Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  54  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15616884--15617013
47
2.8
45
77
12
129
23
29
18
29
1.98
15622567--15622611
23
2.0
23
81
0
54
62
28
2
6
1.33
15630235--15630292
30
2.0
30
82
3
73
44
10
8
36
1.69
15639441--15639613
43
4.0
43
74
12
167
31
27
18
23
1.97
15647002--15647059
30
2.0
30
82
3
73
43
12
8
36
1.73
15653233--15653380
64
2.2
68
78
10
160
31
16
29
22
1.96
15653257--15653440
67
2.8
64
77
8
194
28
16
30
23
1.96
15662681--15662809
50
2.6
50
83
3
152
25
17
28
27
1.98
15662789--15662825
14
2.6
14
95
0
65
24
24
27
24
2.00
15662739--15662867
64
2.0
64
84
1
170
24
17
28
29
1.97
15670768--15670831
29
2.1
31
83
11
80
35
0
3
60
1.12
15670809--15670833
8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
15678078--15678229
75
2.0
75
100
0
304
35
15
19
29
1.92
15680246--15680418
83
2.1
83
95
0
310
35
20
12
31
1.90
15688655--15688705
26
2.0
24
82
17
59
39
13
7
39
1.74
15692011--15692037
13
2.1
13
100
0
54
85
0
0
14
0.61
15693327--15693366
20
2.0
20
95
0
71
57
5
7
30
1.48
15705191--15705366
48
3.7
48
88
4
257
26
28
17
27
1.97
15707202--15707239
17
2.2
17
90
0
58
36
18
21
23
1.95
15708735--15708827
19
4.9
19
70
19
70
39
2
2
55
1.24
15708735--15708827
36
2.5
36
80
13
91
39
2
2
55
1.24
15710719--15710754
12
3.0
12
100
0
72
41
8
8
41
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15713153--15713188
17
2.1
18
90
10
58
38
0
11
50
1.38
15718203--15718257
27
2.0
27
100
0
110
32
14
14
38
1.87
15720158--15720197
20
2.0
21
85
5
55
2
15
5
77
1.04
15724247--15724500
24
10.4
23
70
14
136
32
5
3
58
1.39
15724476--15724541
27
2.4
28
80
10
73
30
3
6
60
1.36
15724656--15724750
48
2.0
48
83
6
120
28
7
2
62
1.34
15724710--15724779
36
1.9
36
91
0
113
28
1
2
67
1.14
15724646--15724757
25
4.7
23
72
14
77
26
6
3
63
1.35
15724764--15724814
28
1.9
26
84
11
68
25
5
3
64
1.33
15724811--15724941
24
5.1
24
66
20
68
26
3
6
62
1.38
15724728--15724853
66
1.9
64
84
6
164
25
4
4
65
1.32
15724811--15724885
25
3.0
22
73
22
53
25
5
6
62
1.41
15725272--15725311
20
2.0
20
100
0
80
35
20
25
20
1.96
15726912--15726981
25
2.8
25
89
2
106
22
24
10
42
1.84
15728729--15728793
32
2.0
32
96
0
121
29
10
33
26
1.90
15731879--15732086
44
4.7
44
77
5
170
28
18
25
27
1.98
15730984--15731905
392
2.3
393
87
1
1348
28
20
23
27
1.99
15730961--15731905
131
7.2
131
89
1
1340
28
20
23
27
1.99
15731877--15732082
88
2.3
88
80
5
220
28
18
25
28
1.98
15733540--15733773
24
9.4
25
71
9
156
32
4
3
59
1.36
15733558--15733621
27
2.3
27
84
7
76
32
3
1
62
1.20
15733988--15734057
36
1.9
36
91
0
113
28
1
2
67
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15734041--15734092
28
2.0
26
85
11
70
30
3
1
63
1.23
15734089--15734148
24
2.5
24
81
8
68
30
1
6
61
1.31
15736705--15736745
21
2.0
21
85
9
57
36
2
17
43
1.62
15739066--15739103
5
7.6
5
100
0
76
18
0
0
81
0.69
15743526--15743557
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
15743526--15743556
9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
15745963--15746011
19
2.6
19
100
0
98
40
16
30
12
1.85
15746248--15746409
54
3.0
54
87
4
204
20
25
19
34
1.96
15746251--15746409
81
2.0
80
81
8
189
20
25
19
34
1.96
15746251--15746409
27
5.9
27
79
10
164
20
25
19
34
1.96
15752525--15752693
46
3.7
46
78
10
191
23
20
27
29
1.98
15752518--15752688
93
1.8
93
91
0
279
22
21
27
28
1.99
15763970--15764328
47
7.5
47
92
3
565
29
29
8
33
1.86
15763970--15764328
96
3.8
96
93
2
582
29
29
8
33
1.86
15763970--15764328
143
2.5
144
93
1
589
29
29
8
33
1.86
15767414--15767476
