Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  193  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66026680--66026776
30
3.2
30
75
2
106
28
15
26
28
1.96
66029825--66029888
23
2.8
22
74
23
60
10
21
1
65
1.32
66033768--66033798
12
2.6
12
100
0
62
25
16
12
45
1.83
66033859--66033908
6
8.2
6
81
16
50
2
20
2
76
0.99
66033848--66033918
37
1.9
37
86
11
101
2
18
2
76
1.04
66033844--66033904
16
3.8
16
77
14
63
3
19
1
75
1.03
66036600--66036696
30
3.2
30
75
2
106
28
15
26
28
1.96
66043894--66044075
27
6.7
27
86
5
244
25
15
17
40
1.90
66043898--66044074
81
2.2
82
90
6
281
24
16
18
40
1.90
66048458--66048535
21
3.4
23
74
8
70
26
2
30
39
1.70
66048494--66048560
21
3.1
21
82
4
80
29
2
32
34
1.73
66055073--66055123
12
4.0
12
87
7
66
15
5
1
76
1.07
66055388--66055465
21
3.4
23
74
8
70
26
2
30
39
1.70
66055424--66055490
21
3.1
21
82
4
80
29
2
32
34
1.73
66063580--66063633
20
2.7
20
82
0
63
24
20
18
37
1.94
66063580--66063653
30
2.5
30
86
8
98
21
20
18
39
1.93
66063580--66063644
20
3.2
20
71
16
53
23
21
16
38
1.93
66069570--66069717
38
3.9
38
87
0
215
33
25
20
20
1.97
66070506--66070609
42
2.5
42
96
1
190
32
11
14
41
1.82
66070592--66070636
14
3.3
14
81
6
56
35
0
13
51
1.41
66071609--66071668
29
2.1
29
93
0
102
41
30
0
28
1.56
66071615--66071662
15
3.3
15
73
5
53
43
27
0
29
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66074792--66074835
22
2.0
22
95
0
79
34
4
36
25
1.76
66079691--66079787
30
3.2
30
77
2
106
28
16
26
27
1.97
66081873--66081955
30
2.7
30
81
9
89
12
21
1
65
1.33
66082037--66082086
6
8.2
6
81
16
50
2
20
2
76
0.99
66082026--66082096
37
1.9
37
86
11
101
2
18
2
76
1.04
66082022--66082082
16
3.8
16
77
14
63
3
19
1
75
1.03
66083929--66083991
21
3.0
21
88
2
81
33
31
4
30
1.78
66086331--66086427
30
3.2
30
76
2
97
30
16
25
26
1.97
66086597--66086691
38
2.5
38
82
3
120
31
23
18
26
1.98
66091118--66091226
30
3.6
30
73
0
83
27
15
28
28
1.96
66096206--66096266
10
6.1
10
74
12
54
32
13
24
29
1.93
66096207--66096267
20
3.0
20
83
9
79
32
13
26
27
1.93
66097057--66097101
17
2.5
19
85
10
67
4
22
2
71
1.15
66097940--66097972
12
2.8
12
95
0
57
9
0
9
81
0.87
66100876--66100958
30
2.7
31
78
12
91
14
20
1
63
1.36
66101027--66101072
15
3.1
14
84
12
56
4
17
2
76
1.06
66101027--66101080
10
5.1
11
72
17
51
3
16
1
77
1.00
66103374--66103413
19
2.1
19
85
0
53
25
35
17
22
1.95
66104946--66105042
30
3.2
31
73
5
101
27
28
15
27
1.96
66105899--66105947
20
2.3
20
82
10
53
32
8
14
44
1.74
66106748--66106788
11
3.6
11
90
6
64
70
4
7
17
1.28
66106747--66106790
12
3.8
12
90
6
72
70
4
6
18
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66112013--66112052
19
2.1
19
85
0
53
25
35
17
22
1.95
66117919--66117949
16
1.9
16
93
0
53
35
6
19
38
1.77
66117949--66118045
40
2.3
41
81
8
99
27
14
28
28
1.95
66122815--66122919
43
2.4
43
90
0
156
30
20
18
30
1.96
66131217--66131313
30
3.2
30
75
2
106
28
26
15
28
1.96
66133998--66134068
37
1.9
37
86
11
101
76
2
18
2
1.04
66134008--66134057
6
8.2
6
83
14
50
76
2
20
2
0.99
66134118--66134148
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83
66136322--66136417
30
3.2
30
75
4
106
28
27
15
29
1.96
66139612--66139648
13
2.8
13
91
0
65
72
0
8
18
1.08
66141811--66141864
17
3.2
17
81
0
63
75
3
12
7
1.14
66151419--66151593
44
3.9
44
81
10
217
21
20
29
28
1.98
66154529--66154592
15
4.4
15
84
11
89
10
15
12
60
1.58
66159565--66159612
20
2.4
20
71
0
51
20
27
18
33
1.96
66164135--66164309
40
4.4
40
92
0
269
21
20
29
28
1.98
66167394--66167440
17
2.6
17
78
18
51
65
4
25
4
1.29
66167516--66167560
