Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  1  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2526--2593
26
2.6
27
74
9
68
41
4
1
52
1.30
7469--7511
18
2.4
18
84
0
59
41
0
44
13
1.44
10685--10780
4
24.0
4
89
0
120
46
28
4
20
1.69
12905--12943
3
13.0
3
100
0
78
33
0
0
66
0.92
18131--18177
24
2.0
24
100
0
94
14
42
0
42
1.46
27766--27808
21
2.0
22
90
4
70
62
4
13
18
1.48
38345--38371
14
1.9
14
100
0
54
70
0
0
29
0.88
41889--42608
122
5.7
124
88
4
1031
40
11
19
29
1.86
41889--42608
251
2.9
251
94
3
1204
40
11
19
29
1.86
45930--46003
9
8.3
9
77
14
64
25
0
4
70
1.05
45930--45979
19
2.7
19
81
12
59
30
0
4
66
1.10
45924--45981
28
2.1
27
90
3
89
34
0
3
62
1.12
52234--52260
3
9.0
3
100
0
54
33
0
0
66
0.92
54622--54654
12
2.8
12
90
0
57
15
9
0
75
1.03
54622--54670
24
2.0
24
84
0
62
20
8
0
71
1.11
63236--63269
14
2.4
14
86
13
52
47
8
0
44
1.34
64442--64486
24
2.0
23
86
8
65
48
2
2
46
1.26
68318--68388
36
2.0
36
91
0
115
26
36
5
30
1.80
71675--71709
2
17.5
2
93
0
61
45
0
0
54
0.99
91334--91570
119
2.0
118
99
0
465
22
27
16
33
1.95
92502--92550
12
4.1
12
78
0
53
34
26
12
26
1.92
97463--97491
12
2.5
12
94
5
51
86
0
6
6
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108941--108998
25
2.3
24
82
8
62
46
0
3
50
1.18
108820--109023
88
2.3
91
87
3
297
46
3
4
46
1.40
108941--109066
47
2.6
49
72
11
123
44
2
3
50
1.31
109077--109275
66
3.2
65
66
20
163
42
2
6
48
1.40
109039--109336
120
2.5
120
93
1
499
43
1
5
49
1.34
109113--109296
59
3.1
59
66
20
164
42
1
7
48
1.40
109112--109299
61
3.1
61
67
14
181
43
1
6
48
1.39
109164--109215
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
109293--109334
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
109284--109325
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
109480--109570
45
2.0
44
87
6
130
35
28
4
31
1.77
109549--109585
16
2.3
16
100
0
74
27
35
0
37
1.57
110840--110896
16
3.6
16
75
15
57
31
0
3
64
1.10
114850--114915
29
2.2
31
81
13
75
37
1
12
48
1.50
143796--143828
17
2.1
17
88
11
52
54
27
6
12
1.60
150326--150377
19
2.7
20
91
8
81
36
1
5
55
1.35
161040--161151
29
3.8
30
75
10
113
26
15
16
41
1.87
179042--179090
15
3.5
15
72
16
59
6
4
26
63
1.36
179036--179090
27
2.0
27
100
0
110
7
3
25
63
1.37
182818--182865
23
2.1
23
100
0
96
54
4
12
29
1.56
183775--183819
6
7.5
6
100
0
90
66
0
0
33
0.92
185533--185632
49
2.0
49
94
0
173
22
18
24
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
191194--191391
101
2.0
101
92
0
333
21
28
15
34
1.94
196159--196190
11
2.6
13
80
19
50
12
0
9
78
0.97
202593--202635
19
2.3
18
81
18
52
18
4
6
69
1.29
205147--205172
13
2.0
13
100
0
52
38
7
0
53
1.30
211832--212017
93
2.0
93
100
0
372
36
18
7
37
1.79
214620--214645
13
2.0
13
100
0
52
46
0
7
46
1.31
217505--217533
14
2.1
14
100
0
58
51
6
0
41
1.28
218390--218435
24
1.9
24
90
0
74
58
0
4
36
1.18
219175--219204
12
2.5
12
100
0
60
93
0
6
0
0.35
221898--221939
18
2.3
18
83
0
57
57
2
4
35
1.33
222063--222129
28
2.3
30
78
14
79
41
5
11
40
1.66
222465--222508
21
2.2
19
92
8
70
63
0
2
34
1.07
237308--237443
67
2.0
67
94
0
236
27
22
11
39
1.87
243857--243909
18
2.9
18
80
5
54
50
1
3
43
1.30
256529--256584
10
5.6
10
76
16
53
42
0
0
57
0.99
256533--256606
26
2.7
27
78
14
82
45
0
0
54
1.00
258330--258397
31
2.2
32
83
2
84
42
