Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  21  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5663974--5664112
44
3.2
44
67
8
138
28
23
21
26
1.99
5663835--5664170
88
3.9
88
88
3
439
24
22
22
30
1.99
5664018--5664156
44
3.2
44
66
15
124
24
21
25
28
1.99
5663835--5664170
174
1.9
173
83
4
433
24
22
22
30
1.99
5668377--5668430
19
2.8
20
77
11
58
42
12
18
25
1.86
5670698--5670764
3
21.7
3
76
8
55
64
5
2
26
1.31
5679956--5680015
28
2.1
28
96
0
111
35
40
6
18
1.77
5682779--5682836
3
20.7
3
73
19
54
32
1
0
65
1.03
5682798--5682834
14
2.7
14
87
4
58
29
2
0
67
1.04
5682779--5682878
11
9.0
11
69
20
57
33
3
1
63
1.17
5683470--5683542
30
2.4
30
86
4
103
21
9
9
58
1.58
5686278--5686392
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
5686278--5686392
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
5687998--5688105
25
4.2
25
95
3
180
36
25
4
34
1.77
5687998--5688105
51
2.1
51
94
0
189
36
25
4
34
1.77
5691989--5692072
27
3.3
25
83
12
100
40
22
22
14
1.90
5692000--5692094
27
3.6
27
87
4
122
35
25
23
15
1.94
5693704--5693785
25
3.2
25
91
6
130
36
24
4
34
1.77
5722200--5722235
19
1.9
19
94
5
65
55
2
2
38
1.29
5727163--5727237
19
3.7
19
68
22
55
33
6
4
56
1.44
5727652--5727706
23
2.5
22
77
11
58
58
9
5
27
1.51
5729872--5729953
34
2.5
33
81
2
101
23
23
24
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5729860--5729953
17
5.5
17
68
7
57
21
23
25
29
1.99
5729945--5730030
32
2.6
33
83
1
102
26
25
18
29
1.98
5729945--5730037
33
2.8
33
83
1
107
27
23
18
30
1.98
5732042--5732117
10
7.7
10
73
16
52
27
3
2
65
1.23
5732042--5732117
20
3.8
20
76
11
68
27
3
2
65
1.23
5732270--5732310
21
1.9
21
85
5
55
21
7
4
65
1.37
5732321--5732410
25
3.5
25
72
14
76
32
6
0
61
1.22
5732321--5732360
17
2.3
18
91
4
64
32
2
0
65
1.06
5732321--5732413
17
5.5
17
68
16
59
33
6
0
60
1.22
5732329--5732410
26
3.2
26
73
22
75
31
7
0
60
1.24
5732253--5732450
9
21.7
9
66
19
63
29
7
2
61
1.33
5732871--5732904
3
11.3
3
100
0
68
64
0
0
35
0.94
5734719--5734950
39
5.9
39
83
0
284
17
17
31
33
1.94
5734720--5734944
117
1.9
117
87
1
326
17
17
30
33
1.94
5740013--5740095
36
2.4
34
78
11
96
57
10
6
25
1.55
5746152--5746205
23
2.2
24
78
18
58
29
3
9
57
1.47
5751220--5751254
17
1.9
19
88
11
56
65
11
2
20
1.37
5755605--5755638
10
3.4
10
87
0
50
11
2
0
85
0.71
5762465--5762547
37
2.2
37
95
2
148
33
1
42
22
1.62
5762838--5762906
23
3.0
23
89
2
93
4
13
28
53
1.58
5766920--5766952
10
3.2
10
95
4
57
42
18
0
39
1.50
5767144--5767173
5
6.0
5
92
0
51
16
0
3
80
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5767144--5767172
15
1.9
15
100
0
58
13
0
3
82
0.79
5768898--5768927
15
2.0
15
93
0
51
50
6
10
33
1.62
5771173--5771229
21
2.7
21
83
0
69
50
29
12
7
1.66
5774954--5774988
17
2.1
17
94
0
61
34
14
5
45
1.68
5775342--5775382
2
20.5
2
100
0
82
0
48
0
51
1.00
5778292--5778331
11
3.6
11
79
0
53
20
15
7
57
1.61
5778546--5778573
11
2.5
11
100
0
56
67
0
0
32
0.91
5787254--5787279
2
13.0
2
100
0
52
0
50
0
50
1.00
5789181--5789229
21
2.3
21
96
0
89
48
12
18
20
1.79
5793596--5793645
13
3.7
13
78
7
55
40
0
2
58
1.10
5801169--5801233
28
2.3
28
91
0
103
32
27
7
32
1.85
5801339--5801428
28
3.2
28
87
4
128
21
23
22
33
1.97
5801881--5801921
18
2.3
18
86
0
55
24
2
4
68
1.22
5803950--5803985
18
2.0
18
94
0
63
19
5
13
61
1.52
5804664--5804702
19
2.1
19
90
9
62
20
0
7
71
1.10
5804667--5804724
26
2.2
26
78
6
64
24
1
5
68
1.19
5804700--5804741
18
2.3
18
84
8
50
26
4
7
61
1.42
