Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  51  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14650806--14650916
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46
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0
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0
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2.6
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0
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1.00
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2.0
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100
0
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117
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1.8
234
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2.9
150
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2
547
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22
19
30
1.98
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0
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20
2.0
20
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12
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19
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23
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89
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28
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14701291--14701407
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2.2
54
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3
182
40
12
18
28
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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28
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14702503--14702650
18
8.2
18
83
0
179
37
15
10
36
1.83
14702503--14702650
54
2.7
54
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217
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10
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1.83
14702767--14702800
6
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16
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2
0
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1.12
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86
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22
2.1
22
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0
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1
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1350
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1.69
14727579--14727608
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12
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51
73
6
0
20
1.05
14727616--14727664
20
2.7
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59
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2
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1.21
14727613--14727664
9
5.7
9
80
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52
61
1
1
34
1.18
14727823--14727896
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2.5
31
78
12
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70
1
2
25
1.09
14728080--14728105
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2.6
10
100
0
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0
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30
1.24
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1.9
18
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52
73
5
0
20
1.04
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265
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9
7
31
1.64
14726860--14728376
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3.0
502
81
10
1832
48
11
8
31
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1
0
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1.04
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20
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18
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1
1
34
1.09
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24
2.5
26
70
17
60
66
0
4
29
1.12
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18
2.4
17
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7
50
44
0
4
51
1.22
14732320--14732359
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0
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0
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14
10
43
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2.5
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23
19
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1.85
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10
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3
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13
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14
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0
0
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13
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19
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21
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14770931--14771028
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2.0
49
93
0
169
14
35
9
40
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14777678--14777808
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14
155
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10
22
34
1.88
14786811--14787037
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3.7
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73
16
216
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1
0
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1.15
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0
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39
1.05
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0
0
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0
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1
0
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1.10
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0
0
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1
0
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1
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0
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20
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13
55
38
4
2
55
1.31
14800293--14800339
19
2.6
19
86
6
62
57
0
0
42
0.98
14807304--14807348
25
1.9
24
86
13
67
40
2
0
57
1.11
14810342--14810480
3
47.0
3
70
14
76
30
3
2
63
1.23
14810348--14810418
36
2.1
36
84
7
94
29
2
2
64
1.22
14810368--14810478
17
6.6
17
68
20
65
30
4
1
63
1.25
14810344--14810480
20
6.7
20
71
17
68
30
3
2
63
1.23
14810803--14810846
3
15.0
3
88
4
63
29
0
4
65
1.12
14814445--14814575
65
2.0
65
96
0
244
36
35
11
16
1.84
14822546--14822578
17
1.9
17
88
11
50
9
9
15
66
1.43
14822559--14822615
22
2.4
25
77
8
66
22
5
7
64
1.38
14823508--14823558
25
2.0
25
81
7
59
66
5
0
27
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14831679--14831724
16
3.0
15
84
6
65
54
28
2
15
1.53
14833533--14833586
17
2.9
18
75
8
56
22
7
1
68
1.24
14836453--14836591
49
2.8
49
78
0
161
29
18
27
24
1.98
14846071--14846283
49
4.5
48
75
12
165
24
18
30
26
1.98
14849962--14850006
19
2.4
19
85
7
56
24
20
11
44
1.83
14858062--14858393
44
7.5
43
77
11
298
29
18
23
28
1.97
14858059--14858393
88
3.8
87
78
8
329
30
17
23
28
1.97
14858063--14858535
132
3.6
131
82
7
536
30
17
23
28
1.97
14869572--14869670
37
2.7
36
78
10
94
71
0
6
22
1.07
14869574--14869669
10
9.0
10
69
15
50
71
0
6
21
1.07
14881207--14881288
43
1.9
43
97
0
155
21
19
30
28
1.98
14884872--14885005
46
2.9
46
96
0
250
35
13
26
24
1.93
14884983--14885021
16
2.4
16
100
0
78
35
15
25
23
1.94
14884937--14885067
62
2.1
62
97
0
244
35
13
27
23
1.93
14884999--14885339
46
7.4
46
92
0
477
40
14
24
20
1.90
14884891--14885113
108
2.1
108
96
0
410
36
13
26
23
1.92
14884881--14885159
154
1.8
153
97
0
513
36
12
26
24
1.91
14898476--14898634
27
5.9
27
80
12
166
35
22
23
18
1.95
14898494--14898634
54
2.6
54
89
2
230
36
23
22
17
1.95
14898766--14898828
28
2.2
28
77
8
65
31
7
20
39
1.81
14900234--14900341
26
4.2
26
86
0
162
36
23
7
33
1.83
14909048--14909183
55
2.5
55
81
2
148
27
31
23
16
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14923172--14923291
45
2.7
45
83
6
138
34
25
15
24
1.95
14928177--14928208
16
2.0
16
93
0
55
34
0
21
43
1.53
14944916--14945111
99
2.0
95
95
3
347
29
19
17
32
1.95
14949848--14949959
43
2.6
42
80
8
129
29
17
24
28
1.97
14953444--14953481
20
1.9
20
89
10
60
26
0
13
60
1.33
14954789--14954876
32
2.8
32
84
6
124
31
5
18
44
1.73
14965250--14965328
31
2.5
31
81
0
95
39
8
11
40
1.72
14965348--14965431
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2.7
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0
132
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13
32
1.86
14969160--14969226
33
2.0
33
97
0
125
64
4
11
19
1.44
14975130--14975376
112
2.2
114
80
10
283
61
4
4
29
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295