Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  232  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80401765--80401860
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19
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18
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19
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1
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4
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0
0
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0
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33
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0
2
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1.04
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19
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4
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0
0
56
0.99
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2.0
19
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30
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1.97
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0
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35
23
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103
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2
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30
20
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20
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1.98
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2.1
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2.0
55
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15
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49
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5
234
29
26
17
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
100
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1.98
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2.0
30
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30
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1.9
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24
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1.97
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56
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22
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1708
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27
29
1.87
80493199--80494326
47
23.6
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2
1611
34
8
27
29
1.87
80494177--80494298
22
5.3
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1.91
80496155--80496315
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1.99
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2.0
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2.2
22
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2.2
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92
0
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1
28
1.19
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5.6
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79
10
56
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2
13
0
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12
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17
69
16
58
79
0
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0.88
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2.5
24
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2
79
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1
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4
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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76
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1
22
0.86
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0
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2.3
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0
0
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18
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58
2
0
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20
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1.88
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50
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22
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1.99
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2.4
65
88
2
230
25
26
28
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80576188--80576329
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2.1
21
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5
2
40
1.37
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2.3
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0
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15
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1.83
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1.9
27
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1.62
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50
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0
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0
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48
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4
234
16
15
32
35
1.90
80637410--80637531
46
2.5
48
85
5
158
26
24
14
34
1.94
80640108--80640151
16
3.1
14
87
9
54
22
9
2
65
1.32
80640122--80640157
16
2.2
16
100
0
72
19
11
5
63
1.46
80640469--80640520
23
2.3
23
89
0
77
34
1
15
48
1.56
80640478--80640520
13
3.5
13
78
18
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34
2
16
46
1.60
80640476--80640522
23
2.0
23
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0
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2
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1.60
80643006--80643064
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23
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1
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27
1.22
80643166--80643208
22
2.0
20
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59
62
0
2
34
1.08
80643218--80643258
20
2.0
21
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4
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58
2
7
31
1.38
80643322--80643349
3
9.3
3
100
0
56
67
0
0
32
0.91
80645060--80646056
210
4.7
210
90
1
1541
30
21
18
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80654198--80654227
14
2.1
14
93
0
51
46
3
6
43
1.46
80658110--80658168
15
4.7
12
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22
50
67
3
0
28
1.06
80658152--80658214
23
3.0
20
78
21
51
65
3
6
25
1.32
80658283--80658339
15
3.9
15
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19
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59
1
1
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1.18
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22
2.0
20
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0
2
34
1.08
80658370--80658411
20
2.2
19
86
4
57
59
2
7
30
1.37
80658463--80658507
3
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3
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62
0
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1.15
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22
22
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1.99
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11
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2.3
23
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1
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3.5
13
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18
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2
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2.0
23
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0
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1.60
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2.5
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13
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2.5
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3
75
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25
2.00
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25
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25
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40
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40
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296
24
22
27
25
2.00
80681856--80682079
78
2.8
80
84
8
296
24
22
27
25
2.00
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23
2.3
23
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0
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0
15
50
1.45
80687717--80687759
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3.5
13
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18
65
34
0
16
48
1.46
80687715--80687761
23
2.0
23
100
0
94
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0
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4
15.2
4
76
17
60
23
4
0
72
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80689816--80689894
13
6.2
13
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76
25
3
0
70
1.03
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3.0
29
79
11
77
20
6
1
71
1.13
80689816--80689880
17
3.8
17
78
13
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23
4
0
72
1.03
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21
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10
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0
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1.11
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20
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0
0
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1.00
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0
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0
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0
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20
2.6
19
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12
66
38
0
0
62
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295