Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  32  of  295  ( 35319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8933736--8933762
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100
0
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0
0
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1.89
8937225--8937310
42
2.0
42
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0
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0
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0
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0
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0
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2.4
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0
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1.52
8957061--8957154
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2.6
22
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1.72
8957097--8957169
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3
132
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21
1.9
20
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5
51
10
2
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45
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27
27
14
31
1.95
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1.9
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2
246
28
29
12
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78
2.2
78
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267
26
23
18
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44
11.2
44
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28
14
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1
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1
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0
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10
0
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19
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4
11
0
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16
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76
5
9
0
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0.74
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3.3
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10
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4
10
0
85
0.73
8965140--8965197
22
2.6
22
81
7
64
41
17
5
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1.72
8965176--8965266
19
4.9
19
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8
134
37
14
10
37
1.81
8965233--8965274
19
2.3
18
88
8
59
40
11
11
35
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8966049--8966090
18
2.3
18
91
0
66
50
9
16
23
1.75
8966205--8966369
85
1.9
85
97
0
312
38
26
16
18
1.91
8971146--8971199
18
2.9
18
78
15
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9
12
3
74
1.20
8974429--8974665
50
4.8
49
76
7
208
25
17
26
30
1.97
8980386--8980642
40
6.4
40
82
4
288
28
26
21
24
1.99
8980386--8980642
80
3.2
79
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3
347
28
26
21
24
1.99
8986402--8986904
46
11.0
46
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1
643
21
23
13
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1.88
8991717--8991761
20
2.3
20
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28
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26
1.98
8992678--8992721
17
2.5
18
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72
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8994155--8994191
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2.8
13
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2.0
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20
1
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1.60
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1.9
18
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2
17
0
80
0.84
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1.9
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0
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0
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13
55
43
16
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39
1.48
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20
2.0
20
100
0
80
40
35
10
15
1.80
9010599--9010731
41
3.2
41
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0
185
23
19
6
50
1.71
9010794--9010832
20
2.0
20
94
0
69
23
23
15
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
59
95
0
211
45
20
11
22
1.83
9012759--9012888
59
2.2
58
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163
49
20
7
23
1.74
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2.2
37
97
0
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37
4
17
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1.71
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40
2.0
40
97
0
155
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6
4
47
1.50
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12
2.4
13
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26
6
0
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1.16
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2.0
16
100
0
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37
25
18
18
1.94
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2.3
34
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27
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1.81
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220
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17
22
28
1.97
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14
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135
91
0
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15
26
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2
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0
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50
0
0
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1.00
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0
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4
51
13
0
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1.34
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2.0
30
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100
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2.0
16
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0
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2.0
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107
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17
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0
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2.0
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1
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1.27
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5.5
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0
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12
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1.68
9084714--9084961
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1
487
6
33
12
47
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9106634--9106698
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1.9
34
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3
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33
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16
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1.77
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50
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212
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4
19
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1.69
9107922--9108002
25
3.2
25
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13
67
45
3
19
30
1.68
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1.9
21
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5
71
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12
2
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1.50
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2.2
22
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60
36
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2
58
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4.2
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22
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1.99
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0
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25
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0
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12
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44
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34
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0
120
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19
2.0
20
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5
60
44
13
2
39
1.57
9164816--9164878
4
15.0
4
76
18
58
1
22
6
69
1.19
9166711--9166749
15
2.5
15
91
4
60
30
10
17
41
1.83
9167287--9167324
18
2.2
18
85
4
51
36
2
10
50
1.51
9175413--9175455
16
2.7
16
85
7
52
72
0
2
25
0.97
9175419--9175456
16
2.3
17
90
4
60
76
0
0
23
0.79
9185148--9185261
51
2.2
51
95
0
201
33
14
23
28
1.94
9188766--9188836
34
2.1
34
97
0
133
21
12
25
40
1.88
9191928--9192041
51
2.2
51
93
0
192
32
14
24
28
1.94
9193895--9194070
44
4.0
44
83
5
185
31
18
22
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9193899--9194065
88
1.9
88
83
1
217
31
17
21
29
1.97
9194174--9194410
94
2.5
94
80
1
260
31
18
20
29
1.97
9196969--9197387
182
2.3
183
83
6
522
30
19
11
38
1.87
9197176--9197598
218
1.9
216
91
1
686
29
19
11
39
1.86
9199004--9199056
27
1.9
28
84
3
72
64
1
5
28
1.27
9202344--9202403
25
2.3
26
81
16
72
80
1
11
6
0.98
9204229--9204297
16
4.2
16
92
3
120
26
0
36
37
1.57
9204229--9204297
33
2.1
32
94
2
120
26
0
36
37
1.57
9204420--9204736
157
2.0
157
94
1
555
43
3
5
47
1.41
9204670--9204711
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
9204679--9204720
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
9204705--9204892
61
3.1
61
69
14
199
47
6
2
43
1.42
9204673--9204965
120
2.4
121
93
2
493
49
4
3
42
1.39
9204708--9204891
59
3.1
59
65
20
164
47
6
2
42
1.43
9209202--9209495
100
2.8
103
86
8
362
22
28
23
26
1.99
9209203--9209507
56
5.8
51
85
5
321
21
28
23
26
1.99
9209602--9209633
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
9209845--9209902
30
1.9
30
86
6
82
31
24
1
43
1.64
9212272--9212439
84
2.0
84
98
0
327
36
17
12
33
1.88
9222264--9222316
21
2.5
21
87
0
79
15
18
20
45
1.85
9223328--9223366
20
2.0
20
84
0
51
33
20
2
43
1.65
9224437--9224472
19
1.9
18
94
5
63
44
0
19
36
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9230037--9230099
25
2.4
25
84
5
72
68
1
0
30
0.99
9230248--9230289
8
5.4
8
82
5
59
35
0
2
61
1.09
9230248--9230293
23
2.0
24
87
8
69
39
0
2
58
1.10
9234229--9234272
22
2.0
22
95
0
79
34
11
13
40
1.81
9235449--9235488
19
2.1
19
95
0
71
25
5
37
32
1.77
9237486--9237734
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
26
1.99
9237485--9237734
100
2.4
104
88
6
357
20
29
24
26
1.99
9237829--9237860
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
9238072--9238129
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
9245082--9245330
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295