Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  2  of  295  ( 35319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
475092--475150
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2.0
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5
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0
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2
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2.0
135
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1.9
345
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0
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0
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18
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2.0
555
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40
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2.2
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2.0
28
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10
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5
50
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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151
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2
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575516--575580
21
3.2
21
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12
73
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10
1.86
575510--575598
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2.3
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39
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24
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15
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0
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0
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0
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0
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1.88
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30
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16
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17
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627236--627423
50
3.8
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187
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20
25
28
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627289--627372
26
3.3
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17
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627290--627426
51
2.8
49
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7
163
25
18
26
29
1.98
627243--627423
101
1.8
100
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5
251
25
19
25
29
1.98
627514--627565
27
2.0
26
81
11
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38
1
23
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2.0
15
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13
0
0
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17
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15
7
9
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1.41
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1.9
13
100
0
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2.0
26
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72
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13
24
1.90
652759--652810
24
2.2
24
89
0
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55
9
1
32
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
6
44
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32
2.0
32
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0
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7
47
1.48
657344--657437
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4.1
23
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0
125
48
4
24
22
1.68
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15
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52
55
0
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1.32
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1
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50
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0
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1.47
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2.7
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0
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17
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0
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0
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1
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1.40
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20
2.5
20
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0
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49
11
13
25
1.76
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2.0
27
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10
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0
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0
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18
1.67
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25
2.1
25
96
0
95
40
3
3
51
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
732118--732168
17
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17
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1
1
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1.08
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21
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21
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0
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1.9
17
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11
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0
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16
66
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0
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58
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21
1.9
20
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60
23
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10
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2.0
21
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0
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0
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0
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0
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17
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0
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51
0
0
48
1.00
764805--764915
47
2.4
47
83
6
145
35
22
16
26
1.95
765198--765226
15
2.0
15
93
6
51
58
13
0
27
1.36
765680--765704
4
6.2
4
100
0
50
0
24
0
76
0.80
769826--769865
22
1.9
20
85
10
53
15
12
12
60
1.60
783325--783376
23
2.3
23
80
6
61
44
5
5
44
1.52
785536--785655
48
2.5
48
86
2
154
36
14
21
27
1.92
814836--814974
44
3.2
44
66
15
124
28
25
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
814868--815005
43
3.2
43
67
8
134
28
21
23
25
1.99
814822--815157
88
3.9
88
88
3
439
30
22
22
24
1.99
814880--815018
44
3.2
44
67
8
138
26
21
23
28
1.99
814822--815220
88
4.6
88
85
5
393
31
22
22
23
1.99
815366--815410
23
2.0
21
87
8
63
28
17
33
20
1.95
815205--815584
195
2.0
192
86
6
543
30
18
23
26
1.98
815459--815574
41
2.7
41
82
6
124
25
19
25
29
1.99
815610--815653
21
2.1
21
87
8
63
36
25
34
4
1.76
819932--820005
29
2.5
29
86
4
94
50
14
14
20
1.78
826400--826429
7
4.4
7
91
8
53
73
0
0
26
0.84
826400--826429
13
2.2
14
94
5
53
73
0
0
26
0.84
841606--841656
19
2.7
18
76
8
57
25
5
5
62
1.41
842079--842129
2
25.5
2
100
0
102
50
49
0
0
1.00
844090--844137
24
2.0
25
92
8
82
29
29
14
27
1.95
848707--848732
6
4.3
6
100
0
52
50
19
0
30
1.48
857841--857907
29
2.3
29
89
0
107
47
8
10
32
1.69
859961--860045
41
2.1
41
100
0
170
30
18
2
48
1.61
863190--863463
28
9.8
27
72
7
138
25
28
17
29
1.97
863216--863409
56
3.5
56
91
0
298
25
27
17
29
1.97
863279--863463
84
2.2
84
85
3
257
26
29
15
28
1.96
866350--866418
29
2.3
31
83
14
83
57
2
4
34
1.33
866830--866898
20
3.4
19
73
15
57
44
0
2
52
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
875535--875627
18
5.2
18
93
0
159
31
17
24
26
1.97
875535--875627
36
2.6
36
98
0
177
31
17
24
26
1.97
877766--877802
14
2.6
15
83
8
51
40
0
0
59
0.97
882332--882372
20
2.0
20
100
0
82
46
14
14
24
1.82
883870--883931
33
1.9
31
87
9
88
41
12
1
43
1.53
893048--893081
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
897687--897720
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
901030--901090
30
2.0
32
87
12
92
26
6
0
67
1.15
900990--901105
44
2.7
44
79
4
110
25
6
1
66
1.24
900992--901096
15
7.1
15
71
20
69
24
5
1
67
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295