18
2.5
18
85
0
63
53
0
31
15
1.43
66170709--66170743
12
2.9
12
84
16
54
74
0
22
2
0.95
66171259--66171305
20
2.3
20
85
0
67
29
36
12
21
1.91
66177208--66177918
354
2.0
354
98
0
1386
23
20
20
36
1.95
66178966--66179018
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
66182555--66182603
18
2.7
18
87
6
64
48
4
8
38
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66183481--66183533
26
2.1
26
85
3
72
35
7
15
41
1.75
66186728--66186771
22
2.0
22
90
0
70
36
4
34
25
1.76
66189128--66189174
21
2.2
22
84
3
60
14
25
2
57
1.49
66190741--66190787
20
2.3
20
85
0
67
21
12
36
29
1.91
66193817--66193878
10
5.9
10
74
10
52
33
32
3
30
1.74
66193817--66193879
21
3.0
21
88
2
90
33
33
3
30
1.74
66197168--66197209
21
2.0
21
86
4
59
33
7
11
47
1.68
66202611--66202642
12
2.6
12
95
5
55
25
6
3
65
1.31
66203753--66203782
15
2.0
15
100
0
60
6
13
20
60
1.55
66206346--66206384
19
2.1
19
100
0
78
33
10
25
30
1.89
66206406--66206543
41
3.4
41
81
4
154
28
14
24
31
1.95
66209289--66209348
30
2.0
30
86
0
84
28
26
8
36
1.85
66212508--66212665
43
3.7
43
76
14
157
22
18
27
31
1.97
66214315--66214371
25
2.3
23
82
11
69
35
1
1
61
1.17
66218144--66218187
22
2.0
22
100
0
88
31
4
36
27
1.77
66220287--66220327
20
2.0
20
85
0
55
21
12
34
31
1.91
66222000--66222105
48
2.2
48
85
9
137
14
24
1
59
1.45
66224715--66224761
20
2.3
20
85
0
67
21
12
36
29
1.91
66226585--66226628
22
2.0
22
86
0
61
77
6
9
6
1.13
66226608--66226634
14
1.9
14
100
0
54
70
7
7
14
1.32
66230899--66230939
21
1.9
22
90
5
66
80
4
7
7
1.02
66230919--66230946
14
2.0
14
100
0
56
71
7
7
14
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66233195--66233251
23
2.4
25
80
14
66
63
3
22
10
1.42
66241585--66241726
6
23.3
6
71
16
105
47
13
17
21
1.81
66241594--66241726
31
4.6
30
80
12
161
48
12
18
21
1.81
66241844--66241909
27
2.5
26
82
7
78
39
22
21
16
1.92
66241868--66241925
27
2.1
27
87
6
82
37
27
18
15
1.92
66242228--66242310
27
3.1
26
86
5
103
38
21
20
19
1.93
66242511--66242696
27
6.9
27
84
0
219
26
19
17
36
1.94
66242509--66242704
81
2.4
82
84
5
247
27
18
17
36
1.93
66242511--66242704
54
3.6
54
84
2
246
26
19
17
37
1.93
66242716--66243415
27
25.9
27
84
4
815
41
9
21
27
1.84
66245361--66245500
6
23.3
6
73
16
121
48
14
17
20
1.81
66245370--66245471
53
1.9
54
93
2
179
50
13
16
19
1.78
66245618--66245683
27
2.5
26
85
7
87
37
22
22
16
1.93
66245618--66245691
27
2.8
27
78
13
82
36
21
24
17
1.95
66245642--66245699
27
2.1
27
84
6
73
36
27
20
15
1.93
66246002--66246084
27
3.1
26
87
5
112
37
21
21
19
1.94
66246240--66246303
27
2.4
28
76
7
69
37
26
18
17
1.93
66246283--66246478
27
7.3
27
83
0
203
26
18
18
36
1.94
66246285--66246478
81
2.4
82
84
1
239
26
18
18
36
1.94
66246282--66246478
54
3.6
54
86
0
250
26
18
18
36
1.94
66246483--66247105
27
23.1
27
83
4
668
42
8
21
28
1.82
66246483--66247104
81
7.7
81
83
5
747
42
8
21
27
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66250767--66250810
22
2.0
22
90
0
70
40
0
4
54
1.21
66255304--66255388
30
2.8
30
76
0
107
27
17
27
28
1.98
66258401--66258428
11
2.5
11
100
0
56
25
25
7
42
1.80
66261098--66261194
30
3.2
30
77
2
115
27
25
16
29
1.97
66263836--66263899
11
6.0
10
70
25
51
76
1
18
3
1.00
66263836--66263899
5
12.0
5
73
23
51
76
1
18
3
1.00
66263836--66263899
16
4.0
16
71
18
53
76
1
18
3
1.00
66263826--66263881
19
2.9
19
77
17
55
76
3
19
0
0.93
66263947--66263977
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83
66266118--66266214
30
3.2
30
75
2
106
27
26
16
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295