Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  52  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14975418--14975468
3
16.0
3
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11
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62
5
0
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1.19
14975541--14975614
12
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12
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62
1
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1.26
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30
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0
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25
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1.69
14976597--14976899
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4.5
68
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4
355
28
22
23
26
1.99
14976597--14976899
136
2.2
135
85
5
407
28
22
23
26
1.99
14977017--14977959
87
10.9
87
89
2
1355
20
23
20
35
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7.1
132
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0
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16
32
1.96
14978887--14979118
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369
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15
26
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14978960--14979102
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18
131
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16
23
1.96
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8
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9
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0
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1
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30
1.20
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12
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1
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30
1.20
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3.2
18
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1
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1.20
14986007--14986092
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1
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1.16
14986573--14986658
30
2.9
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18
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24
7
52
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1.68
14987678--14987713
18
2.0
18
100
0
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16
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18
2.4
18
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34
13
20
31
1.92
14995013--14995062
23
2.1
24
88
3
75
54
2
0
44
1.11
14996152--14996267
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1.9
61
100
0
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40
14
12
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1.83
15002339--15002414
37
2.1
37
97
0
143
51
15
3
28
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15006110--15006136
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0
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18
0
0
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0.69
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3.2
16
82
12
63
26
0
5
67
1.12
15007073--15007127
18
3.2
17
82
5
67
27
0
5
67
1.12
15007204--15007250
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17
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0
0
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22
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100
0
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0
7
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21
2.1
21
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0
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43
2
0
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1.12
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13
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1.25
15027815--15027868
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15
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14
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7
4
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2.3
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22
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15057452--15057498
23
2.0
23
91
0
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25
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69
12
2
29
55
1.49
15058363--15058403
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3.2
13
76
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50
12
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56
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19
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0.88
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2.1
40
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125
33
17
26
22
1.96
15065897--15065939
21
2.0
21
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48
20
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1.50
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2.1
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76
47
26
0
26
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2.5
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2.3
59
82
8
152
25
24
20
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15072553--15072585
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2.2
15
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0
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60
0
0
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2.3
23
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58
5
0
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1.21
15072671--15072714
19
2.4
18
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54
40
9
0
50
1.34
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20
2.2
21
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56
24
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6
1.51
15086041--15086116
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12.7
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72
22
54
61
0
2
35
1.10
15086053--15086115
22
2.9
22
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0
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34
1.12
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0
3
35
1.11
15086071--15086139
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1.15
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35
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0
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0
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26
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1.09
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0
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15101328--15101443
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81
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0
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33
1.14
15101513--15101561
25
2.0
25
87
0
71
59
0
2
38
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15110329--15110380
27
1.9
27
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11
40
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15110455--15110532
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2.2
35
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120
35
10
11
42
1.75
15112252--15112312
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2.0
30
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22
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11
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39
0
0
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20
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6.4
5
92
0
55
37
0
3
59
1.13
15150404--15150460
15
3.9
15
88
2
89
35
0
12
52
1.39
15150832--15150918
21
4.0
23
80
10
92
14
21
25
37
1.92
15152024--15152053
12
2.5
12
94
0
51
0
20
0
80
0.72
15152027--15152058
16
2.1
15
94
5
55
0
18
0
81
0.70
15154633--15154880
131
1.9
135
95
3
459
37
10
17
34
1.84
15156765--15156797
15
2.2
15
89
10
50
75
0
0
24
0.80
15156903--15156949
24
2.0
24
87
4
69
57
2
2
38
1.23
15169241--15169357
36
3.2
36
87
1
162
40
30
11
17
1.85
15170021--15170067
20
2.3
20
100
0
94
53
21
4
21
1.63
15173540--15173661
22
5.3
22
62
21
61
25
29
11
33
1.91
15173512--15174246
47
15.6
47
92
2
1029
27
29
9
33
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15175509--15175687
85
2.1
85
97
0
340
26
27
8
37
1.85
15179939--15179979
21
2.0
21
85
0
55
31
0
4
63
1.15
15180122--15180181
27
2.3
25
78
13
68
36
15
3
45
1.62
15180394--15180433
20
1.9
21
85
10
55
57
17
0
25
1.40
15189882--15189934
21
2.5
21
96
0
97
9
20
16
52
1.71
15189890--15189930
12
3.7
12
75
18
52
9
19
19
51
1.74
15193100--15193149
24
2.1
24
100
0
100
32
16
12
40
1.84
15197580--15197608
9
3.2
9
100
0
58
20
0
31
48
1.50
15197697--15197749
26
2.0
26
92
0
88
35
13
5
45
1.67
15201252--15201291
21
2.0
21
85
5
55
15
40
25
20
1.90
15202794--15202853
30
2.0
30
100
0
120
43
20
13
23
1.86
15209383--15209648
46
5.7
47
71
12
165
27
19
30
22
1.98
15209568--15209690
49
2.5
49
86
5
169
30
19
26
23
1.98
15214500--15214601
52
2.0
52
90
0
159
50
20
10
17
1.75
15214849--15214873
7
3.6
7
100
0
50
60
0
12
28
1.32
15215245--15215383
7
20.1
7
93
5
239
69
0
29
0
0.93
15216381--15216450
28
2.5
28
90
2
106
24
20
21
34
1.97
15222586--15222621
8
4.4
8
89
3
54
58
0
0
41
0.98
15224439--15224479
20
2.0
20
90
0
64
19
36
31
12
1.89
15224644--15224689
24
1.9
24
100
0
92
26
2
28
43
1.66
15229852--15229883
16
1.9
17
93
6
57
56
0
0
43
0.99
15232038--15232090
26
2.0
26
100
0
106
22
3
22
50
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15232956--15233010
23
2.4
23
93
0
92
47
14
18
20
1.83
15240311--15240385
25
2.9
26
76
7
73
40
10
16
33
1.82
15242696--15242747
26
2.0
26
85
7
70
40
5
17
36
1.73
15244098--15244149
17
3.2
17
75
20
58
9
38
30
21
1.85
15247080--15247140
26
2.3
26
82
0
77
16
21
22
39
1.92
15247263--15247322
25
2.4
25
85
0
75
21
28
18
31
1.97
15253808--15253897
30
3.0
30
90
6
121
62
1
15
21
1.39
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17
3.2
17
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64
0
15
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1.29
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14
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14
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10
55
68
0
14
18
1.22
15254901--15254957
25
2.3
25
78
0
69
22
28
19
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295