Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  294  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Period
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1
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31
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99823099--99823228
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38
4
16
40
1.68
99835074--99835108
4
8.8
4
100
0
70
22
0
25
51
1.48
99835105--99835149
20
2.2
20
84
7
56
20
11
33
35
1.88
99835309--99835334
13
2.0
13
100
0
52
53
15
0
30
1.42
99839371--99839448
39
2.0
39
100
0
156
41
7
7
43
1.62
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61
2.0
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95
0
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13
19
36
1.90
99847917--99847946
15
2.0
15
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0
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13
20
33
1.91
99848820--99848862
17
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19
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7
54
18
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65
1.44
99851943--99851999
29
1.9
30
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3
98
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1.87
99854349--99854414
31
2.1
31
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10
82
45
0
0
54
0.99
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31
1.9
33
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6
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30
8
3
58
1.43
99871004--99871099
48
2.0
48
100
0
192
41
8
18
31
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99871220--99871275
28
2.0
28
100
0
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46
3
3
46
1.37
99871243--99871298
19
2.8
19
79
12
67
53
1
1
42
1.21
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19
2.1
19
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9
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57
0
0
42
0.98
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19
2.1
19
100
0
78
28
10
15
46
1.78
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1.9
30
85
0
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50
1
18
29
1.57
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18
2.2
18
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8
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42
2
0
55
1.13
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0
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0
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0
0
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0
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0
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0
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2.1
12
100
0
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2.0
55
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0
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12
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31
1.68
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30
2.1
30
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0
108
22
3
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57
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0
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32
1.76
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2.2
24
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0
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9
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1.43
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24
2.2
24
92
0
86
57
9
0
32
1.31
99924936--99924974
21
1.9
21
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5
62
7
7
7
76
1.15
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2.3
26
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11
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0
1
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1.10
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2.1
34
89
5
106
42
0
1
55
1.08
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3.5
21
87
5
103
38
0
2
58
1.12
99925074--99925196
56
2.2
57
78
8
135
40
0
2
56
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99925284--99925428
20
7.4
19
72
19
95
53
1
1
43
1.17
99925370--99925394
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1.9
13
100
0
50
60
0
0
40
0.97
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7
8.1
7
74
8
51
58
0
0
41
0.98
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20
5.9
20
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118
57
0
0
40
1.10
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20
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0
2
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1
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0
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2
0
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1.00
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45
4.7
43
75
15
173
27
16
30
25
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295