.9
125
84
0
311
47
21
6
24
1.74
10179258--10179300
21
2.0
21
86
4
59
53
0
0
46
1.00
10179893--10179931
14
2.8
14
92
0
60
30
20
10
38
1.86
10180230--10180292
30
2.1
30
93
0
108
23
1
15
58
1.46
10180415--10180445
11
2.8
11
95
0
53
64
0
3
32
1.09
10180679--10180718
19
2.2
18
86
4
53
40
2
0
57
1.12
10180678--10180728
21
2.4
21
78
15
52
39
1
0
58
1.09
10180722--10180755
16
2.1
17
88
5
52
61
0
0
38
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295