Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  189  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64894771--64894912
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1.95
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3.0
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230
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44
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30
13
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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2.9
29
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2
418
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26
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1.92
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3.2
19
73
8
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34
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15
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1.8
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92
0
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23
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1.83
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2.8
37
98
0
197
22
20
32
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1.99
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80
2.8
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193
27
27
20
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1.99
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27
27
20
23
1.99
65129964--65130147
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100
0
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25
16
12
45
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65152564--65152613
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18
2
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14
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4
72
1.26
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11
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2.4
31
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10
111
75
2
10
11
1.15
65167893--65167963
30
2.3
32
90
4
110
77
2
9
9
1.09
65168767--65168812
20
2.2
20
84
3
56
65
0
26
8
1.21
65168819--65168854
6
6.0
6
93
0
54
33
0
27
38
1.57
65178619--65178666
20
2.4
20
71
0
51
20
27
18
33
1.96
65182408--65182464
20
2.8
20
81
0
69
19
12
36
31
1.89
65186486--65186544
13
4.5
13
93
4
93
77
1
6
13
1.03
65186496--65186547
14
3.8
14
92
2
88
76
0
5
17
0.97
65203008--65203048
17
2.4
18
80
8
50
14
24
4
56
1.58
65202977--65203032
24
2.3
25
79
14
64
10
23
3
62
1.43
65205278--65205310
17
1.9
17
93
0
57
15
6
6
72
1.24
65205286--65205350
13
4.8
13
78
14
60
15
6
4
73
1.19
65205285--65205354
27
2.5
28
80
17
83
17
7
5
70
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65205301--65205350
14
3.6
14
73
10
50
14
6
4
76
1.13
65209814--65209910
30
3.2
30
68
8
81
27
28
14
28
1.95
65215089--65215133
9
4.9
9
86
5
63
13
2
2
82
0.86
65218152--65218195
22
2.0
22
95
0
79
34
4
36
25
1.76
65219817--65219913
30
3.2
30
71
8
90
27
14
28
28
1.95
65219877--65219975
41
2.4
41
96
1
182
24
12
35
28
1.91
65221110--65221206
30
3.2
31
71
11
94
28
27
15
27
1.96
65224245--65224291
20
2.3
20
85
0
67
21
12
36
29
1.91
65229415--65229440
9
2.9
9
100
0
52
11
0
0
88
0.52
65250717--65250748
16
2.0
16
93
0
55
21
9
6
62
1.47
65250830--65250861
11
2.8
12
86
13
50
18
6
0
75
1.01
65252850--65252948
41
2.4
41
94
1
173
24
12
36
27
1.91
65259756--65259796
15
2.7
16
74
11
50
7
26
0
65
1.18
65259954--65259992
15
2.4
15
87
12
51
10
20
2
66
1.33
65260968--65261025
12
4.7
12
87
8
89
17
0
6
75
1.01
65260968--65261025
26
2.3
25
93
3
98
17
0
6
75
1.01
65263654--65263749
30
3.2
31
71
12
94
28
28
15
28
1.96
65264978--65266155
588
2.0
589
97
0
2223
36
15
22
25
1.93
65268001--65268083
30
2.8
30
72
7
96
26
18
27
27
1.98
65270084--65270143
29
2.1
29
87
6
86
28
0
30
41
1.56
65275069--65275108
21
1.9
21
85
10
55
10
20
2
67
1.31
65276942--65276967
11
2.4
11
100
0
52
76
7
0
15
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65280882--65280906
13
1.9
13
100
0
50
16
12
16
56
1.68
65283050--65283167
55
2.1
55
84
6
159
25
22
13
38
1.90
65283790--65283844
20
2.8
20
88
0
83
29
16
29
25
1.97
65284730--65284759
16
1.9
15
93
6
51
43
33
3
20
1.68
65286286--65286318
13
2.5
13
95
0
57
12
3
6
78
1.04
65287372--65287489
55
2.1
55
84
6
159
25
22
13
38
1.90
65288113--65288167
20
2.8
20
88
0
83
29
16
29
25
1.97
65289434--65289490
30
2.0
28
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14
29
3
52
1.58
65290534--65290575
11
3.7
11
93
3
66
14
2
4
78
1.01
65290533--65290576
12
3.8
12
90
6
72
13
2
4
79
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295