Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  17  of  295  ( 35319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5007602--5007631
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2.0
123
90
3
388
39
22
13
24
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
20
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0
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5022416--5022466
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0
27
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40
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112
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25
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1.98
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4
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1.40
5026627--5026705
25
3.5
22
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15
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3
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1.42
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3.2
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3
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0
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4
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2
6
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1.38
5027078--5027122
22
2.0
22
86
4
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55
2
6
35
1.38
5027204--5027297
48
2.0
48
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1.45
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54
61
0
3
34
1.14
5027487--5027535
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3.1
15
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11
53
63
0
4
32
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5029481--5029537
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3.8
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1
1
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1.13
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1.97
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3.0
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14
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33
20
23
22
1.97
5036247--5036912
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2.5
262
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20
23
22
1.97
5036735--5036871
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2.7
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18
9
50
22
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5053172--5053297
21
6.5
18
73
15
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19
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0
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1.86
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1.50
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24
1.95
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298
2.0
300
95
1
1059
36
20
16
27
1.94
5073898--5073971
39
2.0
39
84
12
102
4
29
1
64
1.20
5074757--5074795
8
4.9
8
83
0
51
56
23
17
2
1.53
5074757--5074795
16
2.4
16
91
0
69
56
23
17
2
1.53
5076358--5076390
18
1.9
17
88
11
50
42
12
15
30
1.83
5081656--5081706
23
2.3
22
86
3
66
54
7
7
29
1.57
5083036--5083096
26
2.3
26
100
0
122
16
0
47
36
1.47
5085745--5085805
28
2.2
28
82
5
70
39
3
3
54
1.33
5087836--5087902
25
2.7
25
78
0
71
37
16
8
37
1.80
5089164--5089212
13
3.7
13
81
10
55
77
2
0
20
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5089159--5089220
27
2.3
26
86
5
79
77
3
0
19
0.90
5091484--5091526
23
1.9
22
90
4
68
27
2
2
67
1.15
5097577--5097632
29
1.9
29
85
0
76
33
16
7
42
1.75
5099095--5099133
12
3.2
12
85
0
51
10
0
58
30
1.31
5099829--5099924
35
2.7
35
79
7
88
22
16
4
56
1.58
5101930--5102407
27
17.7
27
85
1
430
38
20
12
28
1.89
5102260--5102448
27
7.0
27
88
0
263
33
21
21
22
1.97
5102875--5102939
22
3.0
22
77
8
69
21
23
21
33
1.97
5103098--5103199
54
1.9
53
83
2
132
19
20
20
39
1.93
5103098--5103199
27
3.8
26
79
5
96
19
20
20
39
1.93
5103352--5103473
6
19.8
6
71
17
90
18
18
16
47
1.83
5103323--5103464
31
4.5
31
90
0
194
20
16
14
48
1.81
5111203--5111243
17
2.4
17
95
0
73
21
24
29
24
1.99
5113969--5114421
3
152.3
3
65
14
104
26
8
3
61
1.41
5114239--5114285
20
2.3
20
85
0
58
34
4
4
57
1.38
5117403--5117431
11
2.7
11
94
5
51
55
6
0
37
1.27
5118144--5118201
25
2.2
28
84
9
77
65
0
5
29
1.14
5120212--5120330
30
4.2
27
69
21
82
20
5
52
21
1.68
5120212--5120313
30
3.5
29
77
16
95
22
6
50
20
1.72
5128079--5128296
46
4.7
46
80
5
260
23
20
27
28
1.99
5131622--5131731
51
2.2
51
93
0
184
32
14
22
30
1.94
5131707--5131732
7
3.7
7
100
0
52
42
11
30
15
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5135405--5135472
33
2.1
32
94
2
118
57
7
10
25
1.57
5135798--5135866
24
3.0
23
75
21
58
57
0
4
37
1.18
5136063--5136112
19
2.7
20
84
9
61
68
2
6
24
1.23
5136108--5136167
12
4.9
12
73
16
52
61
1
3
33
1.22
5137830--5138455
206
3.0
206
91
1
972
26
22
19
32
1.97
5152008--5152075
33
2.1
32
91
2
109
58
7
8
25
1.54
5152399--5152467
23
3.0
23
75
21
58
56
0
5
37
1.23
5152643--5152696
18
2.9
18
76
17
58
57
0
3
38
1.17
5152673--5152804
11
12.6
10
69
18
56
63
2
3
30
1.24
5152718--5152768
19
2.7
20
85
8
63
66
1
5
25
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295