Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  264  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90643193--90643296
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Indices
Period
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Copy
Number
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Matches
Percent
Indels
Score
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5
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
42
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90753224--90753431
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2
434
32
21
21
24
1.98
90803709--90804097
84
4.6
82
81
6
402
31
21
20
26
1.98
90803709--90804082
126
3.0
126
86
2
430
30
21
20
27
1.98
90804406--90804476
21
3.4
21
80
0
79
2
45
18
33
1.64
90808204--90808243
11
3.7
11
93
3
64
27
27
10
35
1.89
90810167--90810243
7
11.0
7
73
5
57
45
35
1
18
1.58
90810167--90810243
14
5.5
13
73
11
64
45
35
1
18
1.58
90810283--90810332
17
3.0
17
94
2
84
50
16
0
34
1.45
90810354--90810704
113
3.1
111
80
7
402
26
23
19
30
1.98
90810484--90810886
188
2.1
188
93
0
689
27
22
18
32
1.97
90810677--90811102
114
3.7
114
79
4
464
26
23
19
30
1.98
90812098--90812136
15
2.6
15
87
0
51
56
7
10
25
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90813105--90813144
17
2.3
18
91
4
64
60
5
0
35
1.19
90813067--90813199
72
1.9
68
87
6
194
53
9
3
33
1.50
90814642--90814768
66
1.9
65
87
4
184
22
20
14
42
1.88
90816111--90816135
12
2.1
12
100
0
50
44
0
8
48
1.32
90817152--90817190
20
2.0
20
84
0
51
66
2
2
28
1.18
90824403--90824474
33
2.2
33
100
0
144
36
16
11
36
1.84
90825286--90825314
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
90839745--90839785
3
13.7
3
100
0
82
34
0
0
65
0.93
90840576--90840658
39
2.1
39
97
0
157
31
24
0
44
1.54
90848293--90848340
13
3.5
13
76
23
53
0
29
0
70
0.87
90848293--90848326
12
2.8
12
91
8
52
0
26
0
73
0.83
90848300--90848385
10
8.0
11
68
18
56
2
20
3
73
1.10
90848302--90848369
17
3.9
17
76
17
68
0
20
4
75
0.98
90848417--90848463
5
9.4
5
95
0
85
59
2
0
38
1.09
90850026--90850070
6
7.3
6
82
2
54
13
17
4
64
1.44
90852434--90852486
25
2.1
25
100
0
106
30
18
18
32
1.96
90853184--90853222
21
1.9
20
84
5
51
35
2
5
56
1.35
90861582--90861660
11
7.5
11
68
13
58
68
5
2
24
1.22
90863454--90863547
45
2.1
46
82
6
111
35
18
20
26
1.95
90868240--90868402
81
2.0
83
83
4
206
50
4
17
27
1.64
90875923--90876024
4
26.5
4
70
16
56
68
5
1
23
1.22
90875967--90876024
27
2.1
27
84
6
73
74
3
1
20
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90877875--90877936
31
2.0
31
100
0
124
25
12
12
48
1.77
90885019--90885044
8
3.2
8
100
0
52
42
0
11
46
1.40
90886848--90886876
12
2.3
13
94
5
51
75
0
0
24
0.80
90889784--90889846
31
2.0
31
93
6
110
39
19
23
17
1.92
90895255--90895338
42
2.0
42
95
0
150
38
21
16
23
1.93
90912009--90912128
59
2.0
59
91
0
195
33
30
15
20
1.94
90913200--90913238
15
2.6
15
91
0
60
20
17
15
46
1.84
90917551--90917685
39
3.4
39
76
8
123
23
20
27
28
1.99
90919081--90919119
20
2.0
20
100
0
78
7
20
15
56
1.63
90920019--90920465
27
16.6
27
81
1
452
38
21
9
30
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295