Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  295  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99984309--99984476
40
4.2
40
83
4
106
25
27
23
23
2.00
99984332--99984476
40
3.6
40
85
4
193
23
26
24
25
2.00
99992296--99992463
40
4.2
40
83
4
106
25
27
23
23
2.00
99992319--99992463
40
3.6
40
85
4
193
23
26
24
25
2.00
99996890--99996989
50
2.0
50
100
0
200
26
20
16
38
1.92
99999612--99999782
93
1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
99999607--99999779
46
3.7
46
80
13
219
28
28
21
21
1.98
100007167--100007337
93
1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
100007162--100007334
46
3.7
46
80
13
219
28
28
21
21
1.98
100015272--100015331
30
2.0
30
93
0
102
28
26
8
36
1.85
100022964--100022991
12
2.3
12
100
0
56
7
7
32
53
1.55
100022997--100023088
39
2.3
40
85
5
125
35
20
18
25
1.95
100022997--100023129
40
3.4
39
75
10
126
33
22
18
25
1.96
100023841--100023881
14
2.9
15
85
7
59
19
2
43
34
1.64
100024060--100024104
14
3.2
14
87
0
63
22
0
28
48
1.50
100024123--100024176
7
7.6
7
85
4
72
20
0
27
51
1.47
100024128--100024176
14
3.4
14
94
2
80
18
0
30
51
1.47
100024171--100024203
14
2.3
15
89
5
50
15
3
45
36
1.61
100024782--100024907
19
6.9
19
84
10
183
36
11
15
36
1.84
100024790--100024907
35
3.3
35
93
3
191
36
12
14
36
1.84
100025383--100025448
17
3.9
17
71
23
59
34
1
0
63
1.04
100025425--100025473
26
1.9
25
83
4
62
36
4
0
59
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100031243--100031285
13
3.5
12
87
12
61
83
0
13
2
0.74
100031247--100031294
21
2.3
20
86
10
62
79
0
16
4
0.89
100032168--100032340
44
3.9
44
75
5
152
32
16
23
27
1.96
100032335--100032928
119
5.0
119
93
0
990
33
18
18
29
1.95
100032852--100033311
83
5.5
83
95
1
816
31
20
21
26
1.97
100035092--100035268
27
6.6
26
83
5
185
27
15
28
28
1.96
100035092--100035268
54
3.3
54
82
7
207
27
15
28
28
1.96
100035093--100035247
81
1.9
81
86
5
224
27
16
28
28
1.97
100035089--100035268
81
2.2
81
82
3
220
27
16
27
28
1.97
100035174--100035279
27
3.9
27
86
0
77
26
15
28
30
1.96
100043187--100043362
27
6.5
26
80
5
156
26
16
27
28
1.97
100043186--100043362
54
3.3
53
77
12
173
27
16
27
28
1.97
100043187--100043341
81
1.9
81
86
2
222
27
16
27
28
1.97
100043183--100043362
81
2.2
81
82
2
218
27
16
27
28
1.97
100046977--100047019
20
2.2
20
83
8
52
46
2
16
34
1.60
100047079--100047124
21
2.2
20
81
7
56
52
0
13
34
1.40
100048820--100048987
46
3.7
44
78
10
178
22
22
27
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295

The End!