Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  41  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11737369--11737465
40
2.4
40
84
0
122
29
18
22
28
1.97
11737381--11737553
88
2.0
88
84
2
231
32
20
17
29
1.96
11737469--11737575
40
2.7
40
90
7
173
29
22
15
31
1.95
11739036--11739089
26
2.0
27
82
7
65
24
16
5
53
1.64
11746512--11746567
28
2.0
28
100
0
112
53
7
17
21
1.67
11754816--11754878
30
2.1
30
91
5
101
58
9
3
28
1.45
11754908--11754950
22
2.0
22
85
0
59
58
11
11
18
1.63
11754915--11754955
11
3.7
11
80
0
55
56
9
14
19
1.66
11765086--11765121
15
2.4
15
95
0
63
41
33
25
0
1.55
11765086--11765120
12
2.9
12
95
0
61
42
34
22
0
1.54
11771868--11771940
29
2.5
30
84
10
89
30
4
1
64
1.20
11773158--11773419
48
5.5
48
70
8
160
22
27
20
29
1.99
11773239--11773416
92
1.9
94
83
6
236
22
29
21
26
1.99
11780814--11781134
48
6.7
48
75
2
225
25
28
16
28
1.97
11780886--11781132
96
2.6
96
83
2
300
25
30
15
28
1.96
11783875--11783904
10
3.0
10
100
0
60
50
10
0
40
1.36
11784320--11784425
48
2.2
48
93
0
176
33
5
27
33
1.80
11786639--11786862
104
2.2
104
93
1
378
17
19
31
31
1.95
11786781--11786932
71
2.1
72
92
1
252
23
17
29
30
1.97
11794194--11794417
104
2.2
104
93
1
378
17
19
31
31
1.95
11794336--11794487
71
2.1
72
92
1
252
23
17
29
30
1.97
11796502--11796546
24
1.9
24
86
4
65
57
8
4
28
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11800709--11800768
20
2.7
21
75
15
59
50
0
1
48
1.11
11800874--11801013
74
1.9
74
80
0
163
41
11
17
29
1.85
11806268--11806339
37
1.9
37
97
0
135
27
23
12
36
1.91
11807811--11807878
33
2.1
33
94
0
118
22
17
17
42
1.89
11811903--11811936
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
11816531--11816564
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
11817744--11817768
3
8.3
3
100
0
50
32
0
32
36
1.58
11823707--11823750
21
2.1
21
95
0
79
52
25
9
13
1.70
11834834--11834902
10
7.3
9
73
15
59
34
1
2
60
1.20
11834829--11834893
28
2.3
28
81
5
78
33
1
4
60
1.27
11834852--11834915
19
3.3
19
78
12
60
34
1
3
60
1.22
11834846--11834901
18
3.1
17
78
12
58
37
0
3
58
1.15
11835708--11835761
24
2.2
24
83
0
72
14
9
1
74
1.15
11841210--11841391
46
4.0
46
87
1
231
40
14
23
21
1.90
11842243--11842294
26
2.0
26
96
0
95
42
1
19
36
1.62
11843708--11843785
36
2.2
35
81
2
84
57
2
1
38
1.20
11848938--11849386
221
2.1
217
82
7
543
40
11
18
29
1.86
11849821--11849890
19
3.6
19
68
28
58
4
25
8
61
1.43
11849816--11849897
40
2.0
40
100
0
164
8
26
9
54
1.61
11851138--11851173
17
2.1
17
100
0
72
27
5
5
61
1.41
11855455--11855494
19
2.1
19
85
0
53
70
0
7
22
1.12
11855574--11855622
19
2.6
19
78
12
55
69
0
6
24
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11865659--11865716
27
2.1
29
83
6
75
25
0
3
70
1.03
11865669--11865723
16
3.0
19
74
17
53
29
0
5
65
1.15
11866497--11866580
31
2.8
31
80
3
100
53
7
13
26
1.64
11869439--11869491
25
2.2
25
83
6
65
49
7
20
22
1.74
11870753--11870783
7
4.4
7
91
0
53
25
0
3
70
1.02
11874091--11874152
27
2.3
26
76
13
63
38
1
11
48
1.49
11880597--11880649
6
9.6
5
86
11
52
28
1
0
69
0.99
11880607--11880650
3
15.7
3
78
21
51
31
0
0
68
0.90
11882825--11883000
46
3.8
46
79
12
216
19
21
30
28
1.98
11882822--11882993
93
1.8
93
96
0
317
20
21
30
27
1.98
11886802--11886863
27
2.3
26
76
13
63
38
1
11
48
1.49
11890775--11890807
16
2.1
16
88
11
50
33
15
15
36
1.88
11892238--11892415
47
3.7
49
80
9
152
34
28
14
22
1.94
11892263--11892380
47
2.5
48
85
8
154
36
26
14
22
1.93
11892279--11892420
47
2.8
50
77
15
157
34
27
14
23
1.94
11893870--11893942
38
