Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  7  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2074492--2074652
46
3.3
49
75
11
152
26
16
29
28
1.97
2078010--2078059
15
3.3
15
88
0
73
10
18
14
58
1.63
2079952--2080083
52
2.7
48
75
10
142
24
18
29
28
1.98
2083227--2083252
7
3.7
7
100
0
52
26
0
0
73
0.84
2084331--2084393
30
2.1
30
87
0
90
31
20
11
36
1.88
2085509--2085577
30
2.3
30
87
7
104
34
14
23
27
1.94
2085781--2085826
24
1.9
24
90
0
74
50
8
4
36
1.53
2086625--2086666
22
2.0
22
86
13
61
26
0
2
71
0.98
2089660--2089702
20
2.1
21
82
4
52
34
2
2
60
1.22
2099846--2099904
26
2.4
25
81
13
70
64
3
0
32
1.10
2112645--2112687
22
2.0
22
81
9
52
32
2
11
53
1.50
2112809--2112843
16
2.1
17
94
5
63
45
0
11
42
1.40
2120654--2120702
19
2.6
20
81
9
59
28
20
4
46
1.68
2127324--2127393
31
2.3
31
97
0
131
50
12
11
25
1.74
2128266--2128299
17
2.0
17
88
0
50
50
0
2
47
1.16
2130845--2130874
15
2.0
15
93
0
51
66
3
0
30
1.07
2132005--2132054
26
1.9
26
84
8
66
62
4
2
32
1.25
2133634--2133678
22
2.0
22
86
4
63
48
2
0
48
1.13
2134910--2134947
15
2.5
15
87
8
51
23
0
2
73
0.95
2138394--2138432
21
1.9
20
94
5
69
33
10
25
30
1.89
2138546--2138577
15
2.1
15
94
0
55
18
0
9
71
1.12
2142430--2142454
11
2.3
11
100
0
50
72
0
0
28
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2142506--2142607
22
4.7
22
73
4
75
67
2
4
24
1.24
2142507--2142599
11
8.7
10
69
11
51
66
3
4
25
1.25
2143148--2143205
29
2.0
29
86
6
82
44
3
10
41
1.55
2149538--2149563
4
6.5
4
100
0
52
50
23
0
26
1.50
2152906--2152987
30
2.8
29
75
14
78
39
0
2
58
1.11
2176523--2176552
10
3.0
10
100
0
60
60
0
20
20
1.37
2189066--2189124
6
9.8
6
75
12
50
81
6
0
11
0.87
2189065--2189125
28
2.2
28
80
16
65
81
6
0
11
0.85
2189073--2189124
18
2.9
17
83
8
59
82
5
0
11
0.82
2190101--2190133
16
2.1
16
88
5
50
33
0
3
63
1.10
2193392--2193429
7
5.6
7
96
3
69
44
44
0
10
1.38
2196511--2196541
9
3.4
9
90
0
53
87
0
3
9
0.66
2233068--2233118
11
4.5
11
83
9
59
84
0
15
0
0.63
2233080--2233119
9
4.6
9
84
3
55
87
0
12
0
0.54
2233068--2233118
22
2.3
23
89
3
77
84
0
15
0
0.63
2234707--2234803
45
2.2
45
90
0
149
19
32
16
30
1.94
2235531--2235689
42
3.8
42
85
3
178
20
18
21
38
1.93
2240236--2240301
29
2.3
28
82
12
73
42
9
3
45
1.51
2240884--2240983
50
2.0
50
100
0
200
28
4
10
58
1.49
2241781--2241806
11
2.4
11
100
0
52
88
0
11
0
0.52
2247394--2247462
19
3.5
20
84
7
81
42
0
4
53
1.20
2248967--2249005
3
13.0
3
100
0
78
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2251168--2251437
72
3.8
72
83
5
325
31
16
17
34
1.92
2251168--2251437
144
1.9
143
84
7
368
31
16
17
34
1.92
2258165--2258200
17
2.1
17
94
0
63
27
11
41
19
1.85
2262731--2262761
16
1.9
16
93
0
53
29
16
12
41
1.85
2264680--2264720
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
2268255--2268289
4
8.5
4
96
3
61
28
0
22
48
1.51
2274541--2274583
6
7.2
6
97
0
68
20
0
11
67
1.22
2274619--2274655
18
2.2
17
90
9
58
54
0
0
45
1.00
2277703--2278386
193
3.5
193
91
0
1082
33
16
21
28
1.95
2281565--2282204
192
3.3
192
90
0
994
34
15
21
29
1.94
2286026--2286072
2
23.5
2
100
0
94
51
0
48
0
1.00
2286974--2287008
15
2.3
15
90
9
54
51
22
0
25
1.48
2287674--2288073
41
9.8
40
81
4
323
34
27
17
20
1.95
2287713--2288078
82
4.5
82
97
0
662
35
26
17
20
1.95
2288193--2288373
64
2.9
63
89
8
262
41
17
8
32
1.79
2292973--2293028
13
4.3
13
72
6
51
35
32
1
30
1.68
2293108--2293267
46
