Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  280  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95423520--95423551
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2.0
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0
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29
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3.5
47
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11
199
21
18
30
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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95511779--95511857
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10
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3.0
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20
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1.9
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2.0
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95522941--95522985
23
2.0
23
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40
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95527778--95527826
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2.0
26
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12
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2.0
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15
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2.2
31
81
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32
0
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58
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1.9
17
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5
59
29
0
5
64
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.50
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1.41
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2.0
27
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1.79
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2.1
22
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4
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2.9
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10
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44
1.77
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2.0
20
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12
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2.6
27
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1.61
95572911--95573072
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0
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0
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1.00
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20
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105
1.9
105
81
5
241
34
16
23
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95592776--95592823
26
1.9
26
87
8
73
29
0
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64
1.18
95601405--95601469
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9.0
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44
38
0
16
1.48
95601405--95601469
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14
86
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94
44
38
0
16
1.48
95601405--95601470
22
3.0
22
93
0
114
45
37
0
16
1.48
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28
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2
117
38
11
15
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1.83
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17
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56
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1.45
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2
88
0
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2
2
47
1.31
95626064--95626104
15
2.6
16
84
11
57
36
0
2
60
1.10
95626889--95626943
22
2.4
22
81
6
56
30
0
5
63
1.17
95639430--95640513
365
3.0
361
93
1
1857
28
24
17
29
1.98
95640895--95640937
20
2.2
20
100
0
86
32
25
13
27
1.94
95641186--95641243
18
3.2
17
80
9
62
72
0
22
5
1.04
95646285--95646322
20
1.9
20
94
0
67
60
0
28
10
1.30
95648532--95648561
12
2.5
12
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0
51
26
0
0
73
0.84
95649076--95649133
26
2.2
27
84
9
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58
1
0
39
1.08
95649111--95649165
13
4.2
13
80
17
60
58
1
0
40
1.09
95657149--95657190
7
6.1
7
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15
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42
0
0
57
0.99
95660375--95660494
58
2.1
58
100
0
240
36
5
13
45
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95663909--95663934
6
4.3
6
100
0
52
19
34
15
30
1.93
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14
2.0
15
93
6
51
55
3
0
41
1.17
95675903--95675952
26
1.9
26
84
8
66
30
6
6
58
1.46
95676494--95676547
26
2.2
24
80
12
56
55
0
1
42
1.10
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20
2.0
19
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14
53
28
0
2
69
1.02
95694191--95694228
12
2.9
14
76
15
53
60
0
0
39
0.97
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14
2.7
15
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11
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69
7
0
23
1.14
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13
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2
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50
6
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33
1.61
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11
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11
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0
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3
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1.42
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2.7
22
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6
0
45
1.29
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2.0
31
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49
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1.32
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2.1
17
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0
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1.74
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2.0
48
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0
156
20
8
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1.79
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6
4.7
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100
0
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0
0
85
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5
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1.46
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15
3.8
15
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0
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100
0
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0
0
40
0.98
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29
2.0
29
80
6
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54
5
0
40
1.23
95732301--95732385
38
2.2
39
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4
136
37
1
7
54
1.36
95740201--95740253
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2.0
27
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10
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37
1
13
47
1.54
95749884--95749908
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3.1
8
100
0
50
24
0
24
52
1.48
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16
4.7
16
71
12
55
64
2
33
0
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95750243--95750309
23
2.8
24
86
9
100
58
0
40
1
1.07
95750245--95750308
26
2.5
26
86
0
83
59
0
39
1
1.07
95750248--95750300
20
2.7
20
88
5
72
56
0
41
1
1.10
95750207--95750291
17
5.2
17
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2
35
0
1.08
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2.2
31
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23
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1.83
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2
0
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0.98
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0
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0
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0
0
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0
3
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1.17
95757437--95757536
36
2.9
34
77
14
105
42
2
1
55
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295