Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  230  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79519885--79519986
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79522634--79522738
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20
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2.0
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14
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2.7
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28
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30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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20
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26
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0
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52
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
47
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79703379--79703441
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1
24
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15
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31
1.35
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3
27
1.27
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2.1
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1.13
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22
2.4
24
85
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80
55
1
3
39
1.28
79717716--79717780
22
3.0
22
84
8
71
43
16
23
16
1.88
79726908--79726948
19
2.1
19
86
4
55
63
9
2
24
1.37
79731379--79731423
21
2.1
21
95
0
81
46
13
2
37
1.55
79734565--79734609
17
2.6
17
89
6
65
44
0
6
48
1.29
79735047--79735080
17
2.0
17
88
0
50
50
0
2
47
1.16
79736011--79736047
13
2.5
15
87
12
51
45
0
2
51
1.15
79740500--79740551
26
2.0
26
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0
86
53
5
7
32
1.53
79745711--79745739
14
2.0
15
93
6
51
48
3
0
48
1.18
79752123--79752215
46
2.0
46
95
0
168
40
13
5
39
1.68
79752140--79752214
25
3.2
25
68
27
81
38
16
6
38
1.74
79752589--79752616
11
2.5
11
100
0
56
7
7
7
78
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79760489--79760535
22
2.1
22
84
0
58
31
4
8
55
1.49
79767352--79767789
221
2.0
220
87
1
635
40
19
13
25
1.88
79770290--79770319
14
2.1
14
93
0
51
63
0
10
26
1.26
79770323--79770365
14
3.2
14
87
6
63
72
0
2
25
0.97
79770369--79770427
30
1.9
30
86
6
82
57
3
0
38
1.15
79771928--79772234
135
2.3
135
88
0
443
27
20
20
31
1.98
79772116--79772324
90
2.3
90
91
1
339
27
22
22
27
1.99
79784314--79784344
14
2.2
14
94
0
53
64
0
9
25
1.24
79784349--79784403
18
3.1
17
79
10
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65
3
3
27
1.26
79784392--79784450
30
1.9
30
82
6
73
55
5
0
38
1.22
79784705--79784763
23
2.6
23
83
5
66
69
1
8
20
1.23
79790708--79791119
48
8.7
47
78
5
407
24
26
19
29
1.98
79790708--79791119
96
4.3
96
82
4
451
24
26
19
29
1.98
79796234--79796269
18
2.0
18
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10
56
41
13
22
22
1.89
79805656--79805843
42
4.5
42
82
2
216
32
17
22
28
1.96
79817864--79817893
12
2.5
12
94
0
51
26
23
43
6
1.78
79823146--79823174
9
3.2
9
100
0
58
55
0
24
20
1.44
79825813--79825870
26
2.2
26
90
0
89
43
20
24
12
1.86
79841600--79842202
294
2.1
294
99
0
1197
19
27
26
26
1.99
79843068--79843281
46
4.6
47
76
13
192
24
29
18
27
1.98
79843615--79843672
30
1.9
30
96
0
107
25
29
15
29
1.96
79847626--79847655
15
2.0
15
93
0
51
60
10
13
16
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79849699--79849751
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
79852195--79852230
17
2.1
17
94
0
63
11
8
22
58
1.59
79857326--79857575
53
4.8
54
77
12
229
21
24
17
37
1.94
79860602--79860729
66
1.9
66
88
0
193
42
13
13
31
1.82
79862374--79862632
73
3.5
73
99
0
509
27
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40
1.79
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3
10.7
3
100
0
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0
0
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0.90
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2.5
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98
0
354
28
6
24
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1.79
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2.0
21
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18
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21
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5.6
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7
216
25
21
27
25
1.99
79895753--79895930
79
2.2
80
82
3
200
25
21
28
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          289   290   291   292   293   294   295