3.4
47
88
1
225
18
23
16
42
1.89
2293250--2293285
18
2.0
18
100
0
72
11
22
22
44
1.84
2293204--2293331
64
2.0
64
95
0
229
17
23
17
41
1.90
2293267--2293450
46
4.0
46
95
2
325
23
26
12
37
1.90
2293157--2293377
110
2.0
111
92
0
372
19
24
15
40
1.90
2297459--2297500
11
3.8
11
78
9
50
23
4
0
71
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2297718--2297768
26
1.9
27
88
4
77
19
9
13
56
1.65
2297918--2297946
11
2.5
12
94
5
51
17
24
0
58
1.38
2303750--2303800
26
1.9
27
88
4
77
19
9
13
56
1.65
2303949--2303977
11
2.5
12
94
5
51
17
24
0
58
1.38
2306844--2306875
16
1.9
17
93
6
57
62
3
3
31
1.26
2308608--2308632
11
2.3
11
100
0
50
64
0
0
36
0.94
2311681--2311837
79
2.0
79
94
2
280
35
7
8
48
1.63
2319591--2319683
18
5.2
18
85
0
132
29
23
15
32
1.95
2324318--2324383
28
2.4
28
77
10
73
43
1
4
50
1.32
2328651--2328692
21
2.0
22
85
4
59
38
4
9
47
1.57
2330740--2330793
24
2.2
24
78
12
58
64
3
5
25
1.32
2331030--2331079
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
2335667--2335716
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
2339389--2339435
3
15.3
3
91
4
76
34
2
0
63
1.06
2339988--2340021
16
2.1
16
88
0
50
29
0
5
64
1.17
2340381--2340460
40
2.0
40
97
0
151
58
2
0
38
1.11
2341513--2341587
18
4.2
18
81
3
71
29
17
14
38
1.89
2347520--2347722
102
2.0
100
89
1
307
37
15
7
39
1.75
2349643--2349675
11
2.8
12
90
4
50
75
0
9
15
1.03
2357007--2357069
31
2.0
31
100
0
126
38
6
20
34
1.78
2358672--2358705
15
2.3
15
90
5
52
35
8
0
55
1.31
2362412--2362437
7
3.7
7
100
0
52
38
0
0
61
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2364200--2364312
38
2.9
38
88
1
163
45
5
20
29
1.73
2365380--2365424
17
2.6
18
82
7
56
17
6
6
68
1.33
2376279--2376326
24
2.0
24
100
0
96
41
16
25
16
1.89
2377787--2377826
20
2.0
20
85
5
53
42
2
0
55
1.13
2383934--2383973
17
2.3
18
83
12
57
50
0
0
50
1.00
2383944--2384001
27
2.1
29
81
12
68
39
3
1
55
1.27
2390020--2390053
17
2.0
17
88
0
50
41
11
17
29
1.85
2392160--2392211
18
2.7
20
85
11
72
76
0
15
7
0.99
2393088--2393160
22
3.6
21
75
16
64
61
1
4
32
1.23
2393106--2393164
10
5.9
10
73
15
50
62
0
1
35
1.05
2396322--2396368
18
2.7
18
77
9
53
44
2
0
53
1.12
2401729--2401770
21
1.9
23
85
9
61
40
4
2
52
1.35
2402485--2402530
18
2.6
18
89
6
67
45
0
0
54
0.99
2406617--2406651
3
11.7
3
100
0
70
31
0
0
68
0.90
2409518--2409552
6
5.8
6
100
0
70
65
0
0
34
0.93
2409959--2410019
29
2.1
29
87
3
86
42
16
9
31
1.81
2414562--2414614
22
2.3
23
93
3
90
54
7
20
16
1.66
2431396--2431433
18
2.1
18
95
0
67
36
0
10
52
1.36
2435514--2435577
28
2.3
26
78
19
67
53
3
6
37
1.42
2436929--2436981
27
2.0
27
85
3
72
28
11
20
39
1.87
2438251--2438398
48
3.1
48
88
0
224
38
7
24
29
1.83
2440761--2440824
30
2.1
32
82
8
80
56
12
1
29
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2446980--2447025
13
3.4
14
77
14
51
30
0
2
67
1.03
2449324--2449348
11
2.3
11
100
0
50
36
32
0
32
1.58
2452877--2452922
19
2.3
20
81
3
58
58
2
10
28
1.43
2453777--2453811
17
2.1
17
88
0
52
31
2
0
65
1.07
2466402--2466434
16
2.1
16
88
5
50
45
6
21
27
1.75
2466685--2466757
31
2.4
29
77
16
69
58
1
2
36
1.21
2468207--2468266
29
2.1
29
100
0
120
50
6
25
18
1.71
2473083--2473123
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
2483656--2483686
15
2.1
15
100
0
62
35
19
25
19
1.95
2484573--2484630
26
2.2
26
90
0
89
34
5
22
37
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295