Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  35  of  295  ( 35319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Score
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
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Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1
53
1.21
9956846--9956917
24
3.1
24
76
4
67
45
1
1
51
1.18
9957357--9957412
16
3.5
16
80
0
58
48
5
14
32
1.66
9957576--9957646
37
1.9
37
88
11
110
49
1
1
47
1.18
9957603--9957680
26
3.1
25
74
15
79
50
1
0
48
1.09
9957618--9957662
14
3.0
15
90
6
65
60
0
0
40
0.97
9957591--9957705
51
2.2
52
83
10
148
49
1
0
48
1.11
9957592--9957705
52
2.2
52
81
10
144
50
1
0
48
1.11
9957717--9957814
10
10.1
10
68
17
64
44
1
1
53
1.14
9957683--9957778
44
2.2
45
84
1
122
40
0
2
57
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9959508--9959536
14
2.1
14
93
6
51
51
6
10
31
1.62
9961181--9961230
21
2.5
20
80
3
55
16
30
26
28
1.96
9967727--9967932
63
3.2
64
81
7
208
27
24
25
23
2.00
9969262--9969286
13
1.9
13
100
0
50
48
16
4
32
1.64
9969987--9970022
6
6.0
6
96
0
63
33
0
2
63
1.08
9970069--9970111
19
2.2
19
83
8
50
55
23
0
20
1.43
9970956--9971006
27
1.9
27
92
4
86
50
0
0
49
1.00
9971032--9971127
9
10.3
9
70
18
72
52
0
3
44
1.17
9971031--9971134
38
2.8
35
78
18
113
51
0
2
45
1.16
9971058--9971106
11
4.6
11
75
14
50
48
0
6
44
1.27
9971025--9971114
20
4.5
21
76
18
84
52
0
3
44
1.17
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25
2.0
27
84
7
70
25
15
13
45
1.83
9974153--9974185
10
3.0
11
91
8
50
18
0
3
78
0.87
9986116--9986164
21
2.5
20
77
16
57
65
0
4
30
1.11
9986350--9986381
16
1.9
17
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6
57
50
0
0
50
1.00
9986665--9986698
17
2.0
17
94
0
59
55
0
0
44
0.99
9986792--9986833
16
2.6
16
81
7
50
42
0
0
57
0.99
9987601--9987659
25
2.4
25
78
10
68
23
3
6
66
1.32
9989535--9989573
18
2.2
18
86
9
53
41
15
7
35
1.76
9990120--9990145
3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
9995317--9995369
24
2.2
25
82
3
63
26
11
3
58
1.49
9995454--9995524
26
2.5
29
78
17
78
56
2
1
39
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9995510--9995572
21
3.0
22
68
15
60
53
4
1
39
1.31
9995495--9995572
42
1.9
41
85
12
108
55
3
1
39
1.26
9997979--9998010
16
2.0
16
100
0
64
75
0
0
25
0.81
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33
2.0
34
94
2
120
41
11
0
47
1.40
10001059--10001098
20
2.0
20
95
0
71
65
2
5
27
1.27
10002773--10002849
39
2.0
39
89
0
118
42
12
18
25
1.86
10010795--10010839
23
2.0
23
90
0
72
48
11
0
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18
100
0
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22
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22
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3.2
18
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9
53
33
17
10
38
1.84
10028651--10028723
23
3.2
23
86
3
103
32
24
21
20
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          289   290   291   292   293   294   295