24
2.6
24
79
0
72
57
22
6
14
1.60
15767436--15767484
24
2.0
24
88
0
71
59
20
6
14
1.56
15768451--15768488
19
2.0
19
85
10
51
50
0
0
50
1.00
15769983--15770024
21
2.0
21
90
4
66
26
2
0
71
0.98
15770063--15770115
26
2.0
26
82
14
63
54
0
3
41
1.18
15770107--15770149
19
2.4
17
78
14
50
37
0
2
60
1.10
15770311--15770427
54
2.2
54
89
4
182
53
0
4
41
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15774428--15774706
140
2.0
140
99
0
549
26
17
13
42
1.86
15781128--15781180
9
5.8
9
76
12
54
3
9
1
84
0.81
15781193--15781226
17
1.9
18
88
5
52
17
2
2
76
1.04
15781251--15781305
20
2.6
20
83
11
65
43
0
3
52
1.18
15781268--15781396
21
6.0
21
75
13
86
40
0
0
58
1.09
15781268--15781394
22
5.9
22
76
9
93
39
0
0
59
1.09
15781344--15781409
21
3.0
22
86
6
89
45
0
0
54
0.99
15781311--15781418
52
2.1
53
82
8
132
42
0
0
56
1.05
15781602--15781645
19
2.2
21
92
8
74
45
0
9
45
1.35
15781644--15781699
20
2.8
20
75
0
67
62
0
1
35
1.06
15782133--15782211
40
2.0
41
89
2
124
35
7
2
54
1.42
15782286--15782433
71
2.1
72
87
6
221
50
3
2
43
1.33
15782524--15782578
17
3.0
19
71
10
60
56
1
3
38
1.28
15788234--15788326
25
3.5
24
72
21
71
55
3
1
39
1.23
15788366--15788427
21
3.0
20
78
21
65
54
0
0
45
0.99
15788369--15788427
22
2.8
21
85
12
84
57
0
0
42
0.98
15788375--15788467
20
4.9
20
74
19
85
61
0
1
37
1.03
15788191--15788441
114
2.2
114
82
9
291
54
3
3
39
1.33
15788390--15788494
33
3.2
31
85
12
138
60
0
0
38
1.03
15788393--15788481
10
7.7
12
69
23
50
61
0
1
37
1.03
15788375--15788496
21
5.7
21
76
13
81
59
0
0
39
1.03
15788375--15788530
23
7.1
22
72
19
71
57
1
0
40
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15788547--15788580
5
6.8
5
87
12
52
79
0
2
17
0.86
15793504--15793653
72
2.1
72
100
0
300
42
10
16
30
1.82
15797461--15797581
34
3.6
34
80
2
127
34
10
12
42
1.77
15813385--15813414
12
2.5
12
94
0
51
30
0
0
70
0.88
15813394--15813455
30
2.1
30
93
6
108
29
3
8
59
1.42
15813536--15813575
18
2.2
18
86
8
55
20
0
12
67
1.22
15813577--15813609
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
15816651--15816685
6
6.0
6
93
3
54
17
11
0
71
1.14
15817195--15817245
23
2.2
23
82
0
57
41
9
3
45
1.56
15818398--15818464
5
14.4
5
83
10
63
70
0
29
0
0.88
15818387--15818466
18
4.6
17
80
12
74
68
0
31
0
0.90
15821693--15821726
6
5.7
6
85
0
50
14
35
29
20
1.93
15821694--15821731
18
2.1
18
100
0
76
15
34
26
23
1.95
15822599--15822648
19
2.6
20
84
6
59
52
4
8
36
1.50
15822721--15822760
19
2.1
19
90
0
62
85
0
5
10
0.75
15824390--15824452
29
2.2
29
91
0
99
17
38
25
19
1.93
15829494--15829540
23
1.9
25
83
12
62
14
23
6
55
1.63
15830606--15830642
16
2.3
16
86
13
58
40
0
0
59
0.97
15833670--15833726
30
1.9
29
85
3
78
45
1
5
47
1.35
15837754--15837785
6
5.3
6
92
0
55
31
0
15
53
1.43
15837754--15837792
18
2.2
18
85
0
51
33
0
15
51
1.44
15839897--15839925
14
2.0
15
93
6
51
51
0
6
41
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15841118--15841142
8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
15843040--15843195
41
3.8
41
89
6
226
28
21
22
27
1.99
15843410--15843507
33
2.9
33
84
7
108
30
10
22
36
1.87
15850669--15850824
41
3.8
41
89
6
226
28
21
22
27
1.99
15851039--15851136
33
2.9
33
84
7
108
30
10
22
36
1.87
15858605--15858633
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
15864237--15864297
26
2.4
26
83
5
81
45
11
13
29
1.78
15864237--15864293
24
2.3
24
84
6
69
47
12
14
26
1.79
15866566--15866638
37
2.0
37
97
0
137
45
23
9
21
1.81
15874161--15874199
20
1.9
21
94
5
71
64
0
0
35
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295