Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  90  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28418573--28418601
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10
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0
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0
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20
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1.93
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1.99
28428155--28428267
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1.99
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14
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1.94
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4.7
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22
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5
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1.10
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0
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26
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25
16
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25
1.96
28497000--28497071
35
2.0
36
94
2
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5
22
30
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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17
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12
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2
50
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2.0
98
100
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0
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0
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20
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29
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21
1.98
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16
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28521322--28521399
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13
74
58
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16
10
1.62
28521333--28521408
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15
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1.8
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93
0
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28
20
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1.98
28524296--28524471
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3.8
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28
20
21
1.98
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4.0
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18
116
28
28
20
21
1.98
28532307--28532337
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1.9
16
100
0
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12
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53
3.6
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196
36
16
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51
0
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28544422--28544461
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2.0
20
100
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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97
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1.79
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22
25
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1.96
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20
51
57
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19
22
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28654730--28654795
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1.41
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2.0
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17
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0
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155
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24
15
1.93
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0
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18
18
15
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1.81
28673381--28673419
18
2.2
18
90
0
60
17
23
12
46
1.83
28674836--28674901
33
2.0
33
100
0
132
48
9
15
27
1.74
28675155--28675368
46
4.6
48
81
9
187
23
29
19
28
1.98
28675154--28675364
93
2.3
93
79
10
216
23
29
18
27
1.98
28681478--28681546
30
2.4
29
84
15
90
37
20
7
34
1.80
28681488--28681548
30
2.0
30
100
0
122
39
16
6
37
1.75
28682845--28683070
47
4.8
48
76
11
202
24
29
17
28
1.97
28682845--28683018
94
1.8
95
84
6
237
24
30
17
28
1.97
28682845--28683067
94
2.4
93
80
6
227
24
29
17
28
1.97
28684811--28684874
31
2.1
31
90
0
101
34
14
14
37
1.86
28685769--28685801
12
2.6
13
85
9
50
45
0
0
54
0.99
28686258--28686323
26
2.6
26
92
2
107
40
1
0
57
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28686281--28686323
15
3.1
15
75
25
58
39
0
0
60
0.97
28686277--28686337
26
2.3
26
88
0
86
39
0
1
59
1.08
28694679--28694733
27
2.0
27
100
0
110
21
21
10
45
1.82
28694683--28694743
27
2.3
26
88
5
88
24
22
6
45
1.76
28697092--28697134
23
1.9
23
85
4
61
67
4
0
27
1.10
28697406--28697452
10
4.6
10
78
10
51
65
2
2
29
1.15
28698776--28698800
12
2.1
12
100
0
50
48
8
8
36
1.62
28703960--28704016
30
1.9
30
88
0
87
38
7
24
29
1.82
28704645--28704802
47
3.4
48
77
9
130
35
20
24
20
1.96
28704858--28704940
42
2.0
42
97
0
157
34
12
25
27
1.91
28704900--28705095
108
1.8
108
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4
288
37
14
26
21
1.92
28704900--28705080
53
3.4
54
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6
206
35
14
25
23
1.93
28712985--28713085
29
3.5
29
90
1
150
29
28
14
26
1.95
28720806--28720906
29
3.5
29
90
1
150
29
28
14
26
1.95
28725259--28725287
12
2.3
13
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5
51
65
6
6
20
1.40
28730362--28730409
15
3.1
15
78
6
51
52
16
16
14
1.76
28734606--28734636
16
1.9
16
100
0
62
41
0
6
51
1.27
28747084--28747123
21
1.9
21
100
0
80
37
12
10
40
1.77
28747801--28747867
33
2.1
32
86
8
91
59
1
0
38
1.06
28757070--28757099
16
1.9
15
93
6
51
50
0
0
50
1.00
28759133--28759166
17
2.1
17
88
5
52
8
0
17
73
1.08
28762254--28762294
21
2.0
21
85
9
57
34
4
17
43
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28764093--28764159
22
3.1
22
86
2
100
22
31
31
14
1.94
28764885--28764934
25
2.0
25
92
7
84
22
18
28
32
1.97
28765644--28765694
25
2.0
25
92
0
84
25
29
5
39
1.79
28767749--28767787
20
2.0
20
89
0
60
38
10
2
48
1.51
28788351--28788431
42
1.9
42
100
0
162
43
16
9
30
1.80
28793614--28793651
19
2.1
19
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5
51
26
13
5
55
1.59
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34
1.9
34
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87
24
26
23
26
2.00
28813204--28813244
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2.0
21
90
0
64
12
29
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1.91
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19
2.0
20
84
5
51
47
5
10
36
1.61
28823075--28823241
46
3.6
46
76
15
157
29
19
28
23
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295