13
7
36
1.72
258468--258536
22
3.2
21
72
17
54
27
4
2
65
1.26
262888--262952
23
2.9
23
72
9
62
38
7
9
44
1.65
263726--263786
6
9.8
6
85
7
86
49
14
1
34
1.54
263708--263786
26
3.1
25
77
10
81
49
17
1
31
1.55
263726--263786
16
3.7
16
82
4
68
49
14
1
34
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
271014--271060
21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
21
1.94
273967--274030
32
2.0
32
85
8
87
43
10
1
43
1.49
276808--276850
21
1.9
23
86
13
63
44
4
9
41
1.57
279250--279322
35
2.1
35
100
0
146
35
9
15
39
1.80
284857--284928
39
1.9
38
83
10
96
45
1
0
52
1.09
286630--286659
15
1.9
16
93
6
53
6
33
0
60
1.23
288459--288519
31
2.0
30
87
3
86
40
3
13
42
1.60
292799--292840
22
1.9
22
90
0
66
45
19
0
35
1.50
292799--292852
22
2.5
22
84
0
63
44
16
0
38
1.48
292818--292973
31
5.1
30
68
8
98
37
17
3
41
1.68
295188--295348
84
1.9
84
82
2
198
40
9
13
36
1.77
298298--298364
31
2.1
34
86
8
95
53
5
16
23
1.65
298705--298744
17
2.4
17
87
4
55
27
0
2
70
1.01
301260--301313
27
2.2
24
76
20
58
33
9
22
35
1.86
301268--301323
27
2.1
27
100
0
112
33
7
21
37
1.81
303785--303854
35
2.0
35
100
0
140
22
25
8
42
1.82
316719--316868
69
2.1
71
86
4
216
40
20
14
24
1.89
320488--320581
13
6.5
14
70
22
61
62
3
0
34
1.11
320493--320549
27
2.1
27
87
3
80
64
5
0
29
1.15
320491--320557
26
2.6
27
75
13
68
64
4
0
31
1.14
320535--320589
17
3.4
17
77
10
69
58
0
0
41
0.98
328087--328145
31
1.9
31
89
0
91
32
8
13
45
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
338923--338998
31
2.5
31
82
2
91
38
7
5
48
1.55
343790--343888
31
3.3
30
80
8
94
39
8
5
47
1.55
349221--349261
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
360458--360702
134
1.8
132
93
1
427
33
19
18
28
1.96
368147--368172
7
3.7
7
100
0
52
61
0
11
26
1.30
368146--368180
14
2.5
14
85
0
52
62
2
8
25
1.38
371200--372701
747
2.0
753
85
4
2069
26
19
19
33
1.96
381858--381883
7
3.7
7
100
0
52
61
0
11
26
1.30
381857--381891
14
2.5
14
85
0
52
62
2
8
25
1.38
385403--385434
15
2.1
15
100
0
64
40
15
12
31
1.85
390132--390172
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
394173--394355
93
1.9
95
85
4
255
25
11
19
43
1.84
394173--394355
95
1.9
93
85
4
251
25
11
19
43
1.84
394275--394500
122
1.8
124
79
7
264
28
11
15
44
1.81
399814--399852
18
2.2
18
90
4
62
66
5
0
28
1.12
402495--402520
13
2.0
13
100
0
52
61
0
15
23
1.33
409391--409416
7
3.7
7
100
0
52
61
15
11
11
1.57
411308--411356
22
2.2
22
82
7
55
55
0
8
36
1.30
411632--411728
29
3.2
29
72
18
81
43
14
8
34
1.75
417978--418002
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
419798--419855
29
2.0
29
82
0
71
41
6
17
34
1.76
421571--421618
25
1.9
25
100
0
96
37
16
22
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
425006--425071
28
2.2
30
84
7
82
59
9
0
31
1.29
426598--426624
2
13.5
2
100
0
54
0
48
0
51
1.00
430564--430641
39
2.0
39
100
0
156
33
20
12
33
1.91
433746--433778
16
2.0
17
88
5
50
6
21
9
63
1.45
438306--438363
26
2.2
27
87
3
82
20
15
15
48
1.81
442719--442788
34
2.0
35
97
2
133
42
8
17
31
1.79
462434--462470
12
3.0
13
84
11
51
29
40
18
10
1.85
464605--464677
39
1.9
37
83
5
92
52
2
2
42
1.30
464669--464703
18
2.1
16
89
10
52
65
2
0
31
1.07
474612--474652
20
2.0
20
85
0
55
53
2
4
39
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295