Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  277  of  295  ( 35319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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8
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1.53
94486762--94487825
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2.8
26
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.20
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1
2
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22
0
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0
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0
120
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21
33
35
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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17
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2.8
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15
15
22
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1.84
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0
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476
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13
2.8
14
88
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53
15
5
0
79
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94652486--94652582
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2.2
44
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10
108
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23
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29
1.97
94652657--94653043
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17
29
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15
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0
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3
7
29
1.40
94682544--94682654
41
2.7
41
97
0
204
18
22
27
31
1.97
94682995--94683045
22
2.3
23
77
16
63
27
1
25
45
1.64
94683062--94683142
34
2.4
34
85
6
101
23
1
33
41
1.62
94683294--94683335
16
2.5
17
92
7
68
54
0
0
45
0.99
94683528--94683568
21
1.9
22
90
5
66
24
0
36
39
1.56
94683795--94683841
23
2.0
23
92
8
78
65
4
0
29
1.11
94683844--94683928
39
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39
83
8
102
37
18
21
22
1.94
94684718--94684799
38
2.2
38
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4
112
20
15
8
54
1.67
94687516--94687700
43
4.3
43
90
0
264
23
20
31
24
1.98
94687455--94687700
86
2.9
85
83
3
255
22
19
28
28
1.98
94690187--94690348
89
1.8
87
82
5
209
29
17
24
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94690383--94690597
78
2.8
78
81
4
236
34
18
20
26
1.95
94695652--94695696
21
2.1
21
84
8
56
17
0
8
73
1.08
94695664--94695697
18
1.9
18
88
5
52
20
0
5
73
1.04
94696831--94696886
17
3.5
15
77
18
51
30
0
3
66
1.09
94697072--94697103
15
2.1
15
100
0
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31
6
6
56
1.49
94698443--94698493
22
2.3
22
86
6
68
37
15
19
27
1.92
94710318--94710356
21
1.9
20
85
15
53
28
35
28
7
1.85
94711196--94711228
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
94716918--94717216
149
2.0
149
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0
580
27
29
12
31
1.92
94727175--94727229
21
2.7
21
82
2
58
54
18
3
23
1.59
94739138--94739218
32
2.5
32
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0
99
19
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1.93
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40
2.0
40
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0
140
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11
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1.80
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1.9
17
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0
57
36
12
12
39
1.80
94767467--94767511
20
2.2
20
88
0
63
35
13
2
48
1.54
94768896--94768927
15
2.1
15
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0
55
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18
15
0
1.27
94770571--94770600
16
1.9
15
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6
3
16
1.18
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4.5
8
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3
54
68
0
0
31
0.90
94770769--94770803
17
2.1
17
89
10
54
60
0
14
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1.35
94784551--94784581
16
2.0
15
93
6
53
70
12
3
12
1.27
94784647--94784712
3
22.7
3
84
6
64
59
0
6
34
1.22
94784747--94784781
17
2.1
17
89
10
54
60
0
14
25
1.35
94792750--94792872
28
4.6
28
77
10
148
29
25
17
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94792804--94792894
23
3.7
23
68
13
74
26
30
17
25
1.97
94792776--94792896
51
2.4
51
98
0
233
27
29
17
25
1.97
94795375--94795477
37
2.8
37
96
0
188
24
32
20
23
1.98
94795618--94796339
48
15.0
48
95
0
1183
31
25
6
36
1.81
94799847--94799982
55
2.5
55
98
0
263
31
29
19
19
1.96
94800795--94801012
47
4.7
46
84
7
239
25
29
18
26
1.98
94800795--94801012
94
2.4
92
87
6
300
25
29
18
26
1.98
94807289--94807402
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1
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29
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18
1.95
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4.8
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189
24
28
18
28
1.98
94816341--94816463
43
2.9
43
85
4
160
28
26
17
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295