Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  30  of  295  ( 35319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8313166--8313214
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55
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1.13
8357402--8357472
20
3.6
19
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11
81
70
1
4
23
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8357402--8357472
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39
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2.1
29
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2.0
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8381290--8381445
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20
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0
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2.0
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26
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2.0
22
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4
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15
20
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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36
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21
1.99
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170
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22
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9
36
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8498235--8498487
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2.0
127
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22
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20
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12
0
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1.36
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24
25
22
27
2.00
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1.70
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1.9
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13
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15
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221
34
8
16
40
1.79
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54
27
25
18
27
1.98
8517687--8517841
74
2.1
74
82
7
181
29
27
16
26
1.97
8526203--8526240
18
2.1
19
85
9
53
26
13
2
57
1.49
8528873--8528925
27
2.0
27
92
0
88
20
20
22
35
1.96
8528909--8528942
17
2.0
17
94
0
59
8
26
23
41
1.83
8528884--8528967
44
1.9
44
92
0
141
17
21
23
36
1.94
8528926--8529209
54
5.3
54
79
3
250
23
16
20
38
1.92
8528926--8529174
27
9.2
27
78
2
243
24
15
20
39
1.91
8528926--8529202
81
3.4
81
79
1
286
24
16
20
38
1.92
8533791--8533860
35
2.0
35
97
0
131
34
15
14
35
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8535735--8535810
25
3.1
25
69
14
68
43
3
1
51
1.28
8540157--8540190
16
2.1
16
88
0
50
79
8
0
11
0.94
8542457--8542602
70
2.1
70
100
0
292
49
1
24
24
1.58
8542596--8542629
18
1.9
17
88
5
50
47
0
20
32
1.51
8542641--8542681
12
3.3
13
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10
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48
0
7
43
1.30
8543130--8543225
27
3.4
27
80
12
97
17
5
36
40
1.72
8543945--8544035
45
2.0
45
100
0
182
37
4
15
42
1.67
8544901--8544997
35
2.7
35
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7
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28
7
19
44
1.77
8547454--8547541
44
2.0
44
95
0
158
29
13
20
36
1.91
8547759--8547878
57
2.1
58
92
1
197
49
6
15
29
1.69
8548892--8548945
28
1.9
28
92
0
90
33
7
11
48
1.67
8550297--8550334
17
2.2
18
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4
51
68
7
2
21
1.28
8550692--8550733
18
2.3
18
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0
57
40
14
9
35
1.78
8551954--8551989
17
2.2
16
90
9
56
58
0
13
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1.36
8559892--8559952
30
2.0
31
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18
4
1
75
1.06
8559893--8559942
24
2.2
22
83
16
59
18
4
0
78
0.91
8559893--8559949
21
2.7
20
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20
53
17
3
1
77
1.00
8560132--8560185
21
2.6
20
79
5
63
53
1
3
40
1.29
8560747--8560803
24
2.4
23
74
8
60
47
3
0
49
1.18
8560789--8560888
18
5.6
17
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19
64
47
0
0
53
1.00
8560784--8560843
18
3.3
19
82
13
65
46
1
0
51
1.10
8560805--8560903
38
2.8
34
71
21
87
47
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8560828--8560871
22
2.0
22
86
0
61
52
0
0
47
1.00
8560789--8560899
16
6.2
18
75
15
54
45
0
0
54
1.00
8560892--8560922
15
2.1
15
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0
53
41
0
0
58
0.98
8565655--8565698
18
2.4
18
88
0
70
38
13
13
34
1.84
8569025--8569054
14
2.1
15
93
6
53
40
0
0
60
0.97
8571198--8571533
127
2.6
124
80
8
363
27
16
19
36
1.93
8574857--8574901
20
2.2
20
88
7
65
24
28
4
42
1.74
8574872--8574913
19
2.2
19
83
8
50
28
26
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35
1.88
8581696--8581782
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2.0
44
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6
122
44
18
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10
1.81
8582678--8582970
132
2.2
132
92
0
478
30
21
20
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295