Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  28  of  295  ( 35319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7615544--7615700
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7615544--7615700
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196
29
27
19
23
1.98
7623258--7623384
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2.0
62
100
0
254
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7623421--7623459
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6.7
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5
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0
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2.5
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2.8
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331
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2.0
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0
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2.0
40
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0
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5
18
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46
2.0
46
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0
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3.0
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15
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1.9
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5
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9
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0
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3
0.98
7675455--7675528
25
2.9
24
78
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67
72
2
20
4
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7679387--7679449
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2.6
24
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1
3
49
1.27
7682200--7682253
24
2.2
24
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15
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5
1
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1.28
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0
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0
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0
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19
2.1
19
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35
0
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7695878--7695902
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2.3
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42
1
1
53
1.23
7729118--7729239
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1.9
62
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151
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2
36
1.34
7742780--7743046
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19
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23
1.98
7742778--7743036
94
2.8
94
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9
255
28
18
28
24
1.98
7743104--7743164
30
2.0
30
100
0
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3
101.0
3
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28
8
2
60
1.39
7747709--7747750
20
2.2
19
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4
57
26
16
4
52
1.63
7747805--7747866
23
2.7
24
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5
74
22
8
0
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6
4.7
6
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0
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32
0
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58
2.0
59
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143
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9
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1.74
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0
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0
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2.0
30
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6
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1
31
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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4
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100
0
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14
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0
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0
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2.0
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2.0
43
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0
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16
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0
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0
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0
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21
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1.13
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2
4
1.21
7765908--7765988
25
3.2
25
80
10
94
67
24
3
3
1.23
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0
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1.31
7780385--7780467
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25
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11
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25
4
6
1.37
7780695--7780719
13
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13
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0
50
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0
0
88
0.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7783399--7783475
36
2.2
35
86
6
102
29
11
12
45
1.78
7783644--7783699
29
1.9
29
88
0
85
39
5
1
53
1.34
7783973--7784022
22
2.3
22
82
6
57
52
2
2
44
1.24
7784551--7784599
25
2.0
25
88
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73
46
2
2
48
1.25
7801553--7801620
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2.1
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10
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47
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1
51
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33
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6
18
45
1.73
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2.4
42
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0
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29
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28
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30
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56
15
17
10
1.67
7823602--7823681
15
5.4
15
79
7
83
57
13
18
10
1.64
7823613--7823690
15
5.2
15
77
9
70
55
15
17
11
1.69
7826631--7826804
45
3.8
45
77
11
183
29
29
18
21
1.97
7830255--7830429
46
3.8
46
75
15
180
29
29
21
20
1.98
7830262--7830434
93
1.9
93
93
2
303
28
29
21
20
1.98
7832086--7832124
18
2.2
18
95
0
69
28
17
10
43
1.82
7834102--7834193
46
2.0
46
93
0
157
28
29
3
39
1.73
7834848--7834987
65
2.1
66
81
3
158
30
22
11
35
1.90
7834817--7834987
33
5.2
33
82
1
155
28
23
12
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7835459--7835777
123
2.5
124
84
6
412
35
19
18
26
1.95
7837392--7837437
24
1.9
24
82
8
58
69
0
6
23
1.11
7838881--7838942
31
2.0
31
96
0
115
46
16
11
25
1.80
7844507--7844558
27
1.9
27
88
0
77
44
13
7
34
1.72
7844810--7844877
29
2.3
29
84
0
82
33
13
10
42
1.78
7846094--7846162
32
2.2
32
86
2
95
44
0
5
49
1.26
7848101--7848148
24
2.0
24
87
0
69
29
4
31
35
1.76
7850105--7850133
14
2.1
14
100
0
58
34
34
6
24
1.82
7850485--7850516
2
16.0
2
100
0
64
0
50
0
50
1.00
7859702--7859735
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
7864332--7864365
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
7864862--7864893
11
2.8
12
86
13
50
34
0
0
65
0.93
7871363--7871395
17
1.9
17
88
11
50
72
6
0
21
1.05
7871876--7872078
103
2.0
103
79
5
223
37
8
9
43
1.68
7887654--7887687
17
2.0
17
88
0
50
35
0
2
61
1.11
7897185--7897214
12
2.5
12
94
0
51
53
6
16
23
1.66
7907773--7907819
23
2.0
24
84
8
62
44
8
6
40
1.60
7914122--7914164
11
3.8
11
82
17
61
62
2
2
32
1.20
7914118--7914161
23
1.9
23
95
0
79
59
4
2
34
1.30
7915032--7915072
20
2.0
20
86
9
57
29
29
9
31
1.89
7918088--7918117
4
7.2
4
92
7
51
23
0
0
76
0.78
7918082--7918115
13
2.5
13
95
4
59
20
0
2
76
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7918148--7918190
21
2.0
22
86
4
61
41
0
2
55
1.12
7918180--7918239
22
2.8
22
85
9
72
38
1
1
58
1.18
7918194--7918254
21
3.0
20
85
4
77
45
0
0
54
1.00
7918217--7918261
18
2.5
19
79
13
51
51
0
0
48
1.00
7918842--7918938
21
5.0
21
75
15
93
55
0
2
42
1.11
7918840--7918938
20
5.1
20
75
16
93
55
0
2
42
1.11
7918857--7918881
13
1.9
13
100
0
50
60
0
0
40
0.97
7929623--7929682
10
6.2
10
73
11
54
55
5
1
38
1.32
7929616--7929682
21
3.2
22
77
8
68
53
5
2
37
1.41
7931690--7931851
88
1.8
88
85
5
229
20
20
20
37
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295