Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  66  of  295  ( 35319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19967291--19967331
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3.3
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0
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19986617--19986677
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1
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2.0
25
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2
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1.01
19990203--19990279
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3.6
20
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21
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27
2
1
68
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19990203--19990302
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1
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1.10
19990798--19990844
24
2.0
24
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2
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1.33
19992250--19992288
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1.9
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19993543--19993603
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2.2
28
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2
88
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0
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1.16
19993942--19993994
18
2.9
18
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58
3
0
37
1.16
19993959--19994008
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2.1
23
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2
0
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19995036--19995063
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1.9
109
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14
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2.0
22
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0
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39
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
17
25
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1.97
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1.9
129
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1.97
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17
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20043460--20044131
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151
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1
1154
57
7
6
28
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20043913--20043972
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2.2
27
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20050104--20050136
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16
100
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24
15
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16
100
0
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63
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0
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1.28
20050605--20050744
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12
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20050818--20050864
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1.9
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26
0
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0.97
20059940--20059997
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1
0
40
1.09
20065163--20065210
14
3.4
14
80
5
60
56
8
2
33
1.41
20072991--20073109
46
2.6
45
85
8
141
21
29
20
28
1.98
20075882--20075969
45
2.0
45
90
0
140
23
11
27
37
1.89
20083753--20083822
28
2.5
28
86
4
88
30
15
27
27
1.96
20088441--20088678
68
3.6
64
78
8
221
31
14
28
25
1.95
20094393--20094428
14
2.6
14
100
0
72
25
0
38
36
1.56
20103888--20104013
46
2.7
46
92
0
198
20
21
26
31
1.98
20108088--20108446
47
7.6
49
88
5
519
33
8
28
28
1.87
20108088--20108446
96
3.8
94
90
4
506
33
8
28
28
1.87
20112445--20112471
14
1.9
14
100
0
54
22
7
11
59
1.56
20129936--20130180
49
4.9
49
82
3
310
29
26
17
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20130827--20130887
30
2.0
30
84
6
79
31
24
8
36
1.85
20151453--20151485
14
2.3
15
89
5
50
15
0
18
66
1.25
20154631--20154892
39
6.7
39
92
2
402
30
29
21
18
1.97
20154965--20155037
28
2.6
28
88
0
110
28
21
9
39
1.85
20164798--20164911
58
2.0
58
82
5
142
30
25
17
26
1.97
20182055--20182094
21
2.0
20
85
14
55
50
12
0
37
1.41
20184487--20184549
25
2.6
23
73
11
63
22
25
20
31
1.98
20185591--20185635
21
2.1
21
95
0
81
28
22
31
17
1.97
20189099--20189126
9
3.1
9
100
0
56
21
46
0
32
1.52
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43
4.3
43
94
0
314
10
25
31
32
1.90
20195662--20195693
13
2.5
13
89
0
55
31
37
28
3
1.73
20196537--20196766
48
4.8
47
75
11
182
25
30
17
26
1.97
20196746--20196825
40
2.0
39
83
11
101
25
27
20
27
1.99
20201531--20201557
11
2.5
11
100
0
54
48
25
18
7
1.74
20204602--20204632
4
7.5
4
92
7
53
54
0
0
45
0.99
20205027--20205218
64
3.0
64
86
1
224
28
16
16
38
1.90
20208134--20208351
45
4.9
45
67
10
151
28
20
24
26
1.99
20208269--20208367
45
2.2
45
85
7
130
25
21
26
27
1.99
20208136--20208435
133
2.3
133
92
1
487
28
20
24
27
1.99
20208314--20208499
87
2.1
89
83
5
227
27
22
21
28
1.99
20208817--20208912
43
2.2
45
86
3
142
30
15
25
29
1.96
20208590--20209094
180
2.9
175
86
3
636
30
18
22
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20210846--20210874
14
2.1
14
100
0
58
17
0
0
82
0.66
20210867--20210925
31
1.9
31
82
3
75
32
8
5
54
1.53
20212696--20212750
20
2.7
20
85
5
65
40
0
0
60
0.97
20213687--20213722
17
2.1
17
100
0
72
41
5
22
30
1.76
20231600--20231772
27
6.4
27
87
0
229
36
20
19
23
1.95
20233459--20233561
46
2.2
48
85
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138
26
23
14
35
1.93
20235099--20235158
27
2.3
26
85
2
75
21
23
20
35
1.96
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23
1.9
24
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65
17
4
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20
1.56
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18
2.0
18
88
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54
17
17
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25
1.90
20260792--20260861
29
2.3
30
87
4
97
40
12
11
35
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295