Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_A02 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  194  of  295  ( 35319 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66268544--66268647
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3
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28
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66268637--66268704
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2.4
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66268521--66268734
115
1.9
116
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288
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1.88
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20
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40
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21
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1.99
66297393--66297649
80
3.2
80
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378
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2.2
119
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348
25
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1.99
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20
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48
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1.23
66304478--66304543
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2.1
30
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13
80
4
15
4
75
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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66304524--66304584
13
4.5
13
74
20
54
14
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3
73
1.19
66306070--66306116
20
2.3
20
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1.91
66319942--66320013
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112
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13
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29
1.94
66319960--66320025
30
2.2
30
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55
10
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114
31
13
24
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
37
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1.03
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2.1
23
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100
0
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1.9
180
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1.63
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2.2
21
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0
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30
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1.45
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15
1.62
66361903--66361966
7
9.0
7
79
3
56
45
29
3
21
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66362138--66362438
41
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40
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4
298
24
19
16
38
1.93
66362149--66362387
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2.9
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85
3
270
24
21
15
38
1.92
66364560--66364605
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2.2
21
100
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1.97
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0
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13
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14
2.5
13
95
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57
15
6
0
78
0.93
66379456--66379499
22
2.0
22
95
0
79
34
4
36
25
1.76
66381693--66382054
181
2.0
181
93
0
625
32
7
36
23
1.82
66382614--66382644
16
1.9
16
93
0
53
38
3
0
58
1.15
66382613--66382656
16
2.7
16
82
3
52
43
2
2
52
1.26
66382757--66382842
7
12.0
7
82
8
75
31
47
0
20
1.51
66382756--66382899
14
10.1
14
74
7
110
35
42
1
20
1.61
66382756--66382829
21
3.5
21
86
0
103
29
48
0
21
1.50
66383242--66383305
7
9.0
7
79
3
56
45
29
3
21
1.67
66383471--66383772
41
7.4
41
83
3
315
25
20
16
38
1.92
66383471--66383772
83
3.7
81
81
4
329
25
20
16
38
1.92
66398097--66398162
33
2.0
33
82
8
80
33
16
22
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66400226--66400397
93
1.8
93
88
2
265
27
27
20
23
1.99
66400218--66400393
46
3.8
46
75
12
171
28
27
20
23
1.99
66401691--66401793
46
2.2
47
87
1
145
28
24
12
34
1.92
66403423--66403492
25
2.8
25
91
0
104
25
22
24
27
2.00
66404303--66404382
27
3.0
27
87
3
99
25
26
17
31
1.97
66404448--66404581
27
4.9
28
76
15
111
35
6
15
42
1.74
66404433--66404626
54
3.6
54
76
6
185
33
8
16
41
1.79
66404445--66404634
27
7.0
27
74
7
100
34
8
16
41
1.78
66404666--66404838
54
3.2
54
89
0
256
41
6
22
29
1.80
66404666--66404830
81
2.0
81
88
0
240
41
6
21
30
1.78
66404670--66404865
27
7.3
27
85
0
203
38
7
23
30
1.83
66404671--66404865
81
2.4
81
82
0
237
38
7
23
30
1.82
66415301--66415397
30
3.2
30
76
2
97
30
15
24
28
1.96
66416647--66416688
21
2.0
21
100
0
84
23
23
28
23
2.00
66430861--66430912
23
2.3
22
75
21
54
9
23
1
65
1.32
66436429--66436456
11
2.5
11
100
0
56
7
7
7
78
1.09
66441476--66441738
27
9.8
27
83
4
266
37
19
11
30
1.88
66441472--66441739
53
5.0
53
82
5
281
37
20
11
30
1.89
66441476--66441740
80
3.3
80
85
6
340
37
20
11
30
1.88
66443734--66443794
10
6.1
10
74
12
54
32
13
24
29
1.93
66443735--66443795
20
3.0
20
83
9
79
32
13
26
27
1.93
66446351--66446405
15
3.8
14
80
7
65
74
1
21
1
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66449766--66449826
10
6.1
10
74
12
54
32
13
24
29
1.93
66449767--66449827
20
3.0
20
83
9
79
32
13
26
27
1.93
66451898--66451932
18
1.9
18
88
11
54
22
20
0
57
1.41
66452830--66452881
16
3.5
15
82
17
65
5
15
5
73
1.22
66452845--66452921
13
5.6
13
76
13
66
12
9
5
72
1.25
66452808--66452881
30
2.6
28
81
8
94
9
14
5
70
1.32
66452860--66452926
28
2.4
28
76
2
80
14
7
2
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1.16
66458232--66458292
10
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10
74
12
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32
13
24
29
1.93
66458233--66458293
20
3.0
20
83
9
79
32
13
26
27
1.93
66460204--66460502
148
2.0
148
84
2
395
34
21
13
31
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          289   290   291   292   293   294   295