Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A02
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100057689

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  42  of  295  ( 35319 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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161
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0
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18
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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2
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1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
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127
33
26
14
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12218356--12218432
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26
1.74
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19
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2
2
64
1.21
12257673--12257709
19
1.9
19
88
0
56
35
2
2
59
1.26
12257625--12257717
44
2.1
44
82
4
107
33
3
2
61
1.24
12257925--12257953
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
12280833--12280917
31
2.8
30
77
5
91
41
11
10
36
1.76
12281115--12281161
20
2.3
20
81
3
58
38
4
0
57
1.18
12281104--12281160
21
2.8
20
76
5
60
33
3
3
59
1.31
12283365--12283416
15
3.2
15
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19
50
46
0
1
51
1.12
12283378--12283414
19
1.9
19
88
0
56
51
0
2
45
1.15
12283454--12283484
15
2.0
16
93
6
55
38
3
0
58
1.15
12289621--12289655
18
2.0
18
94
5
63
17
40
25
17
1.90
12290283--12290380
49
2.0
49
100
0
196
55
8
24
12
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12300721--12300753
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1.9
17
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11
50
36
6
9
48
1.60
12306752--12306790
18
2.2
18
85
0
51
17
7
7
66
1.40
12309631--12309664
15
2.3
15
94
0
59
58
5
14
20
1.57
12312481--12312585
42
2.6
40
80
8
113
31
12
28
27
1.93
12312508--12312618
41
2.7
42
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1
125
29
13
28
27
1.94
12313403--12313483
7
11.6
7
77
12
53
17
0
29
53
1.44
12313337--12313489
21
7.2
20
70
11
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18
1
28
51
1.54
12313394--12313489
14
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14
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17
0
30
52
1.45
12313713--12313747
6
6.0
6
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3
54
0
2
14
82
0.77
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1.9
41
83
2
102
32
15
27
24
1.95
12313876--12313983
41
2.7
40
76
4
101
34
15
26
23
1.95
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23
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23
75
11
832
32
4
23
40
1.74
12315205--12316202
91
10.9
92
73
14
346
32
4
23
39
1.74
12315195--12316301
137
8.0
134
76
11
797
31
4
23
40
1.74
12315297--12316210
183
5.0
181
80
8
854
32
4
23
39
1.74
12315192--12316210
160
6.3
165
74
12
555
32
4
23
40
1.74
12315192--12316301
114
9.7
115
77
10
765
32
4
23
40
1.74
12316964--12317253
43
6.8
43
80
3
273
26
16
25
31
1.96
12320707--12320844
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2.0
69
95
0
249
40
13
16
29
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12322618--12322717
27
3.6
26
76
9
92
42
35
4
19
1.70
12323212--12323252
17
2.5
17
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14
50
34
17
0
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1.47
12323653--12323688
18
2.0
18
88
0
54
0
19
13
66
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12323662--12323697
18
2.1
18
89
5
56
2
13
8
75
1.15
12324457--12324496
19
2.1
19
86
9
55
50
0
2
47
1.14
12325858--12325909
17
3.1
17
82
0
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34
3
1
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1.27
12326828--12326886
17
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25
50
37
25
15
22
1.93
12326878--12326913
17
2.2
16
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9
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22
19
1.98
12332090--12332122
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3
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13
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0
0
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2
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0
51
46
0
3
50
1.18
12342250--12342320
3
23.3
3
72
21
51
66
1
4
28
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295