Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  39  of  295  ( 35319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11027218--11027250
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30
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48
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11039300--11039338
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2.2
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1.77
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0
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19
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11053282--11053371
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2.1
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25
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5.4
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4
55
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2
22
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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11106614--11106665
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0
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92
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1.91
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2.1
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2.0
21
100
0
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24
19
39
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2.0
138
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6
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2.2
31
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75
38
10
2
48
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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19
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4
0
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1.18
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0
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14
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61
1.54
11204672--11204733
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2.2
28
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16
14
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1.55
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12
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0
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2
5
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2.5
120
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1
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1.31
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2
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0
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67
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1.05
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5.6
42
74
8
140
35
25
11
26
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11227241--11227458
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11
27
1.90
11227382--11227517
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3.3
42
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6
134
33
30
11
24
1.91
11228203--11228582
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45
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22
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1.77
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113
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37
22
5
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1.77
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137
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37
22
5
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1.77
11228231--11228582
23
15.4
22
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10
253
37
22
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35
1.76
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22
2.2
21
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48
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0
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0
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30
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0
121
23
57
3
14
1.55
11236044--11236102
24
2.5
24
80
0
64
20
54
8
16
1.68
11261396--11261438
6
7.2
6
89
0
68
81
2
2
13
0.89
11270512--11270638
63
2.0
63
100
0
254
29
17
17
36
1.93
11271301--11271353
27
2.0
27
100
0
106
33
26
7
32
1.84
11273365--11273409
22
2.0
22
86
4
63
22
11
8
57
1.60
11277204--11277254
6
8.5
6
88
0
75
78
1
3
15
0.99
11288055--11288080
13
2.0
13
100
0
52
30
23
7
38
1.83
11291027--11291138
56
2.0
55
98
1
215
41
7
7
44
1.59
11300259--11300350
46
2.0
46
100
0
184
32
13
13
41
1.82
11303895--11303969
12
6.2
12
77
14
57
76
1
9
13
1.09
11303908--11303992
6
14.2
6
79
4
82
74
2
7
16
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11309905--11309937
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
11323653--11323702
25
2.0
25
100
0
100
40
16
4
40
1.67
11325207--11325333
28
4.6
27
79
11
134
29
15
27
27
1.96
11325208--11325333
54
2.3
56
81
12
145
29
15
26
27
1.96
11325182--11325331
82
1.8
81
91
1
246
30
17
25
27
1.97
11329590--11329623
17
2.0
17
100
0
68
41
5
17
35
1.74
11333474--11333636
10
17.1
9
69
19
82
60
3
3
33
1.30
11333474--11333636
19
8.6
18
69
19
82
60
3
3
33
1.30
11333500--11333536
16
2.2
16
90
9
56
64
2
0
32
1.07
11333480--11333568
18
4.8
17
72
22
65
60
2
1
35
1.16
11334119--11334225
19
5.7
19
72
6
76
30
2
3
62
1.27
11338148--11338219
30
2.4
30
83
0
99
23
29
30
16
1.96
11339596--11339760
46
3.6
45
77
11
149
27
18
30
23
1.97
11349998--11350106
46
2.3
46
92
1
173
35
12
15
35
1.86
11354812--11354846
5
6.6
5
87
12
52
17
0
0
82
0.66
11354812--11354846
11
3.3
11
96
4
63
17
0
0
82
0.66
11354812--11354846
16
2.1
17
94
5
63
17
0
0
82
0.66
11361207--11361339
67
2.0
67
98
0
257
45
9
8
36
1.66
11365663--11365710
19
2.6
18
81
15
53
18
0
4
77
0.93
11375049--11375235
52
3.6
52
91
0
275
26
16
27
28
1.97
11389257--11389380
45
2.8
45
85
4
162
40
12
22
24
1.89
11402983--11403032
10
5.0
10
85
9
75
22
8
2
68
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11404711--11404748
15
2.5
15
87
8
51
52
0
2
44
1.14
11404710--11404767
17
3.5
17
73
15
59
50
0
3
46
1.18
11409189--11409232
21
2.1
21
87
8
63
40
11
11
36
1.77
11411873--11411919
18
2.6
18
86
0
67
6
19
4
70
1.26
11417519--11417545
4
6.8
4
100
0
54
22
0
25
51
1.48
11418640--11418676
19
2.0
19
89
5
58
70
0
0
29
0.88
11418929--11418987
22
2.7
21
75
10
55
44
15
5
35
1.68
11418965--11419018
17
2.9
19
89
10
94
37
14
9
38
1.79
11419368--11419530
45
3.6
45
89
1
247
22
31
14
31
1.94
11419503--11419557
27
2.0
27
92
0
92
9
36
10
43
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295