Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  8  of  295  ( 35319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2486112--2486164
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2.0
26
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24
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1.69
2487620--2487771
70
2.2
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189
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1.71
2487759--2487789
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2.0
15
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2.1
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38
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2.3
23
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2.0
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50
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0
0
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0
0
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2.1
28
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0
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2.6
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1.72
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2.5
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33
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1.78
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2.2
36
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12
12
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7
132
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10
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2531814--2531850
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4.1
9
92
0
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40
24
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2.0
21
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0
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21
29
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2.1
15
100
0
64
37
12
6
43
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
0
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17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
2553136--2553164
12
2.3
13
88
11
51
75
10
6
6
1.17
2553139--2553164
12
2.2
12
100
0
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76
7
7
7
1.15
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3
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0
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2.0
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2.3
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2.2
24
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2.0
43
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2.1
26
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0
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2.1
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100
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3.0
17
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12
1
25
1.44
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7
5.4
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0
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17
52
53
0
2
43
1.13
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19
100
0
80
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17
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9
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1.9
21
85
10
55
35
20
27
17
1.95
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18
2.4
18
85
7
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25
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22
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21
2.0
21
95
0
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19
26
21
31
1.97
2648526--2648577
23
2.3
22
75
21
54
9
23
1
65
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2652701--2652750
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3.5
15
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2
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1.21
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1.9
30
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80
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0
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0
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1.18
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0
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20
25
20
1.97
2662704--2662818
55
2.1
55
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135
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20
24
20
1.96
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2.8
18
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60
0
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1.15
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31
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19
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149
28
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12
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1.92
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118
2.0
118
90
0
363
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30
1.96
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117
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21
24
20
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15
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0
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1.55
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11
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11
3.6
11
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0
53
20
10
10
60
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2707478--2707539
29
2.1
30
88
8
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25
3
9
61
1.42
2708638--2708672
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89
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0
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4.0
24
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26
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29
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5
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1.35
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0
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0
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0
0
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13
78
39
2
9
47
1.51
2744653--2744679
14
1.9
14
100
0
54
25
14
14
44
1.84
2746145--2746187
11
4.0
11
84
6
61
20
46
4
27
1.71
2746145--2746186
21
2.0
22
90
4
68
21
47
2
28
1.63
2746709--2746751
22
2.0
22
95
0
77
48
6
2
41
1.43
2757016--2757078
22
2.8
22
77
15
67
58
3
3
34
1.30
2757682--2757716
18
1.9
18
88
0
52
28
17
22
31
1.96
2759184--2759218
16
2.3
15
90
5
52
34
0
0
65
0.93
2763634--2763670
20
1.9
18
89
10
56
43
0
21
35
1.53
2764231--2764402
46
3.7
46
77
13
190
20
19
29
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2764224--2764394
93
1.8
93
91
0
279
21
20
29
29
1.98
2766978--2767142
46
3.6
45
79
7
165
26
20
29
23
1.99
2769953--2769989
20
1.9
18
89
10
56
43
0
21
35
1.53
2770542--2770712
93
1.8
93
91
0
279
21
19
29
30
1.97
2770551--2770720
46
3.7
46
78
13
195
20
18
29
31
1.96
2773288--2773336
16
3.1
16
82
5
55
10
2
12
75
1.13
2774679--2774745
33
2.0
33
100
0
134
26
14
14
43
1.85
2779466--2779535
37
1.9
36
85
2
95
58
4
14
22
1.53
2785369--2785420
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
2787323--2787374
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
2788487--2788515
3
9.7
3
100
0
58
68
0
0
31
0.89
2795222--2795253
13
2.4
13
94
5
55
40
40
0
18
1.51
2795852--2795903
25
2.0
26
85
10
72
61
9
0
28
1.27
2796745--2796798
25
2.2
25
90
6
83
31
0
1
66
1.02
2796760--2796815
17
3.2
17
78
12
60
35
0
0
64
0.94
2797393--2797614
122
1.8
122
92
0
372
29
14
10
45
1.78
2798425--2798467
16
2.7
16
86
10
61
53
4
0
41
1.21
2803063--2803112
12
4.2
12
73
14
50
38
4
8
50
1.51
2803043--2803112
35
2.0
35
91
0
113
40
2
5
51
1.40
2803239--2803270
13
2.5
13
94
0
55
56
0
3
40
1.15
2803632--2803725
38
2.5
37
77
5
98
27
15
21
35
1.94
2803665--2803746
38
2.2
37
86
6
112
25
17
21
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2809784--2809824
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
2816263--2816328
32
2.1
32
88
5
98
33
7
21
37
1.82
2822456--2822498
6
7.2
6
100
0
86
0
16
16
67
1.24
2822465--2822504
18
2.2
18
90
0
62
2
20
12
65
1.38
2824606--2824665
30
2.1
29
90
6
95
61
5
11
21
1.49
2825925--2826119
97
2.0
97
89
2
302
29
14
22
33
1.94
2834133--2834178
20
2.4
19
85
3
56
65
2
6
26
1.28
2834236--2834280
21
2.1
21
84
8
56
57
2
11
28
1.45
2834252--2834311
19
3.0
21
72
16
56
63
1
8
26
1.32
2834719--2834829
53
2.1
54
89
1
170
28
13
5
52
1.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295