1.9
38
100
0
146
31
27
16
24
1.96
11896910--11896981
36
2.0
36
94
0
126
40
20
6
31
1.79
11902014--11902071
28
2.0
29
83
3
73
31
22
3
43
1.70
11902223--11902255
17
1.9
17
88
11
50
66
18
0
15
1.25
11907620--11907703
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
11920933--11921242
96
3.3
94
74
14
250
24
29
18
27
1.98
11920924--11921195
46
5.8
47
73
10
182
25
30
18
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11925628--11925665
17
2.1
19
85
9
53
34
0
2
63
1.09
11925575--11925711
65
2.1
65
95
0
247
37
3
4
54
1.38
11939863--11939901
13
3.0
13
80
0
51
35
2
23
38
1.68
11946771--11946847
31
2.5
31
93
0
127
38
12
6
41
1.69
11947061--11947127
31
2.2
29
81
5
71
32
8
13
44
1.75
11947156--11947196
20
2.0
20
85
0
55
46
4
2
46
1.37
11948556--11948593
20
1.9
20
84
10
51
65
0
26
7
1.19
11948703--11948752
25
2.0
25
88
7
75
78
0
8
14
0.97
11951171--11951204
12
2.8
12
90
0
50
67
0
0
32
0.91
11973241--11973277
18
2.1
17
95
5
65
75
10
0
13
1.04
11973208--11973316
50
2.2
50
91
3
175
64
10
3
22
1.40
11974597--11974684
33
2.7
33
89
0
131
23
38
12
25
1.90
11978014--11978188
76
2.3
75
87
5
246
50
10
4
33
1.58
11978014--11978188
39
4.6
39
80
14
195
50
10
4
33
1.58
11978087--11978119
16
2.1
16
94
0
57
60
12
3
24
1.46
11978096--11978155
13
4.6
13
69
8
50
56
8
3
31
1.45
11978053--11978188
42
3.4
40
77
17
149
52
10
4
33
1.55
11978163--11978292
16
7.6
16
65
19
66
60
13
2
23
1.45
11978197--11978253
22
2.7
21
84
10
64
70
15
0
14
1.18
11978197--11978349
31
4.5
32
69
18
112
64
15
1
18
1.39
11978132--11978343
104
2.0
104
100
0
424
60
13
2
22
1.46
11978473--11978529
23
2.5
24
80
8
73
1
33
0
64
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11978474--11978532
26
2.3
26
82
11
68
1
32
0
66
1.02
11994788--11994847
30
2.1
30
84
6
79
36
5
13
45
1.65
11994925--11995031
25
4.4
25
72
7
76
26
21
17
34
1.96
11995147--11995198
26
2.0
26
84
0
68
42
3
15
38
1.65
11999863--11999895
17
1.9
17
88
11
50
51
3
6
39
1.42
12000426--12000487
30
2.1
30
90
6
99
25
3
12
58
1.50
12000572--12000611
18
2.1
18
86
9
53
25
0
10
65
1.24
12008381--12008470
24
3.7
24
74
2
81
26
15
28
28
1.96
12012130--12012159
5
6.0
5
100
0
60
40
0
0
60
0.97
12016402--12016447
23
2.0
23
95
0
83
32
4
19
43
1.71
12017643--12017694
21
2.4
21
71
12
52
34
5
7
51
1.54
12022324--12022352
14
2.0
15
93
6
51
20
0
6
72
1.07
12032525--12032564
21
1.9
21
89
0
62
65
0
2
32
1.06
12032640--12032740
3
33.3
3
71
15
66
62
3
2
30
1.28
12032687--12032738
19
2.5
20
84
12
70
65
5
0
28
1.16
12035272--12035366
46
2.1
46
93
0
163
42
20
7
30
1.79
12038791--12038820
15
2.0
15
93
0
51
40
13
16
30
1.87
12043579--12043622
24
1.9
22
86
9
61
45
0
4
50
1.22
12048486--12048528
22
1.9
23
85
4
61
27
16
2
53
1.55
12053250--12053276
14
1.9
14
100
0
54
7
11
0
81
0.87
12055353--12055404
13
4.2
12
74
16
52
61
1
1
34
1.18
12055393--12055432
17
2.4
17
86
0
53
57
2
10
30
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12055368--12055437
15
4.5
16
74
10
65
57
1
8
32
1.38
12055367--12055456
15
5.9
15
74
8
56
61
2
6
30
1.34
12057600--12057721
60
2.0
60
85
0
163
28
17
21
32
1.96
12057623--12057768
60
2.5
60
81
3
161
30
19
19
30
1.96
12063082--12063133
10
5.8
9
78
19
56
65
0
1
32
1.04
12063088--12063132
18
2.6
17
82
6
63
66
0
0
33
0.92
12063090--12063294
9
22.0
9
68
17
57
58
1
2
37
1.23
12063109--12063174
31
2.2
29
78
10
71
60
0
3
36
1.12
12063223--12063290
29
2.4
27
83
9
82
55
2
1
39
1.24
12063866--12064256
9
41.6
9
65
21
112
31
2
3
62
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295