Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  293  of  295  ( 35319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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49
1.37
99164587--99164629
15
2.8
16
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44
0
2
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1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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107
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201
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0
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51
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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2.3
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187
28
14
15
40
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99395219--99395266
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27
3
41
1.72
99433660--99433745
34
2.5
34
75
14
86
61
3
3
31
1.29
99434752--99434862
27
4.1
27
82
0
132
14
27
21
36
1.92
99434752--99434862
54
2.1
54
89
0
168
14
27
21
36
1.92
99436903--99436928
13
2.0
13
100
0
52
23
0
15
61
1.33
99446033--99446143
47
2.4
47
81
6
136
36
22
15
26
1.94
99453012--99453054
22
2.0
22
90
0
68
34
2
16
46
1.60
99456740--99456782
22
2.0
22
90
0
68
34
2
16
46
1.60
99459562--99459627
22
3.0
22
71
4
62
39
6
4
50
1.48
99467284--99467321
12
3.2
12
81
7
51
71
2
0
26
1.00
99468009--99468049
22
1.9
21
95
5
73
43
7
4
43
1.53
99472107--99472137
11
2.8
11
95
0
53
41
0
0
58
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99479646--99479683
20
1.9
20
88
0
58
36
2
13
47
1.56
99480360--99480392
16
1.9
18
88
11
52
33
0
0
66
0.92
99484260--99484338
31
2.5
31
85
4
97
45
21
12
20
1.84
99489348--99489425
28
2.8
27
77
9
68
30
5
0
64
1.15
99489920--99489967
23
2.0
24
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11
64
62
4
2
31
1.26
99495499--99495542
22
2.0
22
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0
52
40
6
0
52
1.28
99497072--99497135
16
3.9
16
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6
67
56
14
0
29
1.39
99497606--99497674
29
2.3
30
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12
79
52
8
13
26
1.69
99507711--99507737
6
4.5
6
100
0
54
29
37
14
18
1.91
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505
3.1
505
98
0
3042
39
20
12
27
1.89
99510742--99511027
138
2.1
137
81
7
328
37
18
8
36
1.80
99516799--99516840
20
2.2
19
86
4
57
42
0
0
57
0.99
99521202--99521780
144
4.2
142
81
10
601
34
21
16
27
1.95
99527600--99527642
6
7.2
6
89
0
59
6
13
62
16
1.51
99528810--99528839
15
2.0
15
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0
51
70
6
3
20
1.25
99530338--99530382
23
1.9
23
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4
54
33
6
0
60
1.23
99530452--99530490
19
2.0
20
90
5
62
17
2
10
69
1.28
99530471--99530516
25
1.9
23
86
8
65
28
0
8
63
1.24
99531508--99531561
3
18.3
3
76
3
56
62
0
3
33
1.12
99531653--99531683
15
2.1
15
100
0
62
61
0
6
32
1.21
99531985--99532024
20
2.0
21
85
5
55
57
2
12
27
1.48
99534780--99534842
30
2.1
30
100
0
126
28
9
34
26
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99540437--99540484
7
6.7
7
80
4
51
77
0
0
22
0.78
99554963--99555390
210
2.0
209
96
0
793
25
14
15
44
1.84
99558427--99558451
7
3.6
7
100
0
50
12
0
28
60
1.32
99563205--99563675
231
2.0
232
84
2
613
21
26
17
35
1.95
99571171--99571208
15
2.5
15
91
0
58
36
0
10
52
1.36
99571587--99571651
23
2.9
23
77
6
80
15
20
26
38
1.92
99571813--99571853
19
2.2
19
87
12
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46
0
24
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1.53
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4
100
0
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24
0
24
1.48
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2.1
71
90
2
232
25
15
26
31
1.96
99598718--99598759
21
2.0
22
86
9
61
59
0
2
38
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295