Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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This is table  197  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67261049--67261112
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2.2
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0
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.2
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1.8
190
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26
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275
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2.1
17
100
0
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2.7
11
94
0
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6
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50
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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21
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1.97
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21
25
19
32
1.97
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1.9
56
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133
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23
20
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1.97
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19
2.3
20
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3
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8
2
54
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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1.97
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20
17
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140
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20
17
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39
1.55
67474322--67474494
46
3.7
46
79
10
208
21
20
27
29
1.98
67474319--67474489
93
1.8
93
93
0
297
21
21
28
28
1.98
67474718--67474755
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
67479099--67479137
20
2.0
20
94
0
69
41
5
28
25
1.77
67486925--67486960
12
2.6
15
83
16
51
16
5
5
72
1.23
67495970--67496147
52
3.5
50
87
4
232
26
30
14
27
1.95
67496000--67496147
52
2.9
51
91
4
237
28
29
12
29
1.93
67498914--67499089
46
3.8
46
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12
216
21
20
28
29
1.98
67498911--67499081
93
1.8
93
94
0
306
21
21
29
28
1.98
67502282--67502308
14
1.9
14
100
0
54
51
11
14
22
1.73
67509297--67509502
40
5.2
40
90
1
317
23
21
26
28
1.99
67511430--67511587
24
6.6
24
94
0
262
39
28
12
18
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67515949--67515974
12
2.2
12
100
0
52
0
30
15
53
1.42
67524585--67524797
46
4.7
44
75
14
134
25
30
17
26
1.97
67524530--67524797
94
2.9
91
74
15
235
24
30
17
27
1.97
67531128--67531176
25
2.0
25
95
0
89
59
6
14
20
1.56
67531987--67532030
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
67536331--67536374
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
67539738--67539990
47
5.4
47
70
13
164
24
29
18
27
1.98
67539775--67539945
91
1.8
94
81
9
217
23
30
18
27
1.98
67541471--67541522
25
2.1
25
100
0
104
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15
40
1.88
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11
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11
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12
53
47
0
0
52
1.00
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14
2.7
15
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8
53
52
2
2
42
1.29
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14
1.9
14
100
0
54
37
14
18
29
1.91
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15
2.1
15
100
0
64
31
28
0
40
1.57
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24
2.1
24
100
0
102
39
3
17
39
1.68
67553165--67553194
14
2.1
14
100
0
60
60
0
6
33
1.23
67553319--67553368
24
2.1
24
92
0
82
38
20
28
14
1.91
67557632--67557678
19
2.5
19
77
16
53
46
0
10
42
1.38
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12
2.3
13
94
5
51
82
3
6
6
0.93
67561354--67561461
47
2.3
47
90
0
162
25
10
13
50
1.74
67564780--67564945
57
2.9
57
78
5
174
34
16
24
24
1.96
67564960--67565026
31
2.3
31
80
12
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29
8
29
31
1.88
67565280--67565319
20
2.0
20
100
0
80
40
20
25
15
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67566597--67566692
33
2.9
33
85
0
111
15
10
32
41
1.81
67573586--67573623
14
2.9
13
81
11
51
18
13
10
57
1.63
67576419--67576443
12
2.1
12
100
0
50
24
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0
60
1.36
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16
2.2
16
95
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63
34
17
14
34
1.90
67600668--67600873
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5.1
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196
26
27
20
26
1.99
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2.3
78
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14
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25
26
20
27
1.99
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39
5.6
38
80
10
194
26
27
20
25
1.99
67608822--67609027
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247
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27
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24
1.99
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6.6
40
95
0
474
22
28
20
29
1.98
67621354--67621617
40
6.6
40
95
0
474
21
28
20
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          289   290   291   292   293   294   295