Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  190  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65290794--65290838
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3.2
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0
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71
64
0
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28
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42
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14
22
5
57
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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2.8
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27
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1.00
65348555--65348611
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27
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3.2
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2.1
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4
2
9
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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106
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26
16
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65395580--65395626
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1.9
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0
94
0.35
65403943--65404039
30
3.2
30
75
2
106
28
15
26
28
1.96
65404253--65404282
13
2.2
14
94
5
53
16
0
0
83
0.65
65412618--65412663
18
2.5
18
89
3
65
76
6
6
10
1.16
65412636--65412668
16
2.1
16
100
0
66
75
6
6
12
1.16
65414901--65414942
17
2.4
18
80
7
52
57
4
23
14
1.56
65420521--65420603
30
2.7
30
80
9
80
14
20
1
63
1.36
65420554--65420609
18
3.1
18
76
5
51
8
17
3
69
1.29
65420579--65420603
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
65420672--65420735
21
3.2
19
75
16
58
1
18
4
75
1.06
65420672--65420728
15
3.7
14
80
19
53
1
19
3
75
1.04
65420670--65420739
20
3.3
20
77
18
72
1
20
4
74
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65423243--65423339
30
3.2
30
71
8
90
27
15
28
27
1.96
65424171--65424218
15
3.3
15
73
5
53
29
0
27
43
1.55
65424165--65424208
14
3.1
14
74
6
52
27
0
34
38
1.57
65424165--65424224
29
2.1
29
93
0
102
28
0
30
41
1.56
65430095--65430146
23
2.3
22
75
21
54
9
23
1
65
1.32
65430104--65430158
12
4.6
12
73
15
51
12
23
0
63
1.29
65433107--65433131
13
1.9
13
100
0
50
16
4
16
64
1.44
65444098--65444155
10
5.7
10
76
11
64
29
27
13
29
1.94
65444098--65444158
20
3.0
20
83
9
79
27
26
13
32
1.93
65450817--65450871
20
2.8
20
88
0
83
25
29
16
29
1.97
65453543--65453576
12
2.8
12
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0
50
44
0
38
17
1.49
65455236--65455281
18
2.5
19
75
13
51
58
6
0
34
1.24
65455472--65455539
30
2.2
32
80
15
81
30
19
30
19
1.96
65456328--65456423
30
3.2
29
73
2
84
27
26
16
30
1.97
65458073--65458107
13
2.7
13
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0
52
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11
0
5
0.82
65459016--65459081
21
3.1
20
79
14
62
78
4
15
1
0.98
65459027--65459083
5
11.0
5
78
10
53
78
3
15
1
0.96
65459031--65459079
26
1.9
25
84
12
64
79
4
14
2
0.97
65459152--65459222
30
2.4
31
81
11
85
61
1
22
14
1.40
65461767--65461805
15
2.4
15
87
12
51
66
2
20
10
1.33
65463279--65463333
20
2.8
20
88
0
83
25
29
16
29
1.97
65465997--65466030
12
2.8
12
81
0
50
44
0
38
17
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65467782--65467827
18
2.5
19
75
13
51
58
6
0
34
1.24
65468875--65468969
30
3.2
29
72
3
82
27
25
16
30
1.97
65471540--65471605
21
3.1
20
79
14
62
78
4
15
1
0.98
65471551--65471607
5
11.0
5
78
10
53
78
3
15
1
0.96
65471555--65471603
26
1.9
25
84
12
64
79
4
14
2
0.97
65471676--65471746
30
2.4
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11
85
61
1
22
14
1.40
65473955--65474052
30
3.3
30
69
4
81
28
26
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29
1.96
65477016--65477060
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3.3
14
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0
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15
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44
25
0
29
1.54
65479680--65479776
30
3.2
30
76
2
97
29
14
25
29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295