Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  22  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6664701--6664744
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0
0
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10
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29
0
5
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1.16
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2.1
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0
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2.1
27
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2.2
20
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6695078--6695185
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22
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6721555--6721668
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2.1
54
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20
22
22
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64
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2.1
24
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0
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26
44
6
24
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6743244--6743303
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18
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0
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21
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1.77
6743245--6743303
9
6.6
9
82
0
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44
22
6
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1.78
6743812--6743864
24
2.1
26
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1.61
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34
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2
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0
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3.1
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1.9
120
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0
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2.0
17
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50
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6
0
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12
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8
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1.15
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120.3
3
67
17
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7
3
60
1.39
6750320--6750430
22
5.1
20
70
20
64
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5
1
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1.25
6750354--6750430
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3.4
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8
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2
61
1.32
6750320--6750431
20
5.4
20
73
14
84
28
5
1
64
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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1.40
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15
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15
26
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0
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0
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23
17
28
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1.97
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23
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8
4
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1.54
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2.1
28
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45
0
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20
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13
24
1.91
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522
2.7
522
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1740
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25
12
23
1.90
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272
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37
24
13
24
1.92
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2.5
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1
27
1.12
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0
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18
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31
0
2
65
1.12
6785143--6785230
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2.4
38
76
17
96
28
1
4
65
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6790368--6790433
32
2.1
32
85
0
87
46
6
7
39
1.57
6790939--6791002
30
2.1
30
97
0
119
39
4
20
35
1.73
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254
2.8
249
85
5
861
46
14
14
24
1.81
6797926--6798165
119
2.0
118
86
4
331
47
12
13
26
1.79
6798045--6798475
139
3.1
139
89
1
632
51
13
12
23
1.75
6799089--6799143
24
2.2
25
83
6
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25
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1
69
1.15
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1.10
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17
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0
4
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1.20
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15
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1.22
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10
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24
13
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40
0
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34
8
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32
1.85
6813739--6813790
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
6815707--6815758
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
6816932--6816981
25
2.0
25
100
0
100
20
8
32
40
1.81
6827588--6827651
31
2.3
27
73
21
67
31
10
9
48
1.70
6827599--6827661
31
2.0
31
90
6
101
33
11
12
42
1.78
6837494--6837580
44
2.0
44
97
0
165
60
11
5
21
1.51
6842020--6842059
20
2.0
20
85
0
53
62
5
0
32
1.17
6842723--6842784
32
1.9
33
87
9
92
41
4
3
50
1.40
6843873--6843900
3
9.3
3
100
0
56
67
0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6846236--6846261
6
4.3
6
100
0
52
84
0
0
15
0.62
6850621--6850794
88
2.0
88
85
8
239
37
12
18
31
1.88
6853118--6853248
64
2.0
65
85
5
176
44
6
16
32
1.74
6854867--6854909
6
6.8
6
79
10
50
48
4
0
46
1.22
6854869--6854908
20
2.0
20
90
0
62
47
5
0
47
1.24
6855901--6855926
8
3.2
8
100
0
52
50
0
0
50
1.00
6859366--6859425
31
2.0
31
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3
86
43
26
18
11
1.84
6859608--6859765
7
21.4
7
68
12
57
25
0
27
46
1.58
6859616--6859766
21
6.8
21
74
11
131
26
0
27
45
1.59
6859616--6859766
67
2.3
67
92
0
248
26
0
27
45
1.59
6859693--6859782
46
2.0
46
93
0
153
27
2
26
43
1.67
6860114--6860298
75
2.5
75
92
1
311
53
9
10
27
1.65
6864653--6864798
43
3.4
42
84
5
193
26
22
21
28
1.99
6873512--6873540
15
2.0
15
93
6
51
27
17
27
27
1.97
6878507--6878587
26
3.0
26
77
7
81
58
7
4
29
1.47
6880414--6880453
21
1.9
21
85
10
55
40
2
0
57
1.12
6880879--6880966
42
2.1
42
91
0
140
37
21
17
23
1.94
6881268--6881298
15
2.1
15
94
5
55
41
6
0
51
1.27
6881419--6881587
84
2.0
84
96
0
311
41
9
32
16
1.81
6891672--6891723
22
2.4
22
87
9
79
9
26
7
55
1.59
6893240--6893278
18
2.2
18
90
9
62
43
7
12
35
1.72
6894081--6894139
30
1.9
31
86
3
84
45
3
22
28
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6894343--6894396
20
2.6
21
82
11
67
35
0
7
57
1.27
6894382--6894430
3
17.3
3
76
19
52
28
2
0
69
1.00
6894386--6894424
11
3.5
11
92
0
69
28
2
0
69
1.02
6894382--6894423
19
2.2
19
87
8
59
26
2
0
71
0.98
6896539--6896657
23
5.1
23
70
14
64
16
26
24
32
1.96
6898911--6898998
30
2.9
29
88
6
122
5
27
21
45
1.74
6899980--6900020
20
2.0
20
100
0
82
34
4
9
51
1.56
6899914--6900106
106
1.8
106
98
0
377
32
11
13
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1.81
6903208--6903295
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2.0
44
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2
124
25
19
7
47
1.76
6909890--6909919
9
3.2
9
95
4
51
66
0
0
33
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          289   290   291   292   293   294   295