Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  197  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62980414--62980469
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19
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0
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0
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1.15
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1.21
62990388--62990481
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3.2
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19
73
32
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1.22
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0
0
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28
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20
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0
0
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1.00
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6.6
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27
20
24
1.99
63073079--63073340
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2.2
119
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27
20
24
1.99
63073079--63073340
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3.3
79
85
4
316
27
27
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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0
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25
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20
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1.90
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6.6
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325
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27
20
24
1.99
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26
2.2
26
96
0
103
28
8
26
35
1.87
63090197--63090249
26
2.0
26
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7
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15
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1.92
63094087--63094259
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77
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276
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26
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20
1.96
63106268--63106351
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4.2
20
98
0
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1.95
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1.97
63111608--63111641
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2.1
16
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23
26
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1.83
63111866--63111979
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131
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17
32
26
1.97
63117336--63117427
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11
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28
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30
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22
2.0
22
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2
220
29
19
23
27
1.98
63124750--63124977
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2.7
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249
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19
23
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1.98
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2.0
24
100
0
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1.87
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29
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2
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1.31
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2.3
19
100
0
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9
0
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4
100
0
52
23
0
0
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0.78
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2.0
22
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2.4
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25
0
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2.1
22
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12
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2.0
40
93
2
139
32
22
18
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
22
26
2.00
63148032--63148256
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1.9
120
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9
291
24
26
22
26
2.00
63148032--63148256
40
5.7
39
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244
24
26
22
26
2.00
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5.5
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2
307
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28
22
23
1.99
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2.0
52
88
0
154
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16
1.96
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14
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1.95
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4.8
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97
0
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30
28
14
26
1.95
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3
245
30
28
14
26
1.95
63172441--63172702
55
4.8
55
97
0
470
30
28
14
26
1.95
63175741--63175958
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5.5
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2
316
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29
22
22
1.99
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2.1
21
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31
24
17
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1.97
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177
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25
17
25
1.97
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21
2.1
21
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11
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1.77
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24
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1.97
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10
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22
21
27
29
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63208794--63208965
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93
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0
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22
21
27
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1.99
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2.0
30
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28
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1.83
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2.0
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18
18
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54
1.68
63218671--63218712
12
3.8
11
84
9
59
11
9
26
52
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63219298--63219350
19
2.7
20
83
11
65
47
15
7
30
1.73
63219274--63219356
20
4.2
20
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11
64
43
14
7
34
1.73
63219414--63219532
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5.9
20
71
14
59
44
12
11
31
1.78
63219417--63219532
40
2.9
39
72
11
101
44
12
12
31
1.78
63222316--63222593
120
2.3
119
80
7
289
36
8
19
35
1.82
63222510--63222548
20
2.0
20
85
10
53
30
12
17
38
1.88
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12
2.8
12
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0
50
61
0
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14
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0
2
15
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0
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51
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2.0
40
100
0
156
29
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1.44
63253095--63253721
343
1.8
339
85
3
891
29
18
17
34
1.94
63260588--63260637
15
3.5
14
83
10
66
2
22
2
74
1.03
63260586--63260697
28
4.1
27
71
17
74
4
19
3
72
1.17
63260592--63260690
13
7.8
13
69
28
56
5
20
4
70
1.22
63260669--63260718
25
2.2
23
86
13
68
10
20
0
70
1.16
63260586--63260692
6
16.3
6
73
18
56
4
19
3
71
1.19
63262106--63262135
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
63263383--63263441
29
2.0
29
96
0
109
45
13
8
32
1.74
63264811--63264930
56
2.2
56
96
1
224
23
7
26
42
1.80
63264814--63264903
28
3.2
28
65
22
80
22
8
26
42
1.83
63268159--63268409
80
3.2
80
94
0
423
23
21
28
26
1.99
63268158--63268409
40
6.3
40
81
0
308
24
21
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63274004--63274044
21
1.9
22
85
5
57
26
4
21
46
1.72
63277126--63277290
42
3.9
42
80
1
195
27
24
15
32
1.95
63277126--63277290
85
2.0
84
82
1
204
27
24
15
32
1.95
63282496--63282674
46
3.9
46
80
4
216
28
28
20
22
1.99
63282505--63282675
93
1.8
93
92
0
288
28
29
21
21
1.98
63285080--63285121
15
2.8
15
79
13
50
57
16
14
11
1.66
63288074--63288244
93
1.8
93
94
0
306
27
29
21
21
1.98
63288066--63288241
46
3.8
46
81
10
214
28
29
21
21
1.98
63294026--63294059
17
2.0
17
88
11
52
58
0
20
20
1.39
63296890--63297084
50
3.8
50
76
8
196
25
17
25
31
1.97
63296936--63297118
101
1.8
101
81
0
231
26
18
26
29
1.98
63297283--63297312
16
1.9
15
93
6
51
43
0
23
33
1.54
63306419--63306458
15
2.7
15
92
3
64
52
35
0
12
1.39
63306419--63306465
14
3.3
15
88
8
71
53
36
0
10
1.36
63306420--63306461
7
5.9
7
88
5
66
47
40
0
11
1.40
63312190--63312265
29
2.6
29
89
4
109
21
21
27
30
1.98
63319106--63319281
46
3.8
46
77
10
187
21
21
28
28
1.98
63319103--63319274
93
1.8
93
91
0
281
22
21
28
27
1.99
63322236--63322291
15
3.7
15
88
7
87
12
16
10
60
1.58
63324222--63324397
46
3.8
46
78
1
181
22
21
27
28
1.99
63324219--63324390
93
1.8
93
89
0
272
23
21
27
27
1.99
63327286--63327361
29
2.6
29
91
4
118
18
18
30
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63333378--63333427
19
2.7
19
82
14
61
54
0
4
42
1.19
63333436--63333481
23
2.0
23
100
0
92
47
4
8
39
1.54
63334118--63334243
66
1.9
67
86
4
184
28
22
26
23
1.99
63336011--63336196
41
4.6
40
88
4
241
26
23
25
24
2.00
63336011--63336196
81
2.3
81
85
7
245
26
23
25
24
2.00
63339096--63339147
14
3.8
13
77
12
52
59
3
1
34
1.27
63343298--63343478
43
4.3
43
81
4
179
24
16
28
30
1.97
63343324--63343478
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1.8
85
87
1
231
24
18
28
28
1.98
63344896--63344976
41
2.0
40
82
7
99
61
2
22
13
1.43
63346565--63346608
20
2.2
20
84
8
54
36
9
4
50
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295