Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  261  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89796174--89796266
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19
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1
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1.17
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89796160--89796273
9
12.4
9
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66
2
1
28
1.15
89796674--89796755
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20.0
4
90
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29
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89834538--89835039
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3.5
143
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29
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2.1
21
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2.0
15
100
0
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6
20
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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26
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1013
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28
20
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1.98
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91
0
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297
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28
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30
2.0
30
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95
28
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30
1.97
89926567--89926612
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2.0
22
88
12
67
36
4
10
47
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
25
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7
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1.54
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0
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1.96
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1.96
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0.79
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5.6
10
93
0
76
10
0
8
80
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90002601--90002722
5
24.6
5
73
20
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18
0
4
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0.92
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55
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1
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2
23
1.32
90034421--90035188
382
2.0
383
85
1
1031
30
22
13
32
1.93
90039897--90039936
21
2.0
21
85
5
55
10
35
30
25
1.88
90044128--90044200
24
3.1
23
75
7
76
19
2
1
76
0.98
90044145--90044200
10
5.2
11
80
19
57
21
3
0
75
0.96
90045946--90046007
6
10.5
6
77
8
65
14
3
4
77
1.06
90045937--90046007
12
6.2
11
80
13
65
14
4
4
77
1.07
90045937--90046007
18
4.1
17
79
15
67
14
4
4
77
1.07
90046982--90047006
13
1.9
13
100
0
50
80
0
12
8
0.92
90047847--90047929
30
2.8
30
77
0
94
19
34
31
14
1.92
90054656--90054707
22
2.3
22
78
12
52
57
5
5
30
1.46
90054802--90054855
28
1.9
28
96
0
99
40
20
12
25
1.88
90058308--90058347
18
2.2
19
86
13
57
5
37
0
57
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90059540--90059620
38
2.1
38
97
0
153
24
6
32
37
1.80
90064207--90064251
17
2.6
18
82
3
56
28
0
4
66
1.11
90074222--90074271
25
2.0
25
88
7
75
26
2
2
70
1.09
90079524--90079921
126
3.2
125
84
3
512
30
17
13
38
1.88
90079994--90080076
35
2.4
35
84
9
109
40
16
3
38
1.66
90079982--90080076
33
2.8
33
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7
102
45
14
3
36
1.61
90080049--90080118
28
2.5
27
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68
40
18
2
38
1.66
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23
2.0
23
82
8
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22
0
31
46
1.52
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46
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0
423
40
14
23
21
1.90
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2.0
29
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6
80
44
1
0
53
1.11
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40
2.0
39
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11
108
43
15
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33
1.75
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40
2.0
40
100
0
164
50
10
9
29
1.70
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6
7.5
6
77
17
51
29
2
0
68
1.02
90111649--90111735
42
2.1
42
100
0
174
32
6
27
33
1.83
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28
1.9
29
82
7
69
46
7
1
44
1.41
90132447--90132496
24
2.1
24
100
0
100
50
24
0
26
1.50
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22
2.1
22
95
0
83
54
21
10
13
1.69
90136519--90136768
43
5.8
43
84
0
302
28
25
19
26
1.99
90137606--90137634
14
2.1
14
93
6
51
58
6
0
34
1.25
90141281--90141323
15
2.9
15
79
6
52
62
4
0
32
1.15
90145494--90145563
9
8.1
9
74
15
67
31
0
22
45
1.53
90145499--90145586
43
2.0
43
82
4
106
35
1
20
43
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90145508--90145576
33
2.0
35
88
5
106
33
1
21
43
1.62
90149523--90149593
28
2.5
28
80
8
74
29
30
15
23
1.95
90152950--90152999
14
3.4
15
75
10
50
30
0
18
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1.46
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41
2.6
42
88
4
150
21
16
25
36
1.94
90160730--90160779
14
3.4
15
75
10
50
30
0
18
52
1.46
90160881--90160990
42
2.6
42
97
0
202
20
19
26
33
1.96
90162839--90162900
7
8.6
7
72
13
54
27
0
22
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1.50
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36
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112
27
0
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1.51
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29
2.1
29
90
0
97
25
24
22
27
2.00
90163223--90163380
41
3.9
41
86
3
210
24
21
20
34
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          289   290   291   292   293   294   295