Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  263  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90428015--90428076
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2.5
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2.0
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1
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2.4
181
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20
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28
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18
2.4
18
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0
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45
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4
27
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90496426--90496469
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1.9
23
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9
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38
6
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1.27
90522156--90522232
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1.14
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0
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10
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56
1.12
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17
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51
20
0
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74
1.01
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2.3
23
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12
63
38
0
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58
1.17
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2.0
32
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3
103
35
0
1
62
1.05
90556124--90556190
22
3.2
20
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35
1
1
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1.15
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18
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16
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0
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46
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2
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1.35
90556300--90556444
22
6.6
21
66
14
60
42
0
2
54
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
2
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10
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0
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1.00
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14
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31
0
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65
1.05
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13
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13
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31
0
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1.15
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2.4
33
78
12
85
33
0
3
62
1.13
90556533--90556612
24
3.3
24
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6
101
37
0
3
58
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14
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50
34
0
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59
1.22
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0
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4
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6
1.00
90556983--90557034
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10
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0
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2.5
26
82
4
71
68
7
4
19
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90563456--90563494
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2.2
18
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1.20
90565717--90565810
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3.8
24
81
5
91
37
13
19
29
1.90
90565748--90565823
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3.0
24
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98
35
17
17
30
1.92
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6.0
60
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391
34
16
16
33
1.91
90565774--90566161
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2.1
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15
33
1.91
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176
21
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1.87
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0
0
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0
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90572101--90572151
22
2.4
22
80
9
61
35
0
3
60
1.15
90572093--90572118
9
2.9
9
100
0
52
42
0
0
57
0.98
90572101--90572151
21
2.4
21
80
9
59
35
0
3
60
1.15
90572282--90572324
14
3.1
14
76
3
52
67
0
0
32
0.91
90572285--90572385
27
3.6
28
78
13
102
67
1
0
30
1.02
90572329--90572385
9
5.9
9
82
13
69
66
3
0
29
1.08
90572285--90572385
30
3.6
29
80
10
113
67
1
0
30
1.02
90572443--90572520
21
3.8
19
84
15
102
60
0
1
38
1.05
90572481--90572580
33
3.0
33
91
5
148
57
1
1
41
1.12
90572442--90572583
54
2.6
55
77
12
159
57
0
1
40
1.12
90572443--90572583
21
6.5
21
72
22
89
57
0
1
40
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90572634--90572658
12
2.1
12
100
0
50
84
0
0
16
0.63
90572676--90572771
45
2.1
47
90
3
151
69
2
18
9
1.25
90572666--90572783
45
2.6
44
79
9
132
68
2
16
11
1.31
90573077--90573105
11
2.7
11
94
5
51
6
13
0
79
0.93
90577433--90577486
6
9.0
6
100
0
108
66
0
0
33
0.92
90583297--90583474
46
3.8
46
76
12
195
29
30
19
20
1.97
90583306--90583476
93
1.8
93
92
2
290
29
30
19
20
1.97
90585917--90585983
33
2.0
33
94
0
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26
20
11
40
1.88
90588239--90588291
6
8.3
6
78
12
52
75
1
1
20
0.99
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21
2.1
21
91
0
70
75
2
2
20
1.03
90588239--90588291
21
2.8
18
83
11
61
75
1
1
20
0.99
90589957--90589982
11
2.4
11
100
0
52
73
0
7
19
1.07
90589964--90590014
9
5.4
9
77
13
50
64
1
9
23
1.34
90594142--90594199
30
1.9
30
89
0
89
24
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17
1.96
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2.0
39
87
0
111
38
16
17
26
1.92
90614179--90614315
39
3.5
39
86
0
184
12
21
23
42
1.87
90616938--90617006
35
2.0
35
100
0
138
23
20
8
47
1.77
90618485--90618521
15
2.5
15
95
0
65
10
29
18
40
1.85
90625841--90625868
11
2.5
11
100
0
56
28
39
7
25
1.82
90625957--90626072
58
2.0
58
96
0
214
35
18
12
34
1.87
90627965--90628163
50
3.8
51
82
8
217
21
28
24
26
1.99
90628258--90628289
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90628501--90628558
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
90635505--90635753
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
26
1.99
90635504--90635753
100
2.4
104
88
6
357
20
29
24
26
1.99
90635848--90635879
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
90636091--90636148
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
90639374--90639404
13
2.3
14
94
5
55
22
0
12
64
1.27
90639377--90639458
30
2.7
30
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3
121
23
2
13
60
1.44
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2.3
17
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23
10
12
53
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3.9
45
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3
210
27
13
25
33
1.93
90641427--90641590
90
1.8
89
86
1
238
27
12
25
34
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295