5804860--5804927
27
2.5
28
85
2
93
58
7
13
20
1.58
5812853--5812894
19
2.1
21
78
13
52
61
2
0
35
1.09
5824319--5824459
42
3.3
43
80
7
135
31
23
17
26
1.97
5830437--5830492
20
2.8
19
79
17
60
66
3
0
30
1.09
5830453--5830520
26
2.5
27
77
20
79
61
4
0
33
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5831355--5831603
10
25.7
10
67
18
64
30
1
4
62
1.25
5831351--5831387
19
2.0
18
89
5
56
29
0
8
62
1.24
5831500--5831536
19
1.9
19
94
0
65
37
2
2
56
1.28
5831484--5831548
19
3.3
20
78
8
62
38
1
1
58
1.17
5831554--5831600
18
2.7
18
86
3
60
29
2
2
65
1.15
5833659--5833728
27
2.6
26
88
6
104
42
1
8
47
1.43
5834188--5834378
92
2.1
93
90
1
303
34
8
18
38
1.82
5837402--5837519
25
4.8
25
74
15
88
31
6
5
55
1.50
5837404--5837519
23
4.8
24
73
17
82
31
6
6
56
1.50
5837498--5837536
19
2.1
19
90
0
60
30
15
5
48
1.66
5837685--5837777
24
3.8
24
71
12
73
35
8
3
52
1.48
5837919--5838061
22
6.0
22
70
20
101
34
2
4
58
1.34
5837919--5837971
25
2.3
22
83
9
61
32
3
3
60
1.32
5841882--5841926
22
2.0
22
95
0
81
28
20
4
46
1.69
5850219--5850621
76
5.2
73
82
10
450
29
17
20
32
1.96
5850289--5850672
161
2.3
161
87
4
529
29
17
19
33
1.95
5850385--5850672
85
3.5
84
81
13
344
28
18
20
32
1.96
5852357--5852422
12
6.2
10
75
16
53
27
3
4
65
1.27
5852550--5852665
24
4.8
25
73
17
86
32
6
5
55
1.49
5852644--5852682
19
2.1
19
90
0
60
30
15
5
48
1.66
5852748--5852776
2
15.0
2
92
7
51
48
0
0
51
1.00
5853066--5853208
22
6.0
22
68
20
92
33
2
5
58
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5853066--5853118
25
2.3
22
83
9
61
32
3
3
60
1.32
5858415--5858465
26
2.0
26
96
0
93
17
11
23
47
1.81
5862783--5864448
120
13.8
120
98
0
3089
43
2
5
47
1.40
5863114--5863148
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
5863354--5863388
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
5863594--5863628
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
5863714--5863748
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
5863834--5863868
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
5863954--5863988
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
5864074--5864108
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
5864314--5864348
18
2.0
17
94
5
61
42
0
0
57
0.99
5864314--5864371
16
3.6
16
80
15
50
43
0
1
55
1.10
5864319--5864369
18
2.9
18
83
11
54
45
0
1
52
1.12
5864743--5864811
16
4.2
16
90
3
111
37
36
1
24
1.65
5864743--5864811
33
2.1
32
91
2
111
37
36
1
24
1.65
5865941--5866133
64
3.0
64
88
0
287
33
17
12
36
1.88
5866310--5866431
44
2.7
45
78
3
131
28
20
25
25
1.99
5866498--5866777
146
1.9
145
86
3
393
31
16
23
28
1.96
5866479--5867268
411
1.9
410
86
4
1137
32
16
23
27
1.96
5867101--5867200
44
2.2
45
77
11
116
32
15
22
31
1.94
5866908--5867189
147
1.9
147
89
0
438
33
15
23
28
1.95
5867054--5867443
176
2.2
174
83
5
455
31
16
22
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5885213--5885273
30
2.0
31
84
6
81
42
0
9
47
1.36
5889709--5889751
19
2.2
20
84
12
54
6
2
32
58
1.38
5898936--5899209
46
6.0
46
88
0
343
40
14
24
21
1.90
5898937--5899008
21
3.2
21
66
27
58
37
11
25
26
1.89
5898936--5899204
138
1.9
138
89
0
412
40
14
24
20
1.90
5912955--5913010
21
2.7
21
85
0
67
28
33
8
28
1.87
5913977--5914035
25
2.4
24
81
13
68
62
0
0
37
0.95
5917414--5917471
26
2.3
26
79
8
66
36
8
3
51
1.49
5922421--5922449
3
9.7
3
100
0
58
68
0
0
31
0.89
5930504--5930561
30
1.9
30
100
0
116
24
12
31
32
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295