Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  81  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23706351--23706419
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0
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1.88
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20
2.0
20
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3
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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2.0
20
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22
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2.1
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25
2.2
25
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52
1
0
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1.11
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3
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2.0
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2.0
28
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27
12
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51
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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4
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22
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1.93
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53
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28
28
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16
2.1
16
100
0
68
26
8
17
47
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23866055--23866119
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1.9
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44
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10
21
1.83
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2.0
21
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43
0
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1.13
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18
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130
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130
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20
18
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1.96
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52
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52
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25
16
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100
0
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52
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25
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27
28
1.98
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2.7
29
91
0
127
18
35
29
16
1.93
23903262--23903342
3
26.7
3
97
2
153
32
1
0
66
0.99
23903639--23903669
3
10.0
3
93
6
53
32
3
0
64
1.09
23912213--23912422
47
4.6
47
78
13
206
31
14
21
31
1.94
23912297--23912455
38
4.0
38
77
14
158
30
15
23
30
1.95
23912249--23912455
85
2.4
85
92
0
351
30
14
23
31
1.94
23916261--23916341
27
3.0
27
75
10
85
39
14
1
44
1.54
23916261--23916341
26
3.0
28
75
10
89
39
14
1
44
1.54
23919446--23919480
17
2.1
17
94
0
61
37
25
2
34
1.71
23924032--23924075
6
7.3
6
97
0
61
34
6
34
25
1.82
23929918--23929998
20
4.1
20
70
9
58
37
4
1
56
1.29
23929923--23929998
30
2.5
31
82
6
93
38
5
1
55
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23930276--23930337
11
6.2
10
78
12
56
41
4
1
51
1.33
23933491--23933678
48
3.9
48
71
2
137
32
26
18
22
1.97
23937126--23937180
22
2.6
21
73
21
60
40
7
9
43
1.64
23937158--23937680
17
29.8
17
68
13
217
43
11
11
33
1.76
23937306--23937470
89
1.9
88
80
11
194
41
12
10
34
1.78
23937414--23937626
38
5.7
38
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12
122
43
11
11
34
1.76
23937306--23937670
72
5.0
74
73
10
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42
10
11
34
1.77
23937426--23937670
37
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15
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43
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11
35
1.75
23937616--23937669
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3.2
16
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9
14
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1.78
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16
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11
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1
0
25
0.95
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3
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0
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0
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3.8
14
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0
30
0
69
0.89
23938355--23938395
7
6.0
7
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0
39
0
60
0.96
23938455--23938500
10
4.7
10
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5
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0
30
0
69
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23938450--23938497
19
2.6
19
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9
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0
29
0
70
0.87
23938749--23938865
30
3.9
29
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11
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3
21
30
1.69
23938764--23938865
30
3.4
30
84
2
134
44
3
21
30
1.70
23939136--23939353
54
4.1
55
87
8
315
37
17
16
28
1.91
23939332--23939366
14
2.5
14
90
0
52
60
2
17
20
1.49
23939455--23939702
85
2.8
87
80
10
299
36
18
18
26
1.94
23939615--23939648
16
2.1
16
88
0
50
64
5
11
17
1.45
23939455--23939709
91
2.9
88
82
9
315
36
18
18
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23939632--23939950
123
2.6
123
91
3
523
36
21
14
27
1.92
23939792--23940598
193
4.2
192
98
0
1533
35
20
13
30
1.91
23948760--23949280
17
29.9
17
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15
185
43
11
12
33
1.78
23948942--23949178
35
6.6
35
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17
132
38
10
14
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1.81
23948908--23949144
54
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55
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11
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38
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150
41
9
13
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1.78
23948908--23949222
74
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11
206
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10
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16
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3
14
0
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14
2.5
15
87
12
51
0
2
13
83
0.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295